MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187102	TTAAG	2	10	34143	34152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187102	TTGCG	2	10	37575	37584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NT_187102	GCGCG	2	10	48857	48866	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NT_187102	CGGCG	2	10	62317	62326	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NT_187102	GCGTG	2	10	78176	78185	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NT_187102	AGGGA	2	10	78251	78260	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187102	CTTTT	2	10	80770	80779	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NT_187102	GAAAA	2	10	84995	85004	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187102	ATTAA	2	10	89530	89539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187102	CCCTG	2	10	100484	100493	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NT_187102	CTTTT	2	10	108827	108836	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NT_187102	ATAAA	2	10	111612	111621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187102	ATATG	2	10	112543	112552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187102	ATTAA	2	10	149190	149199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187102	TTAGC	2	10	149222	149231	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NT_187102	TAAGT	2	10	153743	153752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187102	GAAAA	2	10	153771	153780	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187102	CTTTT	2	10	154960	154969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NT_187102	ACAGA	2	10	168883	168892	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NT_187102	GCCGT	2	10	183859	183868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NT_187102	ATAGA	2	10	195515	195524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187102	TTTAC	2	10	221542	221551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NT_187102	ATAAA	2	10	269169	269178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187102	TCGTT	2	10	289297	289306	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NT_187102	GAAAA	2	10	298640	298649	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187102	CCATT	2	10	300744	300753	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NT_187102	GTTTT	2	10	302328	302337	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187102	ACGTC	2	10	331124	331133	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NT_187102	GCCTC	2	10	343083	343092	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NT_187102	CTCCA	2	10	351302	351311	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NT_187102	TCGCC	2	10	355415	355424	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NT_187102	TTATA	2	10	366441	366450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187102	CAGAA	2	10	373183	373192	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NT_187102	AAAAT	2	10	377057	377066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187102	AATGA	2	10	377259	377268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187102	AGAAT	2	10	380564	380573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187102	TTTAC	2	10	382427	382436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NT_187102	AATAT	2	10	385045	385054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.