MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 51106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022785	GAG	2	6	213404	213409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022785	CGG	2	6	213487	213492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_022785	G	8	8	214354	214361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022785	CGT	2	6	214454	214459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022785	TCGTC	2	10	218243	218252	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1006	NC_022785	GT	3	6	218259	218264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022785	GC	3	6	218266	218271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_022785	CGA	2	6	218322	218327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_022785	GGCCG	2	10	218338	218347	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1010	NC_022785	CGG	2	6	218392	218397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_022785	CCGG	2	8	218458	218465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_022785	CGG	2	6	219137	219142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_022785	CGA	2	6	219144	219149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_022785	AGG	2	6	219366	219371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022785	ACCTCG	2	12	219422	219433	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_022785	GTC	2	6	219508	219513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_022785	CGG	3	9	219531	219539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_022785	ATC	2	6	219541	219546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_022785	CGC	2	6	219591	219596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_022785	GAA	2	6	219651	219656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022785	AGA	2	6	219724	219729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022785	GCC	2	6	219735	219740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_022785	CCG	2	6	219757	219762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_022785	TCG	2	6	219766	219771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_022785	GCG	2	6	219790	219795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_022785	GGT	3	9	219868	219876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022785	TCG	2	6	219927	219932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_022785	GCG	2	6	219933	219938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_022785	TGC	3	9	219951	219959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_022785	TGG	2	6	219963	219968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022785	CCG	2	6	219973	219978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_022785	TCCC	2	8	219986	219993	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1033	NC_022785	GCC	2	6	220038	220043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_022785	CCCG	2	8	220069	220076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1035	NC_022785	CG	3	6	220208	220213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_022785	GC	3	6	220229	220234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_022785	CGG	2	6	220261	220266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_022785	TGC	3	9	220311	220319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_022785	GC	3	6	220318	220323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_022785	TGCC	2	8	221156	221163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_022785	CTG	2	6	221202	221207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_022785	G	8	8	221207	221214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022785	AGG	2	6	221246	221251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_022785	TCA	2	6	221939	221944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_022785	CTGC	2	8	221947	221954	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_022785	CTG	2	6	222030	222035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_022785	TCG	2	6	222075	222080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_022785	CA	3	6	222123	222128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_022785	TCA	2	6	222173	222178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_022785	TCA	2	6	222191	222196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_022785	GCG	2	6	222236	222241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_022785	CAC	2	6	222274	222279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_022785	CGGCA	2	10	222512	222521	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1054	NC_022785	TGC	2	6	222540	222545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_022785	GTC	2	6	222546	222551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_022785	CTGG	2	8	222592	222599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_022785	CGC	2	6	222655	222660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_022785	CAT	2	6	222705	222710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_022785	GCC	2	6	222818	222823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_022785	ATG	2	6	222833	222838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_022785	CTC	2	6	222898	222903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_022785	GAT	2	6	222914	222919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022785	CGT	2	6	222947	222952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_022785	GGAC	2	8	222970	222977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_022785	CTC	2	6	225589	225594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_022785	GCG	2	6	225610	225615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_022785	TGT	2	6	225633	225638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022785	GAG	2	6	225680	225685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022785	CGA	2	6	226335	226340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_022785	CGC	2	6	226386	226391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_022785	CG	3	6	226489	226494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_022785	CTCGAC	2	12	226515	226526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_022785	CGG	2	6	226537	226542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_022785	CAAG	2	8	226547	226554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_022785	GAGCC	2	10	226558	226567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1076	NC_022785	G	6	6	226570	226575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022785	CAG	2	6	226613	226618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_022785	GCC	2	6	226792	226797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_022785	GAC	2	6	226848	226853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_022785	CG	3	6	226974	226979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_022785	AC	3	6	226985	226990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_022785	GGC	2	6	227001	227006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_022785	GCCC	2	8	227773	227780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1084	NC_022785	GAC	2	6	227813	