MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187120	CGA	2	6	14	19	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187120	GCG	2	6	22	27	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187120	GAT	2	6	48	53	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187120	GCG	2	6	55	60	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187120	ATG	2	6	61	66	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187120	TTA	2	6	91	96	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187120	TAA	2	6	5236	5241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187120	TTA	3	9	5249	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187120	TAA	2	6	5323	5328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187120	CCA	2	6	5369	5374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187120	CAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187120	TTG	2	6	10551	10556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187120	TAC	2	6	12232	12237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187120	GCA	2	6	12282	12287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187120	TTG	2	6	12387	12392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187120	GGC	2	6	12419	12424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187120	AAC	2	6	12428	12433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187120	ATC	2	6	12523	12528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187120	GCG	3	9	13957	13965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187120	CCG	2	6	13999	14004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NT_187120	CTT	2	6	14044	14049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187120	TCG	2	6	14054	14059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187120	CGG	2	6	14165	14170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187120	TAC	2	6	16072	16077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187120	ACA	2	6	18618	18623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187120	TAA	2	6	19438	19443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187120	TGG	2	6	19516	19521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187120	GCC	2	6	21803	21808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NT_187120	ACA	2	6	23861	23866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187120	GCC	2	6	23937	23942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NT_187120	ATG	2	6	25680	25685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187120	ATT	2	6	25696	25701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187120	CAT	2	6	25703	25708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187120	CGT	2	6	25724	25729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187120	CAA	2	6	25873	25878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187120	ATA	2	6	25895	25900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187120	CCG	2	6	25902	25907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NT_187120	GGC	2	6	27680	27685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187120	GAA	2	6	27711	27716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187120	CAA	2	6	29831	29836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187120	CAG	2	6	29927	29932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187120	ATT	2	6	29961	29966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187120	AAG	2	6	30511	30516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187120	CTT	2	6	32961	32966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187120	TTA	2	6	33085	33090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187120	TGT	2	6	33263	33268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187120	ATT	2	6	33271	33276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187120	GCC	2	6	33313	33318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187120	CCA	2	6	38124	38129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NT_187120	GAT	2	6	38869	38874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187120	TAT	2	6	38880	38885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187120	CTT	3	9	39611	39619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187120	AAC	2	6	39799	39804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187120	GTC	2	6	39813	39818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187120	GGC	2	6	41184	41189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187120	CAT	2	6	41267	41272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187120	TAA	2	6	45798	45803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187120	AAC	2	6	45804	45809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187120	TCC	3	9	45844	45852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NT_187120	AGG	2	6	45872	45877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187120	CGC	2	6	45904	45909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NT_187120	GAT	2	6	46128	46133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187120	ATT	2	6	46143	46148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187120	CAA	2	6	52106	52111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187120	CCA	2	6	52250	52255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NT_187120	GAT	2	6	52297	52302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187120	ATT	2	6	53975	53980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187120	AAT	2	6	56440	56445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187120	AGA	2	6	57389	57394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187120	TCG	2	6	57412	57417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187120	TAT	2	6	57908	57913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187120	CGT	2	6	61677	61682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187120	CTT	2	6	71128	71133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187120	GCA	2	6	71147	71152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187120	CGT	2	6	71171	71176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187120	CGT	2	6	72844	72849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187120	CAA	2	6	72964	72969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187120	ACG	2	6	74921	74926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187120	CTC	2	6	76879	76884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NT_187120	GAT	2	6	77981	77986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187120	GAG	2	6	78011	78016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187120	GAG	2	6	78159	78164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187120	AAT	3	9	78317	78325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187120	CTT	2	6	78348	78353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187120	TTA	2	6	79030	79035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187120	CAA	2	6	79137	79142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187120	CTC	2	6	79147	79152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NT_187120	GTT	2	6	85021	85026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187120	TCA	3	9	85085	85093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187120	GAG	2	6	85133	85138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187120	ATT	2	6	90728	90733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187120	GCG	2	6	90741	90746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187120	ACA	2	6	91411	91416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187120	GCG	2	6	91481	91486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187120	TCT	2	6	95240	95245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187120	GCA	2	6	96470	96475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187120	ATA	2	6	96484	96489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187120	ATA	2	6	96527	96532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187120	AAT	2	6	96603	96608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187120	TGC	2	6	96630	96635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187120	GTT	2	6	96674	96679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187120	TAA	2	6	96687	96692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187120	ATT	2	6	98477	98482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187120	GTT	2	6	98486	98491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187120	ATT	2	6	98530	98535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187120	AGC	2	6	98555	98560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187120	TAT	2	6	98588	98593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187120	CAA	2	6	99681	99686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187120	ACA	2	6	99821	99826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187120	CTG	2	6	102138	102143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187120	TGA	2	6	103128	103133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187120	TGC	2	6	104066	104071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187120	AAT	2	6	104539	104544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187120	ATA	2	6	105223	105228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187120	TCC	2	6	105261	105266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NT_187120	ATC	2	6	105283	105288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187120	GGA	2	6	105293	105298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187120	TCT	2	6	107502	107507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187120	GCG	2	6	107516	107521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187120	ATT	2	6	107565	107570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187120	ATT	2	6	107580	107585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187120	TAT	2	6	109725	109730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187120	GCG	2	6	109731	109736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187120	CAA	2	6	109765	109770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187120	GAA	2	6	110511	110516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187120	CAA	2	6	112415	112420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187120	CTT	2	6	113504	113509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187120	GGC	2	6	114130	114135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187120	GCC	2	6	114672	114677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NT_187120	AAT	2	6	114685	114690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187120	CCG	2	6	119630	119635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NT_187120	TGT	2	6	119643	119648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187120	CCG	2	6	119671	119676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NT_187120	CGC	2	6	121296	121301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NT_187120	GCG	2	6	122929	122934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187120	TCC	2	6	123331	123336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NT_187120	TAC	2	6	123411	123416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187120	CGG	2	6	123652	123657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187120	GGC	2	6	124166	124171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187120	CAA	3	9	124235	124243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187120	TTC	2	6	124278	124283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NT_187120	CAT	2	6	124297	124302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NT_187120	TAA	2	6	124380	124385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NT_187120	ATG	2	6	128933	128938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NT_187120	TAT	2	6	137604	137609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NT_187120	TTG	2	6	330606	330611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
407	NT_187120	TCT	2	6	330650	330655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
408	NT_187120	AGG	2	6	331558	331563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
409	NT_187120	ATG	2	6	331630	331635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
410	NT_187120	CGT	2	6	331660	331665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
411	NT_187120	GGC	2	6	331717	331722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
412	NT_187120	CAT	2	6	332314	332319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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416	NT_187120	CGG	2	6	343977	343982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NT_187120	GTG	2	6	344588	344593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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429	NT_187120	GCG	2	6	353757	353762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
430	NT_187120	TTC	2	6	355490	355495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NT_187120	AAG	2	6	356120	356125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NT_187120	CAT	2	6	356667	356672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NT_187120	TCA	2	6	356897	356902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NT_187120	TCA	2	6	358525	358530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.