MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 51106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_022785	GCG	2	6	12605645	12605650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50502	NC_022785	GGC	2	6	12605697	12605702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50503	NC_022785	AGC	2	6	12605744	12605749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50504	NC_022785	CGC	2	6	12605865	12605870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50505	NC_022785	TCA	2	6	12605888	12605893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50506	NC_022785	TCC	2	6	12605985	12605990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50507	NC_022785	TTCC	2	8	12606015	12606022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50508	NC_022785	ACGTGA	2	12	12606030	12606041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50509	NC_022785	CTG	2	6	12606102	12606107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50510	NC_022785	TCA	2	6	12606132	12606137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50511	NC_022785	TCC	2	6	12606219	12606224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50512	NC_022785	CGG	2	6	12606456	12606461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50513	NC_022785	GTT	2	6	12606485	12606490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50514	NC_022785	GCGCTC	2	12	12606500	12606511	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50515	NC_022785	GGC	2	6	12606532	12606537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50516	NC_022785	CAC	2	6	12606572	12606577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50517	NC_022785	GCG	2	6	12606653	12606658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50518	NC_022785	GCG	2	6	12606679	12606684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50519	NC_022785	CGC	2	6	12606702	12606707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50520	NC_022785	CGGG	2	8	12606818	12606825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50521	NC_022785	CG	3	6	12606925	12606930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50522	NC_022785	GCA	2	6	12607892	12607897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50523	NC_022785	GGTC	2	8	12607916	12607923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50524	NC_022785	CGAAT	2	10	12607949	12607958	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50525	NC_022785	TGG	2	6	12607982	12607987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50526	NC_022785	ACC	2	6	12608049	12608054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50527	NC_022785	GCT	2	6	12608057	12608062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50528	NC_022785	GACT	2	8	12608122	12608129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50529	NC_022785	CGGC	2	8	12608480	12608487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50530	NC_022785	ATC	2	6	12608608	12608613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50531	NC_022785	CCG	2	6	12608634	12608639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50532	NC_022785	TGC	2	6	12608734	12608739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50533	NC_022785	CGG	2	6	12608895	12608900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50534	NC_022785	CAG	2	6	12608929	12608934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50535	NC_022785	CGAT	2	8	12608937	12608944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50536	NC_022785	GCC	2	6	12608951	12608956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50537	NC_022785	CGC	2	6	12609767	12609772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50538	NC_022785	CCA	2	6	12609786	12609791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50539	NC_022785	GCA	2	6	12609830	12609835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50540	NC_022785	GAC	2	6	12609869	12609874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50541	NC_022785	GACGG	2	10	12609968	12609977	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50542	NC_022785	TGC	2	6	12609989	12609994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50543	NC_022785	CGG	2	6	12610009	12610014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50544	NC_022785	GGT	2	6	12610041	12610046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50545	NC_022785	ACC	3	9	12610048	12610056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50546	NC_022785	GTG	2	6	12611672	12611677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50547	NC_022785	AC	3	6	12611747	12611752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50548	NC_022785	TCC	2	6	12611761	12611766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50549	NC_022785	CA	3	6	12611797	12611802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50550	NC_022785	CCA	2	6	12611830	12611835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50551	NC_022785	ACGA	2	8	12611894	12611901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50552	NC_022785	ACCT	2	8	12611955	12611962	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50553	NC_022785	CGA	2	6	12612101	12612106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50554	NC_022785	ACG	2	6	12612109	12612114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50555	NC_022785	GTC	2	6	12612126	12612131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50556	NC_022785	CGCGT	2	10	12612214	12612223	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50557	NC_022785	TCC	2	6	12612248	12612253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50558	NC_022785	CCA	2	6	12612291	12612296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50559	NC_022785	GGC	2	6	12612333	12612338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50560	NC_022785	CGG	2	6	12612383	12612388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50561	NC_022785	CAGG	2	8	12612430	12612437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50562	NC_022785	GCG	2	6	12612460	12612465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50563	NC_022785	TGG	2	6	12612485	12612490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50564	NC_022785	CTG	2	6	12612524	12612529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50565	NC_022785	CG	3	6	12612586	12612591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50566	NC_022785	CCG	2	6	12612612	12612617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50567	NC_022785	GCC	2	6	12612661	12612666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50568	NC_022785	GAC	2	6	12612687	12612692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50569	NC_022785	CGG	2	6	12612703	12612708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50570	NC_022785	CCG	2	6	12612721	12612726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50571	NC_022785	CCAGG	2	10	12612727	12612736	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50572	NC_022785	CGG	2	6	12612741	