MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 51106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022785	CCG	2	6	55098	55103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_022785	AC	3	6	55112	55117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_022785	AGGT	2	8	55166	55173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022785	CGC	2	6	57714	57719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_022785	GAG	2	6	58313	58318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022785	AACC	2	8	58328	58335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_022785	GCG	2	6	58353	58358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_022785	CGG	2	6	58389	58394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_022785	CG	3	6	58397	58402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_022785	CCT	2	6	58417	58422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_022785	CCGGGC	2	12	58603	58614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_022785	CAG	2	6	58622	58627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_022785	TTCC	2	8	58631	58638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_022785	TCCC	2	8	59717	59724	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
515	NC_022785	CCG	2	6	59728	59733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_022785	TAC	2	6	59734	59739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_022785	CAA	2	6	59767	59772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_022785	CGC	2	6	59888	59893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_022785	GTT	2	6	59954	59959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022785	CTG	2	6	60454	60459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_022785	TGCG	2	8	60551	60558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
522	NC_022785	GGC	2	6	60588	60593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022785	TCA	2	6	60599	60604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_022785	AGC	2	6	60617	60622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_022785	CTG	2	6	60703	60708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_022785	AGC	2	6	60711	60716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_022785	CGC	2	6	60750	60755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_022785	GCG	2	6	60761	60766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_022785	CCA	2	6	60768	60773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_022785	GCC	2	6	60785	60790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_022785	TCG	2	6	60973	60978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_022785	GAC	2	6	61024	61029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_022785	TG	3	6	61051	61056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022785	CGG	2	6	61060	61065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_022785	GC	3	6	61254	61259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_022785	GGC	2	6	61266	61271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_022785	CCA	2	6	61295	61300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_022785	TCC	2	6	62720	62725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_022785	AC	3	6	62727	62732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_022785	CGC	2	6	62744	62749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_022785	TCG	2	6	62792	62797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_022785	CCA	2	6	62813	62818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_022785	CCAC	2	8	62864	62871	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
544	NC_022785	CAG	2	6	62888	62893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022785	CGA	2	6	62924	62929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_022785	C	6	6	62938	62943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
547	NC_022785	CTT	2	6	62966	62971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_022785	CG	4	8	63036	63043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_022785	CGG	2	6	63073	63078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022785	ACG	2	6	63129	63134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_022785	TC	3	6	63252	63257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_022785	CGT	2	6	63305	63310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_022785	GTCT	2	8	63345	63352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_022785	GCG	2	6	63367	63372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_022785	GGC	3	9	63397	63405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_022785	GAG	2	6	63425	63430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022785	GCG	2	6	63489	63494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_022785	GCCG	2	8	63592	63599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_022785	CGG	2	6	64350	64355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_022785	AGCCGA	2	12	64374	64385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_022785	GCC	2	6	64387	64392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_022785	CGGC	2	8	64424	64431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_022785	GCGGG	2	10	64434	64443	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
564	NC_022785	GCA	2	6	66529	66534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_022785	CACG	2	8	66569	66576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_022785	CG	3	6	66582	66587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_022785	ACC	2	6	66615	66620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_022785	TTC	2	6	66623	66628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_022785	CGC	2	6	66734	66739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_022785	GC	4	8	66778	66785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_022785	ACC	2	6	66828	66833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_022785	CGG	2	6	66858	66863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_022785	GC	3	6	73059	73064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_022785	CG	3	6	73103	73108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_022785	GTG	2	6	73130	73135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022785	CCGG	2	8	73146	73153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_022785	GGGC	2	8	73160	73167	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
578	NC_022785	TCC	2	6	76367	76372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_022785	CGGG	2	8	96708	96715	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
580	NC_022785	CGA	2	6	96722	96727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_022785	AGGA	2	8	96728	96735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022785	CCAA	2	8	96797	96804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_022785	C	6	6	96886	96891	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
584	NC_022785	GTCG	2	8	96912	96919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
585	NC_022785	TC	3	6	96944	96949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_022785	GC	3	6	96950	96955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
587	NC_022785	CAG	2	6	96976	96981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_022785	GAG	2	6	96998	97003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022785	GGT	2	6	97039	97044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022785	CGG	2	6	97055	97060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_022785	ATG	2	6	97094	97099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022785	CGA	2	6	97167	97172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_022785	GCC	2	6	97179	97184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_022785	CTC	2	6	97247	97252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_022785	AAGG	2	8	99121	99128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022785	GAC	2	6	99165	99170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_022785	CTA	2	6	101405	101410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_022785	CG	3	6	101482	101487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_022785	CGC	2	6	101502	101507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_022785	CCGA	2	8	101515	101522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
601	NC_022785	GCG	2	6	101539	101544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_022785	CG	5	10	101543	101552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_022785	CGAA	2	8	101564	101571	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_022785	CCT	2	6	101595	101600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_022785	GGC	2	6	101616	101621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_022785	GCG	2	6	101654	101659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_022785	CG	3	6	101676	101681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_022785	ACG	2	6	102630	102635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_022785	TC	3	6	104726	104731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_022785	AGG	2	6	104752	104757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022785	CTG	2	6	104779	104784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_022785	CGA	2	6	104798	104803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_022785	AAC	2	6	104812	104817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_022785	CCA	2	6	106232	106237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_022785	ACC	2	6	106240	106245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_022785	CGA	2	6	106248	106253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_022785	CAA	2	6	106254	106259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_022785	CTGA	2	8	106269	106276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_022785	CAT	2	6	106348	106353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_022785	CG	3	6	106356	106361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_022785	GCA	2	6	106362	106367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_022785	GTCG	2	8	106416	106423	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
623	NC_022785	GC	4	8	117504	117511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_022785	GCGT	2	8	117514	117521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_022785	GA	3	6	130105	130110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022785	AGA	2	6	130152	130157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022785	CCG	2	6	130247	130252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_022785	GCC	2	6	130260	130265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_022785	CCG	2	6	130378	130383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_022785	GCCCA	2	10	130396	130405	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
631	NC_022785	GAT	2	6	130424	130429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022785	CCG	2	6	130501	130506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_022785	CA	3	6	130532	130537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_022785	GCC	2	6	130559	130564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_022785	ATC	2	6	130592	130597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_022785	GCCGC	2	10	131524	131533	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
637	NC_022785	GAA	2	6	131542	131547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022785	AG	3	6	134316	134321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022785	TCG	2	6	134342	134347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_022785	GTT	2	6	135149	135154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022785	TTCCT	2	10	135168	135177	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
642	NC_022785	CACC	2	8	135225	135232	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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