227818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_022785	TCA	2	6	227826	227831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_022785	GGA	2	6	227833	227838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_022785	CGA	2	6	228405	228410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_022785	GC	3	6	228459	228464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_022785	CAC	2	6	228475	228480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_022785	CGC	2	6	228552	228557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_022785	GCG	2	6	228566	228571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_022785	CCG	2	6	228599	228604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_022785	CGC	2	6	228639	228644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_022785	GCG	2	6	228802	228807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_022785	AGC	2	6	229039	229044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022785	CTG	2	6	229062	229067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_022785	GTC	2	6	229077	229082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_022785	GCG	3	9	229955	229963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_022785	GGCG	2	8	230059	230066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_022785	CGC	2	6	230074	230079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_022785	CCG	2	6	230410	230415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_022785	TGC	2	6	230425	230430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_022785	CTG	2	6	230431	230436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_022785	CGG	2	6	230443	230448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_022785	CGC	2	6	230463	230468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_022785	CCGT	2	8	230494	230501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_022785	GTG	2	6	230927	230932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022785	GCG	2	6	231000	231005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_022785	CG	3	6	231048	231053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_022785	CGC	2	6	231505	231510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_022785	GC	3	6	231516	231521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_022785	AC	3	6	231539	231544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_022785	GGT	2	6	231548	231553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022785	CA	3	6	231612	231617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_022785	GCC	2	6	231624	231629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_022785	GCC	2	6	231639	231644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_022785	G	6	6	231677	231682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022785	GAG	2	6	232110	232115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022785	GCT	2	6	232187	232192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_022785	AGC	2	6	232200	232205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_022785	GGT	2	6	232207	232212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022785	CGG	2	6	232226	232231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_022785	GGA	2	6	232270	232275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022785	CGA	2	6	232315	232320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_022785	GC	3	6	232349	232354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_022785	TAC	2	6	234221	234226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_022785	CCG	2	6	234235	234240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_022785	GCA	2	6	234268	234273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_022785	CTG	2	6	234291	234296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_022785	AGG	2	6	234362	234367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022785	CAG	2	6	234386	234391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_022785	GGC	3	9	234800	234808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_022785	CGT	2	6	234919	234924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_022785	GTA	2	6	234962	234967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022785	AGG	2	6	234982	234987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022785	CG	3	6	235003	235008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_022785	ACC	2	6	235026	235031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_022785	CCA	2	6	235033	235038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_022785	CGA	3	9	235045	235053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_022785	CAG	2	6	235164	235169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_022785	CGAGC	2	10	235170	235179	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1144	NC_022785	GCC	2	6	235180	235185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1147	NC_022785	GCG	2	6	235253	235258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1149	NC_022785	CCG	2	6	235268	235273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1150	NC_022785	GACGGC	2	12	235298	235309	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1154	NC_022785	CCT	2	6	235393	235398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1160	NC_022785	GAGGAC	2	12	235550	235561	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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1162	NC_022785	CCA	2	6	235590	235595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1163	NC_022785	CGC	2	6	235636	235641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1164	NC_022785	CGCGA	2	10	235652	235661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1165	NC_022785	CGTG	2	8	235847	235854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1166	NC_022785	GTC	2	6	235877	235882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_022785	GTCG	2	8	255697	255704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1258	NC_022785	GCG	2	6	257496	257501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_022785	GCAG	2	8	257516	257523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1262	NC_022785	GAT	2	6	257772	257777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_022785	CGA	2	6	257785	257790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1403	NC_022785	GAG	2	6	283197	283202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_022785	CGG	2	6	283217	283222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_022785	CGACCT	2	12	283244	283255	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1406	NC_022785	GGC	2	6	283281	283286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1425	NC_022785	GCC	2	6	285271	285276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1431	NC_022785	GCC	2	6	285549	285554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1432	NC_022785	AAG	2	6	285555	285560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1491	NC_022785	GA	3	6	299739	299744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_022785	GCG	2	6	301247	301252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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