MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 6719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022665	GGAA	2	8	259529	259536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022665	AAAG	2	8	259585	259592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022665	T	6	6	260918	260923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022665	TCA	2	6	262506	262511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022665	GTGATA	2	12	262512	262523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_022665	GTT	2	6	262564	262569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022665	T	7	7	262627	262633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022665	GGT	2	6	262664	262669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022665	ATTT	2	8	262698	262705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_022665	A	6	6	262745	262750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022665	TGT	2	6	262785	262790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022665	TCC	2	6	263148	263153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_022665	T	6	6	263176	263181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022665	T	6	6	263234	263239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022665	GTAAA	2	10	263240	263249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_022665	T	6	6	263263	263268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022665	A	6	6	263270	263275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022665	TCC	2	6	263310	263315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_022665	A	7	7	263348	263354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022665	AT	5	10	263375	263384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022665	T	7	7	264135	264141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022665	AGG	2	6	264147	264152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022665	G	6	6	264267	264272	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022665	TCTGC	2	10	264326	264335	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_022665	A	6	6	264343	264348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022665	ATAAA	2	10	264361	264370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022665	GCT	2	6	265690	265695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_022665	TTTTA	2	10	265699	265708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_022665	A	6	6	265715	265720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022665	CTT	2	6	265739	265744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_022665	CCT	2	6	266797	266802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_022665	AAG	2	6	266897	266902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_022665	AATG	2	8	266908	266915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022665	TAC	2	6	266940	266945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_022665	A	7	7	266955	266961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022665	AGAA	2	8	267012	267019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022665	CAAA	2	8	267060	267067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_022665	A	6	6	267132	267137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_022665	A	6	6	267142	267147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022665	AAATA	2	10	267166	267175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022665	A	6	6	267175	267180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022665	TAG	2	6	267181	267186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022665	GGA	2	6	267231	267236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_022665	CTTCGT	2	12	269997	270008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_022665	ATT	2	6	270038	270043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022665	CT	3	6	270120	270125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_022665	GTT	2	6	270160	270165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022665	TTC	2	6	270173	270178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_022665	TTGA	2	8	270180	270187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_022665	ATC	2	6	270274	270279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_022665	TGA	2	6	270283	270288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_022665	A	6	6	270334	270339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_022665	TAGG	2	8	270343	270350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022665	TTGT	2	8	270448	270455	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022665	TGG	2	6	270466	270471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022665	TCTA	2	8	270533	270540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_022665	TAGAA	2	10	270569	270578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_022665	A	6	6	270577	270582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022665	T	6	6	270587	270592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022665	ATTT	2	8	272095	272102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_022665	GTTT	2	8	272128	272135	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022665	TTAAA	2	10	272148	272157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022665	ATAAA	2	10	272219	272228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022665	A	7	7	272226	272232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022665	TAG	2	6	279605	279610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022665	TA	3	6	279612	279617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022665	GT	3	6	279846	279851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022665	TAG	2	6	279878	279883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022665	TAA	2	6	284122	284127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022665	CT	3	6	285595	285600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_022665	AAAG	2	8	289118	289125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_022665	CAAC	2	8	289141	289148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_022665	ATA	2	6	289151	289156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022665	TAGAAA	2	12	289189	289200	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022665	TAGCCG	2	12	289228	289239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_022665	AGA	2	6	289243	289248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022665	ATAAA	2	10	289322	289331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_022665	AGA	2	6	289341	289346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_022665	T	7	7	291003	291009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022665	T	7	7	291771	291777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_022665	T	6	6	292708	292713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022665	T	6	6	292736	292741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_022665	TA	3	6	292758	292763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_022665	GCTAAA	2	12	292788	292799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1085	NC_022665	AATC	2	8	292800	292807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_022665	A	7	7	294406	294412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_022665	AC	3	6	294479	294484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_022665	T	6	6	296383	296388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022665	TCT	2	6	296419	296424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_022665	CTT	2	6	296478	296483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_022665	TAG	2	6	296490	296495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022665	GAG	2	6	296620	296625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_022665	T	6	6	296627	296632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_022665	GAAAG	2	10	297250	297259	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_022665	AAAG	2	8	297296	297303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_022665	CCT	2	6	297358	297363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_022665	GT	3	6	297365	297370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022665	AC	3	6	297374	297379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_022665	ACT	2	6	298606	298611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_022665	G	9	9	298699	298707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022665	A	7	7	298772	298778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022665	A	6	6	299986	299991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022665	CCT	2	6	299995	300000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_022665	TA	3	6	300012	300017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_022665	T	6	6	300020	300025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022665	CTTT	2	8	300065	300072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_022665	A	6	6	300078	300083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022665	T	6	6	307696	307701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022665	ATT	2	6	307709	307714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022665	TGG	2	6	307751	307756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022665	ACG	2	6	308774	308779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_022665	TAA	2	6	308780	308785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_022665	A	6	6	308789	308794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022665	GTCA	2	8	308828	308835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_022665	TTA	2	6	309974	309979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022665	ATC	2	6	310019	310024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_022665	TCA	2	6	310056	310061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_022665	ATT	3	9	311333	311341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022665	ATA	2	6	311350	311355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022665	ATT	2	6	311367	311372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022665	AAT	2	6	311380	311385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022665	T	6	6	311402	311407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022665	A	6	6	311408	311413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022665	AAT	2	6	311415	311420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022665	ACC	2	6	311427	311432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_022665	TCC	2	6	313944	313949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_022665	TTA	2	6	313955	313960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022665	AGT	2	6	317258	317263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022665	GAA	2	6	317328	317333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_022665	AG	3	6	317413	317418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022665	T	6	6	317423	317428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022665	CTT	2	6	318287	318292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_022665	A	7	7	318309	318315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_022665	AAG	2	6	318495	318500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022665	AGAAT	2	10	319048	319057	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022665	AGA	2	6	319065	319070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022665	ATG	2	6	323014	323019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022665	ACTAA	2	10	323034	323043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1140	NC_022665	GAT	2	6	323093	323098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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