12612746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50573	NC_022785	GCA	2	6	12612844	12612849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50574	NC_022785	CAT	2	6	12612924	12612929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50575	NC_022785	CTG	2	6	12613061	12613066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50576	NC_022785	CCA	2	6	12613113	12613118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50577	NC_022785	CGA	2	6	12613135	12613140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50578	NC_022785	TCG	2	6	12613203	12613208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50579	NC_022785	GGC	2	6	12613262	12613267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50580	NC_022785	GACG	2	8	12613327	12613334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50581	NC_022785	ACC	2	6	12613410	12613415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50582	NC_022785	GAC	2	6	12613418	12613423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50583	NC_022785	CGA	2	6	12613438	12613443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50584	NC_022785	ACC	2	6	12613481	12613486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50585	NC_022785	CGA	2	6	12613498	12613503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50586	NC_022785	GCT	2	6	12613606	12613611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50587	NC_022785	CAC	2	6	12613622	12613627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50588	NC_022785	CGA	2	6	12613634	12613639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50589	NC_022785	CTT	2	6	12613643	12613648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50590	NC_022785	CAT	2	6	12613664	12613669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50591	NC_022785	CGA	2	6	12613689	12613694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50592	NC_022785	ACC	2	6	12613701	12613706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50593	NC_022785	GCC	2	6	12613729	12613734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50594	NC_022785	CG	3	6	12613758	12613763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50595	NC_022785	GAC	2	6	12614338	12614343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50596	NC_022785	CGT	2	6	12614346	12614351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50597	NC_022785	GCC	2	6	12614368	12614373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50598	NC_022785	CGA	2	6	12614379	12614384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50599	NC_022785	TCG	3	9	12614396	12614404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50600	NC_022785	ACC	2	6	12614405	12614410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50601	NC_022785	CGA	2	6	12614418	12614423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50602	NC_022785	GTC	2	6	12614434	12614439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50603	NC_022785	ACGA	2	8	12614462	12614469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50604	NC_022785	CCA	2	6	12614497	12614502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50605	NC_022785	GAA	2	6	12614593	12614598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50606	NC_022785	GACT	2	8	12614634	12614641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50607	NC_022785	CT	3	6	12615159	12615164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50608	NC_022785	ACGC	2	8	12615238	12615245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50609	NC_022785	TCCT	2	8	12615610	12615617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50610	NC_022785	CGG	2	6	12615676	12615681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50611	NC_022785	C	6	6	12615721	12615726	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50612	NC_022785	CGGC	2	8	12615758	12615765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50613	NC_022785	GC	4	8	12615764	12615771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50614	NC_022785	GAG	2	6	12615786	12615791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50615	NC_022785	CCG	2	6	12615824	12615829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50616	NC_022785	G	6	6	12615857	12615862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50617	NC_022785	GGGCC	2	10	12618079	12618088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50618	NC_022785	GGCCC	2	10	12618097	12618106	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50619	NC_022785	GCG	2	6	12618130	12618135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50620	NC_022785	CAGT	2	8	12618140	12618147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50621	NC_022785	GCCG	2	8	12618161	12618168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50622	NC_022785	ACA	2	6	12618182	12618187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50623	NC_022785	CGA	2	6	12618189	12618194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50624	NC_022785	CGG	2	6	12618206	12618211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50625	NC_022785	CTG	2	6	12618223	12618228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50626	NC_022785	TCCGG	2	10	12618230	12618239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50627	NC_022785	GGGGC	2	10	12618254	12618263	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
50628	NC_022785	GGC	2	6	12618291	12618296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50640	NC_022785	CGG	2	6	12618632	12618637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50642	NC_022785	CT	3	6	12618695	12618700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50643	NC_022785	TG	3	6	12618704	12618709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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50730	NC_022785	CCCG	2	8	12637715	12637722	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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50736	NC_022785	GAT	2	6	12637908	12637913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50739	NC_022785	CCCG	2	8	12638759	12638766	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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50993	NC_022785	ATG	2	6	12668236	12668241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50994	NC_022785	TCCGA	2	10	12669857	12669866	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50995	NC_022785	GTG	2	6	12669878	12669883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50996	NC_022785	TGAC	2	8	12669909	12669916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50997	NC_022785	AGG	2	6	12669918	12669923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50998	NC_022785	GCA	2	6	12669934	12669939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50999	NC_022785	AGC	2	6	12669953	12669958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51000	NC_022785	GC	3	6	12669979	12669984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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