MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 33878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022785	TGC	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022785	GCG	2	6	64	69	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022785	CTG	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022785	TGC	2	6	307	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022785	GCA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022785	GAT	2	6	407	412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022785	ATC	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022785	GCC	2	6	1218	1223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_022785	GCT	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022785	CCA	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_022785	ACG	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022785	GGC	2	6	4827	4832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022785	CTG	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022785	GGT	2	6	4950	4955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022785	CGG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022785	GAA	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022785	CCG	2	6	5040	5045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_022785	CCG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_022785	CTC	2	6	5189	5194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_022785	GAT	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022785	TGG	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022785	GTC	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022785	AGC	2	6	8915	8920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022785	GAA	2	6	8957	8962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022785	GCC	2	6	9027	9032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_022785	GGC	2	6	10952	10957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022785	GTG	2	6	11028	11033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022785	CGG	2	6	11063	11068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022785	CTG	2	6	11101	11106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022785	TGC	2	6	11132	11137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022785	CCT	2	6	11201	11206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_022785	TCC	2	6	11220	11225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_022785	AGA	2	6	11274	11279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022785	CAG	2	6	11291	11296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022785	CTG	2	6	11332	11337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022785	GTA	2	6	11383	11388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022785	CGA	2	6	11555	11560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022785	TCC	2	6	11619	11624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_022785	CCG	2	6	11692	11697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_022785	CGG	2	6	11771	11776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022785	TGC	2	6	11810	11815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022785	GCT	2	6	11844	11849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022785	CAG	2	6	11962	11967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022785	GCG	2	6	14957	14962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022785	CGG	3	9	15009	15017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022785	GAC	2	6	15019	15024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022785	GGC	2	6	15598	15603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022785	TCG	2	6	15750	15755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022785	GCG	2	6	15766	15771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022785	AAG	2	6	15773	15778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022785	CAC	2	6	15781	15786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_022785	CTG	2	6	15821	15826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022785	GTG	2	6	15862	15867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022785	CGC	2	6	15938	15943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_022785	CGG	2	6	16021	16026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022785	CGT	2	6	16039	16044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022785	CCG	2	6	16114	16119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_022785	TTC	2	6	16169	16174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022785	CTA	2	6	16258	16263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022785	CGC	2	6	16271	16276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022785	CAG	2	6	16319	16324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022785	CGC	2	6	16689	16694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_022785	GAC	2	6	16825	16830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022785	GGC	2	6	16861	16866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022785	CGC	2	6	16886	16891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022785	TGG	2	6	16921	16926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022785	GGC	2	6	16988	16993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022785	CTT	2	6	17030	17035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022785	GTT	2	6	17188	17193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022785	ACC	2	6	17358	17363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_022785	GGA	2	6	17412	17417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022785	ACG	2	6	17536	17541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022785	GGC	2	6	17583	17588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022785	CTG	2	6	17668	17673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022785	GGA	2	6	17685	17690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022785	CCG	2	6	17760	17765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_022785	GCT	2	6	18692	18697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022785	TCG	2	6	18711	18716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022785	GCG	2	6	18735	18740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022785	GGC	2	6	18773	18778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022785	CCG	2	6	18783	18788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_022785	GCT	2	6	18789	18794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022785	GAC	2	6	18805	18810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022785	TGC	2	6	18882	18887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022785	AAC	2	6	19090	19095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022785	GGC	2	6	19157	19162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022785	TGG	2	6	19462	19467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022785	TGG	2	6	19786	19791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022785	GCG	2	6	19836	19841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022785	CTG	2	6	20016	20021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022785	CGG	2	6	20089	20094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022785	TGG	2	6	20175	20180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022785	ACG	2	6	20222	20227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022785	CAG	2	6	20263	20268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022785	GGC	2	6	20277	20282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022785	AGT	2	6	21945	21950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022785	GTG	2	6	21955	21960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022785	CTT	2	6	21997	22002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022785	CTT	2	6	22009	22014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022785	GCC	2	6	22118	22123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022785	CCA	3	9	22154	22162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022785	CCT	2	6	22180	22185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_022785	GCC	2	6	22200	22205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_022785	GCG	2	6	22233	22238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022785	GCC	2	6	22247	22252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022785	CGC	2	6	22301	22306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_022785	CCT	2	6	22447	22452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022785	GGC	2	6	22466	22471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022785	TCC	2	6	22560	22565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022785	CGC	2	6	22593	22598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022785	CTC	2	6	22610	22615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_022785	AGC	2	6	22671	22676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022785	CCA	2	6	22807	22812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_022785	CGT	2	6	22813	22818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022785	TCC	2	6	22845	22850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_022785	ACC	2	6	22851	22856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_022785	CTG	2	6	22886	22891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022785	ACC	2	6	22926	22931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_022785	CGA	2	6	23225	23230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022785	CAC	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_022785	CAC	2	6	23275	23280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022785	CCA	2	6	23492	23497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022785	ACC	2	6	23540	23545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_022785	GCC	2	6	23547	23552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_022785	ACC	2	6	23562	23567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_022785	CAG	2	6	23589	23594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022785	CCG	2	6	23675	23680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_022785	CGG	2	6	23683	23688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022785	GGC	2	6	23699	23704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022785	GGC	2	6	23737	23742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022785	TCG	2	6	24108	24113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022785	CAG	2	6	24130	24135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022785	GCC	2	6	24218	24223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_022785	GCT	2	6	24224	24229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022785	AGA	2	6	24232	24237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022785	CAT	2	6	24253	24258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022785	GCC	2	6	24265	24270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_022785	GAT	2	6	24304	24309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022785	CCG	2	6	24343	24348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_022785	CAT	2	6	24486	24491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_022785	CGG	2	6	26305	26310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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