MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of strain 284/09 Stolbur phytoplasma draft

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022588	AATAAA	2	12	10268	10279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022588	TAAGTA	2	12	15509	15520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022588	TTTTAT	2	12	17745	17756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022588	TTTTTA	2	12	17997	18008	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022588	GGTTGG	2	12	22293	22304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022588	TTTTAG	2	12	33519	33530	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022588	AATGAA	2	12	34202	34213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022588	CAAAAT	2	12	42294	42305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022588	TATAAT	2	12	42429	42440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022588	ATTAAA	2	12	42476	42487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022588	TACAAA	2	12	46348	46359	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022588	AAAATA	2	12	67605	67616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022588	TATAGA	2	12	70208	70219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022588	TATAAT	2	12	76178	76189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022588	ATGTTT	2	12	103426	103437	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022588	AAATTA	2	12	108492	108503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022588	TTAAAA	2	12	119077	119088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022588	TTTTTA	2	12	121695	121706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022588	TAATTT	2	12	129665	129676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022588	TTAAAA	2	12	132340	132351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022588	TTGCTA	2	12	136584	136595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022588	TTAAAA	2	12	137217	137228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022588	AAATAA	2	12	144688	144699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022588	ATTAAA	2	12	147001	147012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022588	AAATTA	2	12	151432	151443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022588	ATTTTA	2	12	151922	151933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022588	ATTTAA	2	12	152056	152067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022588	TTTTAA	2	12	152108	152119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022588	AAGGTA	2	12	154841	154852	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022588	AAAAAT	2	12	176610	176621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022588	TAATTT	2	12	179638	179649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022588	GTTAAA	2	12	181251	181262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022588	TAATTA	2	12	183963	183974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022588	TAAAAA	2	12	184083	184094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022588	ACATTA	2	12	184349	184360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022588	AAAATA	2	12	184504	184515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022588	AATAAA	2	12	186472	186483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022588	TTAATT	2	12	216630	216641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022588	AAATTT	2	12	218250	218261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022588	CAAAAA	2	12	223465	223476	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022588	AAAACT	2	12	241297	241308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022588	AAAGTA	2	12	241549	241560	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022588	GTTTTA	2	12	241639	241650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022588	ATTAAT	2	12	249818	249829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022588	AAATAT	2	12	251323	251334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022588	AAAACA	2	12	267889	267900	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022588	CAAAAA	2	12	273607	273618	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022588	ATTAAT	2	12	294527	294538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022588	TAAACA	2	12	303556	303567	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022588	ATTTTT	2	12	306904	306915	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022588	TTTTTG	2	12	310376	310387	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022588	GATTTT	2	12	310479	310490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022588	TTAAAA	2	12	320482	320493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022588	GATAGT	2	12	320790	320801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022588	TCTTTT	2	12	329996	330007	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022588	TTTTAA	2	12	332232	332243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022588	TTTATA	2	12	339663	339674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022588	TAAAGA	2	12	369741	369752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022588	ATAAAT	2	12	370999	371010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022588	ATATTA	2	12	372498	372509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022588	ATAAAA	2	12	386834	386845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022588	AAAAAC	2	12	408013	408024	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022588	TAAAAC	2	12	410131	410142	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022588	AACTAA	2	12	410209	410220	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022588	TTTAAT	2	12	419018	419029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022588	TCTAAA	2	12	424831	424842	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022588	TAAAAA	2	12	426014	426025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022588	TTTCTT	2	12	438428	438439	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022588	TTTTTG	2	12	439785	439796	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022588	GTTTTT	2	12	444572	444583	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022588	AAATTA	2	12	448357	448368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022588	AAATTT	2	12	449275	449286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022588	TCAAAA	2	12	449683	449694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022588	TTAAAA	2	12	451694	451705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022588	TTTTTA	2	12	495228	495239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022588	TATAAA	2	12	523620	523631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022588	CTTTTT	2	12	527578	527589	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022588	ATAAAT	2	12	532090	532101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022588	GAAAAA	2	12	537222	537233	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022588	AAATTT	2	12	541976	541987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022588	AATCAT	2	12	546040	546051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022588	TTATCA	2	12	556422	556433	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.