MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 6719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022665	CATGA	2	10	123295	123304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
502	NC_022665	TTA	2	6	123305	123310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022665	AG	3	6	123416	123421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022665	GA	3	6	123424	123429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022665	TTA	2	6	123472	123477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022665	TTTG	2	8	123600	123607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022665	TAT	2	6	123828	123833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022665	TCTA	2	8	123857	123864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_022665	T	6	6	123865	123870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022665	GTG	2	6	123884	123889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022665	CAG	2	6	124569	124574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_022665	A	6	6	124604	124609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022665	AGA	2	6	126214	126219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022665	AATA	2	8	127052	127059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022665	AGG	2	6	127063	127068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022665	CTATA	2	10	127516	127525	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_022665	CGA	2	6	127564	127569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_022665	T	6	6	127579	127584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022665	A	7	7	127846	127852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022665	A	6	6	127934	127939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022665	AGG	2	6	128022	128027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022665	T	7	7	129983	129989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022665	TC	3	6	130068	130073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_022665	AC	3	6	130113	130118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_022665	A	6	6	130156	130161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022665	TA	3	6	130162	130167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022665	TAAGAT	2	12	131196	131207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022665	GAAGC	2	10	131242	131251	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
529	NC_022665	CAAT	2	8	131263	131270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_022665	TCTA	2	8	133608	133615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_022665	ACCT	2	8	133617	133624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_022665	T	7	7	133636	133642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022665	ACG	2	6	133646	133651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_022665	CA	3	6	133659	133664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_022665	ATACTC	2	12	133675	133686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_022665	TGA	2	6	133722	133727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022665	AGT	2	6	133786	133791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022665	CGA	2	6	133808	133813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_022665	AAAC	2	8	134033	134040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_022665	TA	3	6	134054	134059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022665	A	6	6	134117	134122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022665	TGT	2	6	134199	134204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022665	CTG	2	6	134236	134241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_022665	CAA	2	6	134287	134292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022665	TTG	2	6	134307	134312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022665	AAAT	2	8	134364	134371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022665	ATT	2	6	134379	134384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022665	TTTG	2	8	134394	134401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022665	A	6	6	134413	134418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022665	ATAG	2	8	134430	134437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022665	AGA	2	6	134443	134448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022665	AGT	2	6	134496	134501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022665	AGG	2	6	134522	134527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022665	TGA	2	6	134540	134545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022665	AAAG	2	8	134575	134582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022665	A	7	7	134598	134604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022665	TAG	2	6	134618	134623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022665	CT	3	6	134791	134796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_022665	AAG	2	6	134807	134812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022665	GAT	2	6	134823	134828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022665	TGA	2	6	134871	134876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022665	A	6	6	134878	134883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022665	CAA	2	6	134925	134930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022665	A	6	6	134971	134976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022665	CAA	2	6	134986	134991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_022665	TGG	2	6	134997	135002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022665	ATG	2	6	135123	135128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022665	AAG	2	6	135213	135218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022665	AGA	2	6	135283	135288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022665	A	7	7	135433	135439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022665	AGA	2	6	135459	135464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022665	ACG	2	6	135558	135563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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574	NC_022665	AGA	2	6	135676	135681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022665	CTAT	2	8	135698	135705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_022665	GCAGT	2	10	135746	135755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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578	NC_022665	A	6	6	135788	135793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_022665	ATCCA	2	10	135857	135866	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
581	NC_022665	GAA	2	6	135869	135874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022665	TCT	2	6	135883	135888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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585	NC_022665	GAA	2	6	136079	136084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022665	TGA	2	6	136156	136161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_022665	AGA	2	6	136192	136197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022665	TAA	2	6	136210	136215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022665	GGC	2	6	136228	136233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_022665	CTA	2	6	136267	136272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_022665	GGT	2	6	136316	136321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022665	A	6	6	136349	136354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022665	TACGA	2	10	136358	136367	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
595	NC_022665	CAC	2	6	136408	136413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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598	NC_022665	AAC	2	6	136472	136477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_022665	AAG	2	6	136521	136526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022665	ATGT	2	8	136535	136542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022665	AGA	2	6	136549	136554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022665	A	6	6	136627	136632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022665	A	6	6	136661	136666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022665	TTAAG	2	10	136690	136699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022665	ACC	2	6	136716	136721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_022665	T	6	6	136756	136761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022665	T	6	6	136771	136776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022665	TA	3	6	136821	136826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022665	AGG	2	6	136925	136930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_022665	AAG	2	6	138026	138031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022665	GTT	2	6	138046	138051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022665	A	7	7	138124	138130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022665	A	6	6	138145	138150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022665	GTAAA	2	10	138172	138181	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022665	TGC	2	6	139819	139824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_022665	GGT	2	6	139840	139845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022665	AGA	2	6	139889	139894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022665	A	6	6	140030	140035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022665	A	7	7	140045	140051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022665	GTT	2	6	140055	140060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022665	A	9	9	140790	140798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022665	T	6	6	142600	142605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022665	AGT	2	6	142702	142707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022665	T	6	6	142782	142787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022665	ATAAA	2	10	142810	142819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022665	GTA	2	6	144769	144774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022665	CTTT	2	8	144781	144788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_022665	A	6	6	144805	144810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022665	GT	3	6	145013	145018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022665	ACTAAG	2	12	145026	145037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
632	NC_022665	GTGAC	2	10	145076	145085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
633	NC_022665	CTA	2	6	145120	145125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_022665	ATT	2	6	145149	145154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022665	A	6	6	145157	145162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022665	AG	3	6	145183	145188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022665	TAA	2	6	145333	145338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022665	AAAG	2	8	145357	145364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022665	A	6	6	148440	148445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022665	A	6	6	148448	148453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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