MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187075	CTA	2	6	46	51	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187075	TC	3	6	1881	1886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187075	ATT	2	6	1941	1946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187075	TGC	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187075	CGA	2	6	2621	2626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187075	GGT	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187075	TAC	2	6	3829	3834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187075	CGG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187075	A	6	6	3864	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187075	A	6	6	3877	3882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187075	CGG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187075	CTG	2	6	3962	3967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187075	TCG	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187075	GCC	2	6	4081	4086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NT_187075	CAG	2	6	4091	4096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187075	TAA	2	6	4100	4105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187075	AAG	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187075	GC	3	6	6487	6492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NT_187075	GAT	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187075	CTCG	2	8	7015	7022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187075	TTG	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187075	TA	3	6	9227	9232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187075	ATG	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187075	ACC	2	6	9304	9309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187075	GCTAA	2	10	9326	9335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NT_187075	AT	3	6	10633	10638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187075	ATT	2	6	10696	10701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187075	T	6	6	10703	10708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187075	TAT	2	6	10716	10721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187075	GCG	2	6	10754	10759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187075	ATT	2	6	10769	10774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187075	TTC	2	6	10784	10789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187075	TTC	2	6	10830	10835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187075	TAA	2	6	10860	10865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187075	ACA	2	6	11151	11156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187075	TCAA	2	8	11341	11348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NT_187075	GTAA	2	8	11369	11376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187075	GGT	2	6	11391	11396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187075	TA	3	6	11421	11426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187075	CTCC	2	8	11856	11863	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NT_187075	TG	3	6	13858	13863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187075	TGA	2	6	13923	13928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187075	ATT	3	9	14518	14526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187075	GAT	2	6	14551	14556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187075	CTG	2	6	15536	15541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187075	ACG	2	6	15606	15611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187075	TAA	2	6	15615	15620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187075	TTAAT	2	10	16352	16361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187075	CGG	2	6	16682	16687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187075	A	6	6	17721	17726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187075	GAG	2	6	17728	17733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187075	ACC	2	6	19841	19846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NT_187075	GC	3	6	19870	19875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NT_187075	ATT	2	6	19963	19968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187075	TAAC	2	8	24542	24549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NT_187075	T	6	6	26719	26724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187075	ACA	2	6	26998	27003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187075	TCC	2	6	29857	29862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NT_187075	TCC	2	6	29870	29875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NT_187075	TAA	2	6	29878	29883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187075	GAT	2	6	29891	29896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187075	GGT	2	6	31779	31784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187075	A	6	6	31803	31808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187075	AACGC	2	10	32479	32488	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NT_187075	AGGG	2	8	32498	32505	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187075	CAAT	2	8	32533	32540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NT_187075	ATCG	2	8	32557	32564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NT_187075	ATG	2	6	32582	32587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187075	CGG	2	6	32622	32627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187075	ACGC	2	8	32633	32640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187075	TAA	2	6	35724	35729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187075	T	8	8	38977	38984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187075	CTC	2	6	39045	39050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NT_187075	AGG	2	6	39071	39076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187075	AG	3	6	39461	39466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187075	TCA	2	6	40210	40215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187075	CCTT	2	8	40231	40238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187075	AT	3	6	40245	40250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187075	TAT	2	6	40311	40316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187075	CTG	2	6	40687	40692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187075	ATT	2	6	40764	40769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187075	T	6	6	40799	40804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187075	T	7	7	40884	40890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187075	CAA	2	6	41103	41108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187075	GGC	2	6	41110	41115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187075	GGC	2	6	41160	41165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187075	TGG	2	6	41206	41211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187075	CGC	3	9	41245	41253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NT_187075	GCA	2	6	41257	41262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187075	T	6	6	41298	41303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187075	TAT	2	6	42257	42262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187075	TATC	2	8	42300	42307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NT_187075	GCG	2	6	42349	42354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187075	TGT	2	6	43104	43109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187075	