MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187072	CAGC	2	8	21	28	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187072	GCCG	2	8	145	152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187072	CCAG	2	8	774	781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187072	TAAT	2	8	3096	3103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187072	TTAA	2	8	3127	3134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187072	ATAA	2	8	9549	9556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187072	AGTG	2	8	10454	10461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187072	ATTT	2	8	22832	22839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187072	GTTT	2	8	22859	22866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187072	CAGG	2	8	28526	28533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NT_187072	CTGC	2	8	29193	29200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NT_187072	CCCA	2	8	29773	29780	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NT_187072	ACTC	2	8	29879	29886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NT_187072	TTTC	2	8	30226	30233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NT_187072	CTGG	2	8	32885	32892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NT_187072	TAAT	2	8	35576	35583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187072	ATCA	2	8	40543	40550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187072	TATT	2	8	42920	42927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187072	AATG	2	8	44022	44029	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187072	CAAA	2	8	50950	50957	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187072	ATGG	2	8	52898	52905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187072	TTTA	2	8	53015	53022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187072	GTTT	2	8	53148	53155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187072	TAAA	2	8	53239	53246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187072	TCCA	2	8	57869	57876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NT_187072	CAGG	2	8	57923	57930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NT_187072	CAGC	2	8	62235	62242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NT_187072	TTTG	2	8	70368	70375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187072	ACGA	2	8	70458	70465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NT_187072	TTTG	2	8	70679	70686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187072	TTGC	2	8	70914	70921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NT_187072	AGCG	2	8	72340	72347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NT_187072	CAAA	2	8	75942	75949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NT_187072	CTTT	2	8	76024	76031	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NT_187072	CTTG	2	8	76424	76431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187072	CATC	2	8	76626	76633	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NT_187072	CCTG	2	8	76656	76663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NT_187072	GATG	2	8	76764	76771	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187072	GGCA	2	8	99559	99566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NT_187072	CTGG	2	8	103392	103399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NT_187072	ATTT	2	8	113141	113148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187072	AAAG	2	8	113258	113265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187072	TCAA	2	8	113497	113504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187072	TAGA	2	8	114656	114663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187072	CGGC	2	8	119263	119270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NT_187072	TGTC	2	8	121042	121049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NT_187072	GATG	2	8	127781	127788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187072	TTTC	2	8	128329	128336	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NT_187072	GAAT	2	8	139518	139525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187072	AAGT	2	8	140969	140976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187072	GTTT	2	8	147911	147918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187072	AACG	2	8	155184	155191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NT_187072	ACGC	2	8	155785	155792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NT_187072	AAAG	2	8	157123	157130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187072	AAAT	2	8	169077	169084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187072	CTTG	2	8	169174	169181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NT_187072	TTTG	2	8	169183	169190	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187072	TAAA	2	8	169237	169244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187072	TTAT	2	8	169299	169306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187072	ATAA	2	8	188922	188929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187072	CCAG	2	8	191466	191473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NT_187072	AGGG	2	8	191557	191564	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187072	TCAG	2	8	192700	192707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NT_187072	GAAA	2	8	195060	195067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187072	TCAG	2	8	197979	197986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NT_187072	TTAG	2	8	201147	201154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187072	GCAG	2	8	212940	212947	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NT_187072	AATG	2	8	224202	224209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187072	ATCA	2	8	226942	226949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.