MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022665	AAAG	2	8	2826	2833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022665	TTGG	2	8	5629	5636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022665	TTAT	2	8	15779	15786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022665	GTGA	2	8	17387	17394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022665	AGCG	2	8	17558	17565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022665	AGCC	2	8	18440	18447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022665	GTAA	2	8	18905	18912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022665	TCAC	2	8	18962	18969	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022665	GCGA	2	8	19061	19068	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022665	ATTC	2	8	19927	19934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022665	CTAA	2	8	20283	20290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022665	TAGG	2	8	20939	20946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022665	AATC	2	8	22187	22194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022665	GCGT	2	8	23098	23105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022665	TTTG	2	8	26286	26293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022665	ATTT	2	8	27353	27360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022665	ATTT	2	8	45521	45528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022665	AATA	2	8	45532	45539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022665	AGCT	2	8	45636	45643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022665	TAAG	2	8	45698	45705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022665	GTTT	2	8	45859	45866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022665	CATT	2	8	47483	47490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022665	AATA	2	8	47714	47721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022665	ATCT	2	8	47736	47743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022665	ATCA	2	8	49528	49535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022665	ATTG	2	8	49909	49916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022665	ATTG	2	8	50223	50230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022665	GAAA	2	8	50259	50266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022665	AAGG	2	8	56070	56077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022665	TCTT	2	8	56145	56152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022665	GTTA	2	8	57103	57110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022665	AATA	2	8	58412	58419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022665	GAAG	2	8	63040	63047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022665	TCAG	2	8	63374	63381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022665	CTGG	2	8	65117	65124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022665	GAAT	2	8	69566	69573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022665	AAAC	2	8	75820	75827	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022665	AAAC	2	8	75861	75868	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022665	CTGC	2	8	77065	77072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022665	TACA	2	8	79727	79734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022665	TTAT	2	8	86140	86147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022665	GTGA	2	8	87743	87750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022665	AGCG	2	8	87914	87921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022665	AGCC	2	8	88796	88803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022665	GTAA	2	8	89261	89268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022665	TCAC	2	8	89318	89325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022665	GCGA	2	8	89417	89424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022665	ATTC	2	8	90283	90290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022665	CTAA	2	8	90639	90646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022665	TAGG	2	8	91295	91302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022665	GCGT	2	8	92785	92792	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022665	TAAG	2	8	93695	93702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022665	AATG	2	8	94112	94119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022665	TAAT	2	8	94144	94151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022665	GCTG	2	8	94631	94638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022665	TTTA	2	8	94849	94856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022665	TACT	2	8	94960	94967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022665	TTAA	2	8	95032	95039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022665	TCTT	2	8	98565	98572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022665	CGAG	2	8	99512	99519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022665	ATGG	2	8	108702	108709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022665	ATCC	2	8	108839	108846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022665	GAAA	2	8	112570	112577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022665	AACT	2	8	120004	120011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022665	TTTG	2	8	123600	123607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022665	TCTA	2	8	123857	123864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_022665	AATA	2	8	127052	127059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022665	CAAT	2	8	131263	131270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022665	TCTA	2	8	133608	133615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022665	ACCT	2	8	133617	133624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022665	AAAC	2	8	134033	134040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022665	AAAT	2	8	134364	134371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022665	TTTG	2	8	134394	134401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022665	ATAG	2	8	134430	134437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022665	AAAG	2	8	134575	134582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022665	AGAA	2	8	135597	135604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022665	CTAT	2	8	135698	135705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022665	ATGT	2	8	136535	136542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022665	CTTT	2	8	144781	144788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022665	AAAG	2	8	145357	145364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022665	GAAA	2	8	160354	160361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022665	GTAG	2	8	160362	160369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022665	TTCA	2	8	168375	168382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_022665	TTGT	2	8	170588	170595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022665	GTCT	2	8	175298	175305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_022665	ATTT	2	8	180003	180010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022665	GGAC	2	8	180750	180757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022665	GTGG	2	8	180795	180802	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022665	ATAA	2	8	180872	180879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022665	CATC	2	8	180956	180963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022665	AAAT	2	8	183501	183508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022665	AAAT	2	8	183563	183570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022665	TAGT	2	8	185355	185362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022665	ATAA	2	8	187497	187504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022665	GTTG	2	8	189391	189398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022665	AAAT	3	12	190695	190706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022665	TAAA	2	8	190729	190736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022665	ATTT	2	8	194054	194061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022665	ATAG	2	8	194085	194092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022665	ATTT	2	8	194101	194108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022665	ATTT	2	8	194122	194129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022665	TAAT	2	8	194198	194205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022665	TCTT	2	8	200490	200497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022665	CTTG	2	8	203616	203623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022665	TTGT	2	8	208637	208644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022665	GAGT	2	8	211273	211280	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022665	CAGT	2	8	214162	214169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022665	CAAG	2	8	216098	216105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_022665	AAAT	2	8	216249	216256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022665	TGAC	2	8	216763	216770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022665	CCAA	2	8	216773	216780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022665	TTGA	2	8	216935	216942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022665	AGTA	2	8	224107	224114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022665	CTAT	2	8	227899	227906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022665	AAGA	2	8	230944	230951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022665	TAAA	2	8	234268	234275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022665	GTTT	2	8	239061	239068	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022665	AAGA	2	8	239083	239090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022665	TCAA	2	8	244624	244631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022665	CGGA	2	8	244804	244811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022665	CCTA	2	8	244906	244913	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022665	AAAT	2	8	250521	250528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022665	ATAA	2	8	250550	250557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022665	GGAA	2	8	255291	255298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022665	TAGT	2	8	255371	255378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022665	GCTG	2	8	258652	258659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022665	GGAA	2	8	259529	259536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022665	AAAG	2	8	259585	259592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022665	ATTT	2	8	262698	262705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022665	AATG	2	8	266908	266915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022665	AGAA	2	8	267012	267019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022665	CAAA	2	8	267060	267067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022665	TTGA	2	8	270180	270187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022665	TAGG	2	8	270343	270350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022665	TTGT	2	8	270448	270455	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022665	TCTA	2	8	270533	270540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022665	ATTT	2	8	272095	272102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022665	GTTT	2	8	272128	272135	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022665	AAAG	2	8	289118	289125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022665	CAAC	2	8	289141	289148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022665	AATC	2	8	292800	292807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022665	AAAG	2	8	297296	297303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022665	CTTT	2	8	300065	300072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022665	GTCA	2	8	308828	308835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022665	CAAT	2	8	329093	329100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022665	AAAG	2	8	331522	331529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022665	CAAA	2	8	340703	340710	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_022665	TTTC	2	8	340743	340750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022665	ATGG	2	8	340898	340905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022665	GTGA	2	8	342368	342375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022665	AGCG	2	8	342539	342546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_022665	AGCC	2	8	343422	343429	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022665	GTAA	2	8	343887	343894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022665	TCAC	2	8	343944	343951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_022665	GCGA	2	8	344043	344050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_022665	ATTC	2	8	344909	344916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_022665	CTAA	2	8	345265	345272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_022665	TAGG	2	8	345921	345928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022665	TTGT	2	8	348188	348195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022665	TTTC	2	8	351263	351270	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_022665	ACGA	2	8	354729	354736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_022665	TTGT	2	8	354833	354840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022665	AGAT	2	8	357936	357943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_022665	ATTT	2	8	380453	380460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022665	TTGA	2	8	386588	386595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_022665	AAAT	2	8	401306	401313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_022665	GCTT	2	8	406378	406385	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_022665	TTCT	2	8	1272312	1272319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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