MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 6719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022665	A	6	6	1649996	1650001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_022665	CTA	2	6	1653368	1653373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_022665	AAT	2	6	1653429	1653434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_022665	TGA	2	6	1653545	1653550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_022665	ATA	2	6	1653566	1653571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_022665	TTTC	2	8	1653597	1653604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_022665	AGG	2	6	1653709	1653714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_022665	TTG	2	6	1653723	1653728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_022665	TC	3	6	1653776	1653781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_022665	GAT	2	6	1653816	1653821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_022665	CAA	3	9	1653900	1653908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_022665	T	6	6	1653931	1653936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_022665	CAT	2	6	1653978	1653983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5015	NC_022665	CTA	2	6	1654067	1654072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_022665	TAC	2	6	1654086	1654091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_022665	T	6	6	1654212	1654217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_022665	GAT	2	6	1654274	1654279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_022665	CAA	2	6	1654280	1654285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_022665	TGC	2	6	1654293	1654298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_022665	TAA	2	6	1654314	1654319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_022665	CAA	2	6	1654353	1654358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_022665	TGA	2	6	1654473	1654478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_022665	CTG	2	6	1654505	1654510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_022665	T	6	6	1654512	1654517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5028	NC_022665	TCTT	2	8	1654701	1654708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_022665	CCAA	2	8	1654772	1654779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_022665	T	6	6	1654788	1654793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_022665	AT	3	6	1654818	1654823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_022665	TGA	2	6	1654934	1654939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_022665	AAT	2	6	1654998	1655003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_022665	TCCC	2	8	1655019	1655026	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5035	NC_022665	T	11	11	1655043	1655053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_022665	GAAAA	2	10	1655054	1655063	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_022665	ACC	2	6	1655498	1655503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_022665	CT	3	6	1655515	1655520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_022665	A	6	6	1655545	1655550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_022665	A	7	7	1656336	1656342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_022665	TCTT	2	8	1656410	1656417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_022665	A	6	6	1656423	1656428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_022665	AAT	2	6	1656434	1656439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_022665	AT	3	6	1657703	1657708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_022665	TAT	2	6	1660358	1660363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_022665	T	6	6	1660513	1660518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_022665	AC	3	6	1660539	1660544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_022665	ATC	2	6	1660547	1660552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5053	NC_022665	ATT	2	6	1660658	1660663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_022665	CTA	2	6	1660681	1660686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5057	NC_022665	ATA	2	6	1660819	1660824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_022665	TAT	3	9	1660842	1660850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_022665	T	6	6	1660863	1660868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_022665	GAA	2	6	1660893	1660898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5063	NC_022665	TGTAG	2	10	1661003	1661012	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_022665	ACT	2	6	1661016	1661021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5066	NC_022665	A	6	6	1661169	1661174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_022665	AGT	2	6	1661406	1661411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_022665	T	7	7	1661515	1661521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_022665	A	8	8	1661558	1661565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_022665	AAATC	2	10	1661635	1661644	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5075	NC_022665	ATT	2	6	1661653	1661658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_022665	A	6	6	1661786	1661791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_022665	A	6	6	1675221	1675226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_022665	A	6	6	1677267	1677272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_022665	T	7	7	1680357	1680363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_022665	A	8	8	1680404	1680411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_022665	A	7	7	1680811	1680817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_022665	TGA	2	6	1680854	1680859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_022665	T	8	8	1681409	1681416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_022665	TCAATC	2	12	1681972	1681983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5094	NC_022665	TCA	2	6	1682499	1682504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_022665	TA	6	12	1683029	1683040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_022665	AT	3	6	1683058	1683063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_022665	TA	5	10	1683081	1683090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_022665	AAT	3	9	1683091	1683099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_022665	TAG	2	6	1683105	1683110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_022665	CT	3	6	1685363	1685368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_022665	TCA	2	6	1685496	1685501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5106	NC_022665	ATA	2	6	1687600	1687605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5108	NC_022665	TAT	2	6	1687880	1687885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_022665	TTA	2	6	1687914	1687919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_022665	TAC	2	6	1687939	1687944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_022665	T	7	7	1688027	1688033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_022665	ATTC	2	8	1692084	1692091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_022665	TA	3	6	1692377	1692382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_022665	TA	3	6	1692398	1692403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_022665	TTTATT	2	12	1692426	1692437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_022665	T	6	6	1692466	1692471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5119	NC_022665	AAAT	2	8	1692501	1692508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_022665	T	7	7	1693221	1693227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_022665	CAA	2	6	1693277	1693282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_022665	TAAAT	2	10	1693283	1693292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_022665	T	6	6	1693294	1693299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_022665	GT	3	6	1693330	1693335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_022665	GAG	2	6	1694100	1694105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_022665	AAT	2	6	1694127	1694132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_022665	A	6	6	1695189	1695194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_022665	A	6	6	1696371	1696376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_022665	TCC	2	6	1696712	1696717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_022665	AAT	2	6	1696718	1696723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_022665	TTA	2	6	1696732	1696737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_022665	TA	3	6	1696746	1696751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_022665	A	6	6	1699075	1699080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5241	NC_022665	TTTAA	2	10	1713802	1713811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_022665	TCA	2	6	1716427	1716432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_022665	CAA	2	6	1716441	1716446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_022665	T	6	6	1719478	1719483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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