MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187111	GTT	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187111	TGG	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187111	GCC	2	6	80	85	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NT_187111	CGC	2	6	193	198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187111	AAT	2	6	260	265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187111	GCC	2	6	269	274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NT_187111	CGC	2	6	289	294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187111	CGC	2	6	382	387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NT_187111	TGT	2	6	388	393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187111	CGC	2	6	400	405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187111	CCG	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NT_187111	GTG	2	6	453	458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187111	CCG	2	6	459	464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NT_187111	GTT	2	6	536	541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187111	GCG	2	6	612	617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187111	GGC	2	6	623	628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187111	GCC	2	6	635	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NT_187111	TGC	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187111	TAT	2	6	868	873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187111	TCG	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187111	GGC	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187111	GCC	2	6	1130	1135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NT_187111	CAG	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187111	GCC	2	6	1205	1210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187111	CGA	2	6	1228	1233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187111	TGT	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187111	GAA	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187111	TAG	2	6	1384	1389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187111	TGT	2	6	1444	1449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187111	GCG	3	9	1497	1505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187111	ATT	2	6	1526	1531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187111	ATC	2	6	1550	1555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187111	TGG	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187111	ATC	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187111	GGC	2	6	1736	1741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187111	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187111	GTC	2	6	1922	1927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187111	CTT	2	6	1948	1953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187111	GGA	2	6	2215	2220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187111	CCG	3	9	2226	2234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NT_187111	GCA	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187111	TAA	2	6	2479	2484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187111	TAA	2	6	2652	2657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187111	ATA	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187111	ATT	2	6	2797	2802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187111	TAA	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187111	TGT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187111	TAA	2	6	2909	2914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187111	TGC	2	6	3017	3022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187111	GCC	2	6	3082	3087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NT_187111	ATT	2	6	3102	3107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187111	GGT	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187111	ATT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187111	ATA	2	6	3286	3291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187111	GAT	2	6	19745	19750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187111	ATA	2	6	19831	19836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187111	AAG	2	6	19843	19848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187111	AAT	2	6	19881	19886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187111	TCA	2	6	21844	21849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187111	CGA	2	6	27349	27354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187111	TTG	2	6	27465	27470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187111	TTA	2	6	27511	27516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187111	ATT	2	6	27543	27548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187111	TTA	2	6	28783	28788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187111	TGT	2	6	29425	29430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187111	CAA	2	6	29515	29520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187111	TAA	2	6	34292	34297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187111	TGA	2	6	41637	41642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187111	TGA	2	6	41687	41692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187111	CAG	2	6	43714	43719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187111	TTG	2	6	43723	43728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187111	TAT	2	6	43824	43829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187111	CCG	2	6	43845	43850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NT_187111	CTT	2	6	44008	44013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187111	AGG	2	6	44101	44106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187111	TTA	2	6	46315	46320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187111	GCC	2	6	46329	46334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NT_187111	CTT	2	6	49349	49354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187111	CGC	2	6	49361	49366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NT_187111	GCA	2	6	49445	49450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187111	GAC	2	6	51585	51590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187111	GCC	2	6	51611	51616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NT_187111	AGA	2	6	51617	51622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187111	ATT	2	6	53046	53051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187111	GCT	2	6	53091	53096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187111	CGG	2	6	53956	53961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187111	CCG	2	6	53976	53981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NT_187111	TTA	2	6	55014	55019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187111	CGC	2	6	62294	62299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NT_187111	AAT	2	6	62302	62307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187111	CGG	2	6	62314	62319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187111	TTC	2	6	63729	63734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187111	GTT	2	6	63860	63865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187111	AGA	2	6	63886	63891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187111	CAT	2	6	63937	63942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187111	TCC	2	6	65214	65219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NT_187111	GCT	2	6	65239	65244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187111	TTA	3	9	65300	65308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187111	GCA	2	6	67189	67194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187111	GCA	2	6	70844	70849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187111	GGT	2	6	72323	72328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187111	AGG	2	6	72341	72346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187111	AGA	2	6	76332	76337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187111	ACA	2	6	76372	76377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187111	TAT	2	6	76459	76464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187111	TTG	2	6	76487	76492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187111	AAG	2	6	76538	76543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187111	GGC	2	6	76828	76833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187111	CAG	2	6	77605	77610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187111	GGC	2	6	77643	77648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187111	CAA	2	6	77661	77666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187111	ATG	2	6	77683	77688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187111	TTA	2	6	77699	77704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187111	CTG	2	6	77735	77740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187111	CTT	2	6	83998	84003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187111	ATA	2	6	87524	87529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187111	ATG	2	6	87537	87542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187111	GTC	2	6	87581	87586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187111	AGA	2	6	88484	88489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187111	TTA	2	6	89428	89433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187111	TGT	2	6	91693	91698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187111	CAA	2	6	91998	92003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187111	CGC	2	6	92069	92074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NT_187111	AAG	2	6	95621	95626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187111	AAT	2	6	95751	95756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187111	CTG	2	6	98731	98736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187111	AAC	2	6	98843	98848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187111	CTT	2	6	98915	98920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187111	TAA	2	6	98973	98978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187111	AGC	2	6	100523	100528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187111	ATT	2	6	100826	100831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187111	ATA	2	6	101045	101050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187111	GTT	2	6	101117	101122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187111	TAA	2	6	101217	101222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187111	ACT	2	6	101305	101310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187111	TTG	2	6	101331	101336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187111	TGA	2	6	101337	101342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187111	AGG	2	6	101398	101403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187111	TTC	2	6	101533	101538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187111	TAG	2	6	101758	101763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187111	ATG	2	6	101766	101771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187111	ACG	2	6	102028	102033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NT_187111	TGC	2	6	102102	102107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NT_187111	TCA	2	6	102236	102241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NT_187111	GTC	2	6	102325	102330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NT_187111	CAT	2	6	102393	102398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NT_187111	ATG	2	6	102416	102421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187111	AGA	2	6	102471	102476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187111	CAT	2	6	102724	102729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NT_187111	AAT	2	6	102731	102736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NT_187111	CTG	2	6	102743	102748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NT_187111	ATA	2	6	102870	102875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NT_187111	TAT	2	6	103016	103021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187111	GAA	2	6	103122	103127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NT_187111	GTG	2	6	103151	103156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NT_187111	CTG	2	6	103168	103173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NT_187111	TCT	2	6	103271	103276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.