MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187115	GGA	2	6	86	91	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187115	GGA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187115	CAC	2	6	382	387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NT_187115	GAA	2	6	408	413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187115	TCG	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187115	TGA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187115	GCC	2	6	577	582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187115	CAA	2	6	598	603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187115	CAT	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187115	CGC	2	6	1070	1075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187115	GCG	2	6	1086	1091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187115	GCC	2	6	3776	3781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NT_187115	TCG	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187115	GGC	2	6	4554	4559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187115	CCA	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NT_187115	TGA	2	6	4586	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187115	CAG	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187115	GGC	2	6	6506	6511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187115	GTC	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187115	CGG	2	6	6574	6579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187115	AGA	2	6	6630	6635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187115	ATA	3	9	6673	6681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187115	CGC	2	6	7846	7851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NT_187115	CGC	2	6	10787	10792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187115	AAT	2	6	11235	11240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187115	GGC	2	6	11255	11260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187115	CAT	2	6	14672	14677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187115	AAC	2	6	14773	14778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187115	GGT	2	6	14804	14809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187115	GCC	2	6	17461	17466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NT_187115	CAT	2	6	19731	19736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187115	GCC	2	6	19813	19818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NT_187115	GAT	2	6	20429	20434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187115	ATT	2	6	20489	20494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187115	GTG	2	6	20556	20561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187115	GAC	2	6	29439	29444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187115	TCG	2	6	29459	29464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187115	GCA	2	6	33237	33242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187115	GAT	2	6	35552	35557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187115	TCG	2	6	35999	36004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187115	ATT	2	6	36022	36027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187115	GAT	2	6	36076	36081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187115	TTG	2	6	36094	36099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187115	ATA	2	6	39578	39583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187115	AGT	2	6	39587	39592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187115	ATC	2	6	40545	40550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187115	GAT	2	6	40626	40631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187115	TAC	2	6	40645	40650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187115	ATA	2	6	40667	40672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187115	TTC	2	6	41512	41517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187115	ACT	2	6	41525	41530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187115	CTT	2	6	41548	41553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187115	TAA	2	6	41564	41569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187115	TTA	2	6	41581	41586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187115	GGC	2	6	41697	41702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187115	AAT	2	6	41836	41841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187115	AAT	2	6	42790	42795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187115	GAT	2	6	42809	42814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187115	ATT	2	6	42832	42837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187115	AAT	2	6	42844	42849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187115	CTG	2	6	43489	43494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187115	AAG	2	6	43507	43512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187115	TGA	2	6	47330	47335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187115	CAT	2	6	47407	47412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187115	ACT	2	6	47429	47434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187115	TAA	2	6	47498	47503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187115	CAA	2	6	47564	47569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187115	TTA	2	6	48542	48547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187115	ATG	2	6	48712	48717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187115	CAT	2	6	48829	48834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187115	CCT	2	6	48922	48927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NT_187115	GAT	2	6	48961	48966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187115	ATT	2	6	49030	49035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187115	ATA	2	6	49204	49209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187115	AGC	2	6	49210	49215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187115	ATT	2	6	49374	49379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187115	AAT	2	6	49418	49423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187115	ATA	2	6	49475	49480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187115	CAG	2	6	49508	49513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187115	TAT	2	6	49557	49562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187115	TAT	2	6	49590	49595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187115	TTG	2	6	54129	54134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187115	ATG	2	6	57571	57576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187115	TTA	2	6	61200	61205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187115	GGT	2	6	61215	61220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187115	ATG	2	6	63406	63411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187115	GCA	3	9	73957	73965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187115	TTC	2	6	74107	74112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187115	TCA	2	6	74596	74601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187115	ATT	2	6	74649	74654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187115	CAG	2	6	74724	74729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187115	GCT	3	9	74736	74744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187115	GTA	2	6	75852	75857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187115	TGT	2	6	75889	75894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187115	ACC	2	6	75907	75912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NT_187115	GGC	2	6	76023	76028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187115	CAT	2	6	76192	76197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187115	ATA	2	6	76270	76275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187115	TAT	2	6	76286	76291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187115	CAA	2	6	76348	76353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187115	CTT	2	6	76375	76380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187115	TGA	2	6	76420	76425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187115	CAT	2	6	76458	76463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187115	TCC	2	6	76488	76493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NT_187115	TCA	2	6	76506	76511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187115	TTG	2	6	76540	76545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187115	ACC	2	6	76643	76648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NT_187115	AGC	2	6	76662	76667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187115	TCT	3	9	76774	76782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187115	CCG	2	6	76802	76807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NT_187115	TAC	2	6	76824	76829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187115	TGA	2	6	76894	76899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187115	CTT	2	6	76976	76981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187115	TAT	2	6	77037	77042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187115	AGG	2	6	77066	77071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187115	AAT	2	6	77905	77910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187115	TGC	2	6	78155	78160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187115	CAA	2	6	78250	78255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187115	ATT	2	6	78414	78419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187115	TAA	2	6	78421	78426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187115	TCA	2	6	79286	79291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187115	TGT	2	6	79871	79876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187115	ATG	2	6	79886	79891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187115	TCC	2	6	84232	84237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NT_187115	AAT	2	6	84306	84311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187115	TTG	2	6	87747	87752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187115	GTT	2	6	91443	91448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187115	GCG	2	6	92332	92337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187115	CCG	2	6	96281	96286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NT_187115	AAC	2	6	97448	97453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187115	TCA	2	6	97563	97568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187115	CAT	3	9	101545	101553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187115	TTG	2	6	101668	101673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187115	GGT	2	6	102081	102086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187115	GGC	2	6	104122	104127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187115	AGT	2	6	105133	105138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187115	ACA	2	6	106924	106929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187115	GTA	2	6	107130	107135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187115	TCA	2	6	107227	107232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187115	CCG	2	6	107923	107928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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273	NT_187115	GCA	2	6	191079	191084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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404	NT_187115	CTG	2	6	287193	287198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NT_187115	GCA	2	6	287273	287278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
406	NT_187115	TTC	2	6	287300	287305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
407	NT_187115	CAT	2	6	287335	287340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NT_187115	TAT	2	6	287478	287483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NT_187115	AAT	2	6	287498	287503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NT_187115	TAG	2	6	287516	287521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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413	NT_187115	AAT	2	6	291218	291223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NT_187115	CGC	2	6	292215	292220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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420	NT_187115	ATT	2	6	298624	298629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NT_187115	TAA	2	6	298630	298635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.