MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187083	CAA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187083	TCT	2	6	1617	1622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187083	AAT	2	6	1695	1700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187083	ATG	2	6	3698	3703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187083	TGA	3	9	3722	3730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187083	GTT	2	6	3791	3796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187083	GTC	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187083	TCA	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187083	ATC	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187083	TAT	2	6	3899	3904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187083	T	7	7	5257	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187083	AAT	2	6	5284	5289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187083	CCCTA	2	10	5290	5299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NT_187083	AT	4	8	5361	5368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187083	TA	3	6	5393	5398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187083	TAT	2	6	5417	5422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187083	T	6	6	5422	5427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187083	AGC	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187083	CCA	2	6	9443	9448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NT_187083	AGA	2	6	9499	9504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187083	AT	3	6	9604	9609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187083	AAATC	2	10	9627	9636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NT_187083	ATG	2	6	9699	9704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187083	AAT	2	6	10951	10956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187083	AAAAT	2	10	10986	10995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187083	CTC	2	6	11019	11024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NT_187083	TC	3	6	11030	11035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NT_187083	CAG	3	9	12653	12661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187083	A	6	6	13703	13708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187083	ATAC	2	8	13892	13899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NT_187083	ATC	2	6	13909	13914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187083	T	6	6	13951	13956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187083	TGT	2	6	13976	13981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187083	AAT	2	6	13994	13999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187083	A	6	6	14143	14148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187083	GGATT	2	10	14159	14168	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187083	AAT	2	6	14183	14188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187083	T	6	6	15196	15201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187083	ACCT	2	8	17525	17532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NT_187083	T	6	6	17544	17549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187083	CT	4	8	18442	18449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NT_187083	TTA	2	6	18450	18455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187083	CGA	2	6	18462	18467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187083	TAA	2	6	18582	18587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187083	AAAT	2	8	18588	18595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187083	T	6	6	18621	18626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187083	CTC	2	6	18632	18637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NT_187083	CTG	2	6	18638	18643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187083	TTAA	2	8	18649	18656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187083	CAA	2	6	18668	18673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187083	AATT	2	8	18695	18702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187083	CAA	2	6	18709	18714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187083	TTA	2	6	18731	18736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187083	ATAA	2	8	18759	18766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187083	GC	3	6	20627	20632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NT_187083	CGG	2	6	20677	20682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187083	TGT	2	6	21472	21477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187083	GCG	2	6	21520	21525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187083	TGTC	2	8	21576	21583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NT_187083	GTG	2	6	21603	21608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187083	T	10	10	22709	22718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187083	T	6	6	22755	22760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187083	GAGTT	2	10	22763	22772	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187083	TCT	2	6	24061	24066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187083	GC	3	6	24088	24093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NT_187083	TGA	2	6	24143	24148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187083	T	6	6	24170	24175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187083	ATA	2	6	24176	24181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187083	GTA	2	6	25834	25839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187083	AAC	2	6	25874	25879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187083	GGC	2	6	27693	27698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187083	GCC	2	6	27703	27708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NT_187083	AATC	2	8	27712	27719	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NT_187083	GGA	2	6	27753	27758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187083	A	6	6	28071	28076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187083	T	6	6	28092	28097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187083	CAG	2	6	28592	28597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187083	TACAA	2	10	28614	28623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NT_187083	TAA	2	6	28628	28633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187083	CAT	2	6	28644	28649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187083	TTG	2	6	28666	28671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187083	GCC	2	6	28684	28689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NT_187083	CTG	2	6	28722	28727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187083	G	6	6	29437	29442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.