ATC	2	6	43143	43148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187075	AGC	2	6	44740	44745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187075	ATT	2	6	44752	44757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187075	C	6	6	44771	44776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NT_187075	T	6	6	45280	45285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187075	CGAT	2	8	45744	45751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NT_187075	CCG	2	6	45754	45759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NT_187075	CTTTT	2	10	45768	45777	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NT_187075	T	7	7	45774	45780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187075	CTG	2	6	45781	45786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187075	GGC	2	6	47286	47291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187075	GCGCC	2	10	47349	47358	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NT_187075	CT	3	6	51448	51453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NT_187075	GTGATA	2	12	51539	51550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187075	GCT	2	6	51584	51589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187075	GCC	2	6	51638	51643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NT_187075	T	6	6	53828	53833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187075	CGC	2	6	57765	57770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NT_187075	TCC	2	6	59255	59260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NT_187075	TCA	2	6	59303	59308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187075	TAT	2	6	59339	59344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187075	GCAAC	2	10	59345	59354	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NT_187075	GAA	2	6	59368	59373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187075	GTT	2	6	59869	59874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187075	CGC	2	6	59891	59896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187075	AGT	2	6	61304	61309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187075	A	6	6	61381	61386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187075	TCAT	2	8	61442	61449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NT_187075	TGGC	2	8	61602	61609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NT_187075	GGTG	2	8	61611	61618	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187075	TTTGC	2	10	61629	61638	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NT_187075	GAT	2	6	61667	61672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187075	TCT	2	6	61685	61690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187075	CAA	2	6	61707	61712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187075	GC	3	6	61746	61751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NT_187075	AGA	2	6	61763	61768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187075	CAG	2	6	61774	61779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187075	TAT	2	6	61787	61792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187075	ATT	2	6	61793	61798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187075	GCGA	2	8	64811	64818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NT_187075	AAT	2	6	64820	64825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187075	CGC	2	6	65750	65755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NT_187075	TGG	2	6	69675	69680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187075	AT	3	6	70029	70034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187075	T	6	6	70034	70039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187075	TTA	2	6	70079	70084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187075	AAT	2	6	70093	70098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187075	TTG	3	9	71609	71617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187075	TCG	2	6	72296	72301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NT_187075	AAT	2	6	72393	72398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187075	TGT	2	6	72418	72423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187075	GGA	2	6	72490	72495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187075	GTTTT	2	10	72894	72903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187075	CCG	2	6	72964	72969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NT_187075	TA	3	6	73030	73035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187075	GAT	2	6	73049	73054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NT_187075	GAC	2	6	73058	73063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NT_187075	TGAT	2	8	73072	73079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NT_187075	T	6	6	73150	73155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187075	T	8	8	74523	74530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NT_187075	CAG	2	6	74676	74681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NT_187075	T	6	6	74683	74688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NT_187075	GC	3	6	75400	75405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NT_187075	ACTT	2	8	75415	75422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NT_187075	GCC	2	6	75451	75456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NT_187075	TA	3	6	75482	75487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NT_187075	GGC	2	6	75497	75502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NT_187075	CGT	3	9	75543	75551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NT_187075	AGA	2	6	75570	75575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NT_187075	A	6	6	76885	76890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NT_187075	G	6	6	76891	76896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
166	NT_187075	TG	3	6	76940	76945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NT_187075	GGT	2	6	76980	76985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NT_187075	ACTAA	2	10	77023	77032	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NT_187075	GA	3	6	77033	77038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NT_187075	TAA	2	6	79419	79424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NT_187075	T	7	7	79461	79467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NT_187075	CCA	2	6	79500	79505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NT_187075	CTG	2	6	79544	79549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NT_187075	GAAGA	2	10	79597	79606	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
175	NT_187075	T	6	6	79935	79940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NT_187075	CGC	2	6	80015	80020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NT_187075	ATGCG	2	10	80030	80039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
178	NT_187075	GCC	2	6	80118	80123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
179	NT_187075	TCG	2	6	82042	82047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NT_187075	A	6	6	82059	82064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NT_187075	AACA	2	8	82170	82177	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NT_187075	AAC	3	9	82644	82652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NT_187075	GCC	2	6	83153	83158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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188	NT_187075	G	6	6	86639	86644	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.