MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	GCGCT	2	10	7147	7156	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NT_187076	CAGGT	2	10	9410	9419	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NT_187076	TGTTA	2	10	11268	11277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187076	TTCAA	2	10	24586	24595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187076	ACGGA	2	10	37271	37280	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NT_187076	GTTTT	2	10	51833	51842	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187076	TTTAT	2	10	67474	67483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187076	AAAAT	2	10	76205	76214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187076	AGGGA	2	10	88596	88605	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187076	GGCGC	2	10	88665	88674	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NT_187076	TCCTT	2	10	96415	96424	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NT_187076	CTTCA	2	10	97447	97456	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NT_187076	CTTTT	2	10	102871	102880	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NT_187076	GTCGC	2	10	117593	117602	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NT_187076	TGCGG	2	10	117788	117797	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NT_187076	TGTAA	2	10	139971	139980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187076	TTGAT	2	10	149183	149192	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187076	CATTT	2	10	149982	149991	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NT_187076	TTATT	2	10	170781	170790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187076	TTTGT	2	10	170807	170816	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187076	ATAAG	2	10	175914	175923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187076	GCATA	2	10	190577	190586	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.