MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 6719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022665	A	6	6	429722	429727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_022665	A	6	6	429733	429738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_022665	GTT	2	6	429777	429782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_022665	AGA	2	6	429820	429825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_022665	ACAAA	2	10	429872	429881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1506	NC_022665	GGC	2	6	429965	429970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_022665	GCA	2	6	430284	430289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_022665	G	6	6	430309	430314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_022665	CGC	2	6	430331	430336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_022665	GTGA	2	8	430337	430344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_022665	TGT	2	6	430370	430375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_022665	AGA	2	6	430379	430384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_022665	AGA	2	6	430391	430396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_022665	CAG	2	6	430453	430458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_022665	AGCG	2	8	430508	430515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_022665	AT	3	6	430637	430642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_022665	GGA	2	6	430643	430648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_022665	CT	3	6	430668	430673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_022665	GAA	2	6	430907	430912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_022665	GGT	2	6	430981	430986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_022665	GTC	2	6	430995	431000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_022665	TCGTG	2	10	431004	431013	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1523	NC_022665	CAT	2	6	431063	431068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_022665	TAA	2	6	431098	431103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_022665	GGA	2	6	431107	431112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_022665	ATC	2	6	431131	431136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_022665	AC	3	6	431158	431163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_022665	CGC	2	6	431297	431302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_022665	AC	3	6	431327	431332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_022665	CAC	2	6	431342	431347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_022665	AGCC	2	8	431390	431397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_022665	GAT	2	6	431413	431418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_022665	CCT	2	6	431469	431474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_022665	TCT	2	6	431504	431509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_022665	AGG	2	6	431570	431575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_022665	AAC	2	6	431605	431610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_022665	GTT	2	6	431615	431620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_022665	A	6	6	431750	431755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_022665	TAA	2	6	431762	431767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_022665	GTTAA	2	10	431769	431778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_022665	AAC	2	6	431831	431836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_022665	GTAA	2	8	431855	431862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_022665	TCAC	2	8	431912	431919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_022665	TAG	2	6	432003	432008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_022665	GCGA	2	8	432011	432018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_022665	AGG	2	6	432025	432030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_022665	GAG	2	6	432038	432043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_022665	CTC	2	6	432048	432053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_022665	AGA	2	6	432090	432095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_022665	AG	3	6	432118	432123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_022665	TCG	2	6	432193	432198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_022665	GGA	2	6	432206	432211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_022665	CT	3	6	432232	432237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_022665	ACA	2	6	432324	432329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_022665	ATG	2	6	432391	432396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_022665	TAT	2	6	432456	432461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_022665	GGA	2	6	432524	432529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_022665	TC	3	6	432610	432615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_022665	ACC	2	6	432790	432795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_022665	AAT	2	6	432810	432815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_022665	AGC	2	6	432870	432875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_022665	ATTC	2	8	432877	432884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_022665	TG	3	6	433001	433006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_022665	AAG	2	6	433007	433012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_022665	GAG	2	6	433022	433027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_022665	GA	3	6	433152	433157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_022665	ACA	2	6	433178	433183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_022665	CTAA	2	8	433233	433240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_022665	GA	3	6	433448	433453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_022665	CT	3	6	433564	433569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_022665	GAT	2	6	433582	433587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_022665	AGG	2	6	433627	433632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_022665	CGG	2	6	433673	433678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_022665	GA	3	6	433771	433776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_022665	TAGG	2	8	433889	433896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_022665	TAC	2	6	433943	433948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_022665	CCT	2	6	434031	434036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_022665	GGT	2	6	434167	434172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_022665	TCG	2	6	434282	434287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_022665	CGT	2	6	434362	434367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_022665	GA	3	6	434586	434591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_022665	TGGAAG	2	12	434609	434620	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_022665	T	6	6	434749	434754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_022665	AGT	2	6	434855	434860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_022665	CAG	2	6	434906	434911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_022665	AGT	2	6	434933	434938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_022665	G	6	6	434940	434945	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_022665	AATC	2	8	435139	435146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_022665	ATAGA	2	10	435333	435342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_022665	ACC	2	6	435457	435462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_022665	CGT	2	6	435494	435499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_022665	AGCTC	2	10	435743	435752	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1593	NC_022665	ATT	2	6	435808	435813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_022665	AG	3	6	435817	435822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_022665	T	7	7	435834	435840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_022665	AG	3	6	435884	435889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_022665	TTGAG	2	10	436158	436167	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_022665	TCT	2	6	436193	436198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_022665	A	6	6	436200	436205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_022665	T	6	6	436294	436299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_022665	ATT	3	9	437715	437723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_022665	ATA	2	6	438560	438565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_022665	ATTGTA	2	12	438576	438587	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_022665	AGAAA	2	10	439142	439151	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_022665	T	6	6	439168	439173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_022665	AGG	2	6	439184	439189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_022665	AT	3	6	439551	439556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_022665	AGG	2	6	439601	439606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_022665	TGA	2	6	440389	440394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_022665	GTTTC	2	10	440413	440422	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_022665	A	7	7	440453	440459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_022665	TCCT	2	8	441200	441207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_022665	TTA	2	6	441217	441222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_022665	TGA	2	6	441235	441240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_022665	A	6	6	441246	441251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_022665	A	7	7	441312	441318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_022665	GGA	2	6	441389	441394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_022665	GAA	2	6	443205	443210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_022665	AGG	2	6	443737	443742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_022665	AG	3	6	445897	445902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_022665	GATTT	2	10	445933	445942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_022665	TAA	2	6	447102	447107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022665	GT	3	6	447112	447117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_022665	GGT	2	6	447882	447887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022665	TGA	2	6	447923	447928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022665	ATCT	2	8	447957	447964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_022665	GGT	2	6	447972	447977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022665	GACT	2	8	449016	449023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_022665	A	6	6	449111	449116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_022665	TAA	2	6	453281	453286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_022665	AAG	2	6	453290	453295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_022665	T	6	6	455808	455813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_022665	CAG	2	6	455855	455860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_022665	G	7	7	455860	455866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_022665	ATTA	2	8	455913	455920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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