MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187073	ACT	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187073	TTA	2	6	301	306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187073	ATT	2	6	353	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187073	CTG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187073	ATT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187073	AGA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187073	TGC	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187073	GCG	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187073	TCG	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187073	GAC	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187073	AAT	2	6	7527	7532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187073	ATC	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187073	GCA	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187073	CAG	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187073	CTT	2	6	9901	9906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187073	AAT	2	6	14001	14006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187073	GGA	2	6	16248	16253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187073	ATT	2	6	16308	16313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187073	TAT	2	6	16328	16333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187073	TCG	2	6	16336	16341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187073	TTG	2	6	16350	16355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187073	ATT	2	6	16381	16386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187073	ATT	2	6	16430	16435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187073	ATT	2	6	16549	16554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187073	ATA	2	6	21425	21430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187073	AAT	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187073	TAA	2	6	22472	22477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187073	CGG	2	6	23064	23069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187073	AGA	2	6	23203	23208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187073	GCG	2	6	23211	23216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187073	TGA	2	6	24167	24172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187073	TAA	2	6	24220	24225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187073	TAG	2	6	24265	24270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187073	GGC	2	6	28808	28813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187073	TGG	2	6	28946	28951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187073	GTA	2	6	28962	28967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187073	ATT	2	6	29429	29434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187073	TGG	2	6	34098	34103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187073	GAA	2	6	34128	34133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187073	TAA	2	6	34157	34162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187073	GCA	2	6	34257	34262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187073	ATA	2	6	34303	34308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187073	ACG	2	6	34372	34377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187073	AGT	2	6	34515	34520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187073	TGG	2	6	34552	34557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187073	AAT	2	6	35119	35124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187073	TGG	2	6	35130	35135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187073	GAA	2	6	35160	35165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187073	TAA	2	6	35189	35194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187073	TGC	3	9	35288	35296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187073	ATA	2	6	35335	35340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187073	CAT	2	6	35365	35370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187073	TTC	2	6	35425	35430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187073	GCT	2	6	35522	35527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187073	TGG	2	6	35554	35559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187073	CTG	2	6	35583	35588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187073	AAT	2	6	35590	35595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187073	TAT	2	6	35596	35601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187073	TCA	2	6	37019	37024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187073	TGG	2	6	37036	37041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187073	ATT	2	6	37125	37130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187073	GTT	2	6	37284	37289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187073	TCA	2	6	37301	37306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187073	TTA	2	6	37366	37371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187073	TTC	2	6	37385	37390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187073	ATT	2	6	45047	45052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187073	TTA	2	6	45091	45096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187073	AAT	2	6	45751	45756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187073	TTG	2	6	45810	45815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187073	GTT	2	6	45835	45840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187073	GGA	2	6	45888	45893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187073	AGG	2	6	45910	45915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187073	TAA	2	6	46094	46099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187073	AAT	2	6	46176	46181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187073	GCG	2	6	46219	46224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187073	GCG	2	6	46226	46231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187073	ATA	2	6	46662	46667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187073	GGA	2	6	46752	46757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187073	TTG	2	6	47126	47131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187073	GTA	2	6	47171	47176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187073	ACG	2	6	47527	47532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187073	TGA	2	6	50400	50405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187073	ATT	2	6	50458	50463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187073	CAT	2	6	50495	50500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187073	GGC	2	6	50596	50601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187073	ATA	2	6	50606	50611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187073	ATT	2	6	50663	50668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187073	TAT	2	6	50669	50674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187073	TAA	2	6	50730	50735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187073	CCG	2	6	51126	51131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NT_187073	TAA	2	6	51444	51449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187073	TGC	2	6	51561	51566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187073	TTA	2	6	51575	51580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187073	TGC	2	6	51700	51705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187073	TTA	2	6	51712	51717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187073	TAT	2	6	51886	51891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187073	ATA	2	6	51908	51913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187073	ATA	2	6	51980	51985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187073	ATT	2	6	52050	52055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187073	TAT	2	6	52224	52229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187073	CTG	2	6	52261	52266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187073	CTT	2	6	52347	52352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187073	TAA	2	6	52379	52384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187073	TGT	2	6	52584	52589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187073	AGA	2	6	52663	52668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187073	TAA	2	6	52693	52698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187073	GAA	2	6	52901	52906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187073	ATG	2	6	52923	52928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187073	GAT	2	6	52961	52966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187073	GAA	2	6	53041	53046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187073	TAT	2	6	53056	53061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187073	ATT	2	6	53142	53147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187073	TCT	2	6	53176	53181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187073	TTA	2	6	53187	53192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187073	GAT	2	6	53210	53215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187073	TTA	2	6	53225	53230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187073	AAT	2	6	53249	53254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187073	TAC	2	6	53360	53365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187073	AAT	2	6	53616	53621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187073	TTA	2	6	53772	53777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187073	TGC	2	6	53826	53831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187073	TAA	2	6	53884	53889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187073	ATC	2	6	53990	53995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187073	ATC	2	6	54060	54065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187073	CCA	2	6	54136	54141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NT_187073	CGG	2	6	54164	54169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187073	AAC	2	6	54246	54251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187073	CGT	2	6	54319	54324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187073	TGT	2	6	54339	54344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187073	TGA	2	6	54345	54350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187073	GCT	2	6	54839	54844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187073	GGT	2	6	54873	54878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187073	TAA	2	6	55064	55069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187073	GTG	2	6	55170	55175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187073	ACA	2	6	55253	55258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187073	TTA	2	6	55389	55394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187073	CAT	2	6	55434	55439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187073	GCT	2	6	55538	55543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187073	GTT	2	6	55545	55550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187073	CGG	2	6	55590	55595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.