MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 8581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022655	ATC	2	6	206921	206926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_022655	ACC	2	6	206933	206938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_022655	AGA	2	6	206978	206983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022655	CAG	2	6	206995	207000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022655	ACC	2	6	207218	207223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_022655	CTT	2	6	207247	207252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_022655	T	6	6	207266	207271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022655	TTC	2	6	207323	207328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_022655	ACC	2	6	207389	207394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_022655	AGA	2	6	207434	207439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022655	AGC	2	6	207443	207448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_022655	ATA	2	6	207449	207454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022655	ATG	2	6	207471	207476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022655	ATTCT	2	10	207539	207548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_022655	GCT	2	6	207581	207586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_022655	AATT	2	8	207601	207608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022655	AGA	2	6	207678	207683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022655	TCT	2	6	207894	207899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_022655	TA	3	6	207910	207915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022655	TCC	2	6	208744	208749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_022655	CTATC	2	10	208761	208770	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_022655	GAAA	2	8	208779	208786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022655	ACGA	2	8	208794	208801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_022655	TGT	2	6	208812	208817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022655	T	6	6	208817	208822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022655	TA	3	6	210657	210662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022655	TGT	2	6	210680	210685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022655	TAT	2	6	210703	210708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_022655	A	6	6	210756	210761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022655	GAG	2	6	210781	210786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022655	TAT	2	6	211122	211127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_022655	TTA	2	6	211133	211138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_022655	AGG	2	6	211145	211150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022655	TG	3	6	212790	212795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022655	CA	3	6	212809	212814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_022655	AG	3	6	212830	212835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022655	TAT	2	6	212882	212887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_022655	GAAA	2	8	212894	212901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_022655	GAAA	2	8	212915	212922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022655	ACT	2	6	217174	217179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_022655	AGA	2	6	217226	217231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022655	AATT	2	8	217269	217276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022655	CTA	2	6	217322	217327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_022655	TTC	2	6	217332	217337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_022655	TATT	2	8	217368	217375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022655	ATTA	2	8	217384	217391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_022655	CTT	2	6	217447	217452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_022655	TCA	2	6	217516	217521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_022655	T	6	6	217546	217551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_022655	GA	4	8	217609	217616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022655	TTA	2	6	220126	220131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_022655	TTG	2	6	220192	220197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_022655	AAG	2	6	220207	220212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022655	T	6	6	222290	222295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022655	TAT	2	6	222323	222328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022655	TAAA	2	8	222337	222344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022655	CCT	2	6	222347	222352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_022655	TTTA	2	8	222356	222363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022655	T	6	6	222378	222383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022655	T	6	6	222422	222427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_022655	GTG	2	6	222430	222435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022655	T	6	6	222454	222459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022655	TTA	2	6	222521	222526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022655	CCT	2	6	222535	222540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_022655	TTTA	2	8	222544	222551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022655	CTTTT	2	10	222565	222574	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_022655	ATA	2	6	222577	222582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022655	T	6	6	222614	222619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022655	AAT	2	6	222654	222659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022655	T	6	6	222713	222718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_022655	GAA	2	6	222797	222802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_022655	ACT	2	6	222808	222813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_022655	TAA	2	6	222815	222820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022655	TAG	2	6	222835	222840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022655	TCTTAA	2	12	222930	222941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1076	NC_022655	GAA	2	6	222963	222968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022655	ATA	2	6	223004	223009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_022655	T	6	6	223085	223090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_022655	CCT	2	6	223199	223204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_022655	T	6	6	223282	223287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_022655	T	6	6	223301	223306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022655	ATA	2	6	223310	223315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_022655	ATG	2	6	224357	224362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_022655	ATC	2	6	224375	224380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_022655	GCA	2	6	224411	224416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_022655	TTA	2	6	224528	224533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_022655	GA	3	6	224548	224553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_022655	AGTA	2	8	224651	224658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022655	TGAA	2	8	224691	224698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_022655	GGA	2	6	224734	224739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_022655	CTC	2	6	224766	224771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_022655	AAG	2	6	224914	224919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_022655	CTTAA	2	10	224922	224931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1094	NC_022655	ATA	2	6	224949	224954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_022655	GGC	2	6	224986	224991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022655	T	7	7	224995	225001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022655	AATA	2	8	225025	225032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022655	AGA	2	6	225043	225048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_022655	GGA	2	6	226683	226688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022655	AGA	2	6	229832	229837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022655	A	6	6	229847	229852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022655	T	6	6	229873	229878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022655	CTGA	2	8	231308	231315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_022655	T	6	6	231335	231340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_022655	GAAA	2	8	231390	231397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022655	TA	3	6	231402	231407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022655	TA	3	6	231483	231488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022655	A	6	6	233303	233308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022655	AAT	2	6	233372	233377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022655	A	6	6	234469	234474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022655	ACA	2	6	234495	234500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_022655	AGG	2	6	234555	234560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_022655	CAAT	2	8	238375	238382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_022655	GTA	2	6	238406	238411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_022655	ATA	2	6	238414	238419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022655	A	7	7	238444	238450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022655	TA	3	6	238483	238488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022655	AAGCC	2	10	238522	238531	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1119	NC_022655	TAT	2	6	238533	238538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022655	GAT	2	6	238545	238550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022655	CAAG	2	8	238619	238626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_022655	TC	3	6	238670	238675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_022655	AC	3	6	238715	238720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_022655	GAT	2	6	238722	238727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022655	ATC	2	6	238744	238749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022655	A	7	7	238759	238765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_022655	GGTTGC	2	12	239738	239749	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1128	NC_022655	ATG	2	6	239804	239809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022655	GCA	2	6	239890	239895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_022655	CTAA	2	8	239917	239924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_022655	CAA	2	6	240000	240005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_022655	TTA	2	6	240050	240055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022655	AATAG	2	10	240068	240077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_022655	AAAT	2	8	240085	240092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022655	AAAC	2	8	240098	240105	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_022655	GAAG	2	8	242206	242213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022655	TAG	2	6	242266	242271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022655	AAT	2	6	242275	242280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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