MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172 plasmid pZ172_1

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022610	TAA	2	6	25	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022610	TAA	2	6	48	53	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022610	TTA	2	6	55	60	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022610	TAA	2	6	65	70	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022610	GAT	2	6	81	86	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022610	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022610	TGA	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022610	ACC	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_022610	TAC	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022610	ACT	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022610	GTG	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022610	TAA	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022610	TAT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022610	TTA	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022610	ATC	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022610	TGA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022610	CGA	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022610	TGA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022610	TTG	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022610	TCT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022610	GTT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022610	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022610	ATT	2	6	4691	4696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022610	TCT	2	6	5751	5756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022610	TAT	2	6	5878	5883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022610	ATA	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022610	ATG	2	6	6112	6117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022610	TTC	2	6	6328	6333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022610	CGT	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022610	AAT	2	6	6503	6508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022610	TCT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022610	TCA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022610	CAA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022610	TAT	2	6	8713	8718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022610	TAT	2	6	8801	8806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022610	GAA	3	9	8855	8863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022610	ACC	2	6	8897	8902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_022610	GTT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022610	TGA	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022610	TTA	2	6	9041	9046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022610	GAC	2	6	9308	9313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022610	ATG	2	6	9523	9528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022610	CAC	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_022610	GTG	2	6	9704	9709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022610	TAA	3	9	10323	10331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022610	GGA	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022610	AGT	2	6	11051	11056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022610	TGA	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022610	TAA	2	6	11105	11110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022610	TGA	2	6	11283	11288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022610	TCT	2	6	11303	11308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022610	GAC	2	6	11349	11354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022610	TAA	2	6	11394	11399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022610	TCA	2	6	11489	11494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022610	TTG	2	6	11504	11509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022610	TAG	2	6	11651	11656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022610	ATT	2	6	11703	11708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022610	TCT	2	6	11779	11784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022610	AGG	2	6	12567	12572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022610	TTA	2	6	13150	13155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022610	CAT	2	6	13246	13251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022610	TCC	2	6	13949	13954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_022610	CCT	2	6	13986	13991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022610	TTC	2	6	15820	15825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022610	AAC	2	6	15826	15831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022610	TGC	2	6	15867	15872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022610	ACC	2	6	15887	15892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_022610	CAA	2	6	15944	15949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022610	CAA	2	6	15967	15972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022610	AAT	2	6	15997	16002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022610	CAC	2	6	16065	16070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_022610	ATT	2	6	17841	17846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022610	AAT	2	6	17860	17865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022610	AAG	2	6	17960	17965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022610	TTC	2	6	17971	17976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022610	TCT	2	6	18874	18879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022610	GCT	2	6	19661	19666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022610	TTC	2	6	19727	19732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022610	ATC	2	6	22339	22344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022610	TAT	2	6	22374	22379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022610	TCA	2	6	22393	22398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022610	AAT	2	6	22519	22524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022610	TTG	2	6	23347	23352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022610	ATT	2	6	24077	24082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022610	TAA	2	6	24095	24100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022610	TAA	2	6	24156	24161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022610	GTA	3	9	24843	24851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022610	ATA	2	6	24890	24895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022610	AAT	2	6	25546	25551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022610	ATT	2	6	27314	27319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.