MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 plasmid pDT104

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022570	ACTGG	2	10	923	932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022570	TCGTC	2	10	1630	1639	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_022570	ACCAC	2	10	4850	4859	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_022570	ATGTT	2	10	4919	4928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022570	GCTCC	2	10	4963	4972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_022570	AATTT	2	10	14102	14111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022570	TGCAA	2	10	14905	14914	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022570	GGCCC	2	10	15494	15503	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_022570	GCCGT	2	10	16314	16323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022570	TGACA	2	10	16374	16383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022570	GTTGA	2	10	32594	32603	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022570	TAATG	2	10	37475	37484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022570	GTCTG	2	10	38717	38726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022570	TATAA	2	10	39624	39633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022570	ACGGG	2	10	48056	48065	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022570	ACGGG	2	10	49233	49242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022570	GAACT	2	10	50456	50465	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022570	GGCCT	2	10	50758	50767	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_022570	GAACA	2	10	54376	54385	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022570	GAACT	2	10	58710	58719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022570	CCCCG	2	10	58749	58758	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_022570	AAAAT	2	10	59654	59663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022570	TAATT	2	10	60835	60844	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022570	ATTTC	2	10	84108	84117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.