MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187074	TAT	2	6	99	104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187074	ATT	2	6	260	265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187074	ATG	2	6	284	289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187074	ATC	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187074	CAT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187074	ATT	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187074	AAC	2	6	497	502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187074	GCT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187074	CAT	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187074	GCC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187074	TTA	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187074	CAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187074	CAA	2	6	5735	5740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187074	GAC	2	6	6160	6165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187074	TGG	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187074	GGC	2	6	6274	6279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187074	GCC	2	6	6305	6310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NT_187074	GGC	2	6	6315	6320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187074	ATA	2	6	8269	8274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187074	GAT	2	6	9688	9693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187074	TTA	2	6	9729	9734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187074	TCA	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187074	GAT	2	6	9811	9816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187074	GGC	2	6	12230	12235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187074	TAC	2	6	12336	12341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187074	GAT	2	6	12366	12371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187074	ATA	2	6	12538	12543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187074	CTT	2	6	12613	12618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187074	TTA	2	6	12636	12641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187074	ATC	2	6	13804	13809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187074	GAA	2	6	15946	15951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187074	CAC	2	6	18898	18903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NT_187074	ATT	2	6	18932	18937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187074	ACT	2	6	19085	19090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187074	TAT	2	6	19123	19128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187074	GCA	2	6	19378	19383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187074	ATT	2	6	19438	19443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187074	TCT	2	6	19507	19512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187074	ATA	2	6	19668	19673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187074	GCT	2	6	19851	19856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187074	AAT	2	6	19881	19886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187074	ATG	2	6	19899	19904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187074	ATA	4	12	19906	19917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187074	GAG	2	6	19971	19976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187074	CAA	2	6	25468	25473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187074	GGA	2	6	26135	26140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187074	CCT	2	6	26189	26194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NT_187074	ATA	2	6	26423	26428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187074	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187074	ATA	2	6	26681	26686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187074	GTC	2	6	26688	26693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187074	ATG	2	6	26697	26702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187074	TAA	2	6	27936	27941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187074	TCA	2	6	27982	27987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187074	GAA	2	6	29876	29881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187074	TGT	2	6	31122	31127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187074	AAT	2	6	31186	31191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187074	TAA	2	6	31331	31336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187074	TAA	2	6	31420	31425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187074	ATA	2	6	32082	32087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187074	GCT	2	6	32092	32097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187074	TGA	2	6	32173	32178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187074	CTA	2	6	32875	32880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187074	TGC	2	6	32881	32886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187074	CAT	2	6	32993	32998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187074	TTC	2	6	33010	33015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187074	TTA	2	6	33083	33088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187074	CAT	2	6	39562	39567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187074	GTC	2	6	39681	39686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187074	TAA	2	6	42844	42849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187074	GAC	2	6	42945	42950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187074	CGC	2	6	42969	42974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NT_187074	AAC	2	6	44340	44345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187074	ATG	2	6	44354	44359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187074	ATC	2	6	44385	44390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187074	GCC	2	6	49449	49454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NT_187074	CTG	2	6	52371	52376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187074	ATT	2	6	52547	52552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187074	CTA	2	6	53672	53677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187074	TAA	2	6	53766	53771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187074	TTA	2	6	56611	56616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187074	GAT	2	6	56629	56634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187074	GTT	2	6	56673	56678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187074	ACT	2	6	56723	56728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187074	GAT	2	6	56769	56774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187074	TAA	3	9	56779	56787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187074	CAT	2	6	57087	57092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187074	CGG	2	6	57114	57119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187074	GCC	2	6	60015	60020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NT_187074	AAT	2	6	60085	60090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187074	TTA	2	6	61280	61285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187074	GCG	2	6	65867	65872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187074	CTT	2	6	65886	65891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187074	GTT	2	6	65952	65957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187074	ATT	2	6	66002	66007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187074	TTA	2	6	66118	66123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187074	AAT	2	6	66165	66170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187074	CGC	2	6	66189	66194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NT_187074	CTT	2	6	66201	66206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187074	GAG	2	6	66267	66272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187074	CTA	2	6	66361	66366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187074	TTA	2	6	66383	66388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187074	ACC	2	6	66399	66404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NT_187074	ACA	3	9	66481	66489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187074	TAC	2	6	66549	66554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187074	ACA	2	6	66726	66731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187074	ATG	2	6	66736	66741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187074	TGA	3	9	66779	66787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187074	AAC	2	6	66999	67004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187074	CGA	2	6	67085	67090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187074	AGC	3	9	67140	67148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187074	GAA	2	6	67163	67168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187074	GGT	2	6	67287	67292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187074	TGA	2	6	67298	67303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187074	TGA	2	6	67316	67321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187074	GTA	2	6	67345	67350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.