MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022544	CTTTTT	2	12	1069872	1069883	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3002	NC_022544	CAT	2	6	1069895	1069900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_022544	TCA	2	6	1069948	1069953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_022544	CA	3	6	1069952	1069957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_022544	T	6	6	1070179	1070184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_022544	GCC	2	6	1070207	1070212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_022544	CCTA	2	8	1070706	1070713	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_022544	TCT	2	6	1070716	1070721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_022544	TAT	2	6	1070760	1070765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_022544	TTC	2	6	1070769	1070774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_022544	TTAA	2	8	1070795	1070802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_022544	TAT	2	6	1070808	1070813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_022544	AATA	2	8	1070834	1070841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_022544	TCC	2	6	1070842	1070847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_022544	GGA	2	6	1070857	1070862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_022544	TATT	2	8	1070863	1070870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_022544	CA	3	6	1070896	1070901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_022544	CTG	2	6	1070983	1070988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_022544	TGT	2	6	1071022	1071027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_022544	T	6	6	1071047	1071052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_022544	TTA	2	6	1071767	1071772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_022544	CAAT	2	8	1071831	1071838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_022544	CAACC	2	10	1071960	1071969	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3024	NC_022544	TCAC	2	8	1071973	1071980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_022544	ATC	2	6	1071998	1072003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_022544	ATGA	2	8	1072023	1072030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_022544	ACG	2	6	1072138	1072143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_022544	AAAT	2	8	1072157	1072164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_022544	TG	3	6	1072180	1072185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_022544	ATT	2	6	1072263	1072268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_022544	A	6	6	1072317	1072322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_022544	T	6	6	1073361	1073366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_022544	T	6	6	1073438	1073443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_022544	GTT	2	6	1074040	1074045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_022544	CAGGG	2	10	1076123	1076132	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3036	NC_022544	CAT	2	6	1076192	1076197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_022544	GTCA	2	8	1076206	1076213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_022544	GGA	2	6	1076231	1076236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_022544	AAT	2	6	1076283	1076288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_022544	T	7	7	1079915	1079921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_022544	GACA	2	8	1081538	1081545	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_022544	T	7	7	1082312	1082318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_022544	CGG	2	6	1082771	1082776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_022544	TCA	2	6	1083061	1083066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_022544	CGAT	2	8	1086467	1086474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_022544	CTG	3	9	1086497	1086505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_022544	AAT	2	6	1086527	1086532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_022544	A	7	7	1086534	1086540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_022544	T	6	6	1087118	1087123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_022544	T	6	6	1087709	1087714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_022544	TAA	2	6	1087735	1087740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_022544	ATAA	2	8	1087762	1087769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_022544	TC	3	6	1087777	1087782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_022544	ACA	2	6	1089840	1089845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_022544	CGG	2	6	1089872	1089877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_022544	TTAT	2	8	1089883	1089890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_022544	CG	3	6	1093302	1093307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_022544	GGC	2	6	1093318	1093323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_022544	AAT	2	6	1093468	1093473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_022544	TGAA	2	8	1093539	1093546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_022544	GCCT	2	8	1093553	1093560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_022544	GCGG	2	8	1093561	1093568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_022544	T	6	6	1093571	1093576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_022544	ACG	2	6	1093678	1093683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_022544	TGG	2	6	1093775	1093780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_022544	TTA	2	6	1093808	1093813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_022544	GAT	2	6	1093822	1093827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_022544	GAC	2	6	1093873	1093878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_022544	GCG	2	6	1093896	1093901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_022544	TGG	2	6	1093913	1093918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_022544	AAG	2	6	1093919	1093924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_022544	CCG	2	6	1093961	1093966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_022544	GGCA	2	8	1093970	1093977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_022544	CAG	2	6	1093997	1094002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_022544	GCA	2	6	1094026	1094031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_022544	CA	3	6	1094064	1094069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_022544	GCA	2	6	1094083	1094088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_022544	AGC	2	6	1094098	1094103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_022544	CAGC	2	8	1094138	1094145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_022544	GCG	2	6	1094146	1094151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_022544	CGG	2	6	1094171	1094176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_022544	GCC	2	6	1094236	1094241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_022544	GCT	2	6	1094251	1094256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_022544	GCC	2	6	1094263	1094268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_022544	GAT	2	6	1096856	1096861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_022544	A	6	6	1096887	1096892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_022544	TCA	2	6	1096931	1096936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_022544	TCT	2	6	1096948	1096953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_022544	GAC	2	6	1096980	1096985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_022544	CCG	2	6	1096993	1096998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_022544	GAT	2	6	1097031	1097036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_022544	T	6	6	1097074	1097079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_022544	GGA	2	6	1098061	1098066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_022544	GAT	2	6	1098094	1098099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_022544	GGT	2	6	1098616	1098621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_022544	TGA	2	6	1098627	1098632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_022544	GTC	2	6	1099338	1099343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_022544	GC	3	6	1099376	1099381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_022544	AGG	3	9	1099704	1099712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_022544	T	6	6	1099873	1099878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_022544	TCT	2	6	1100000	1100005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_022544	CTT	2	6	1100037	1100042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_022544	AG	3	6	1100057	1100062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_022544	T	6	6	1100073	1100078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_022544	CATT	2	8	1100082	1100089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_022544	TAA	2	6	1100095	1100100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_022544	TAT	2	6	1100113	1100118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_022544	AT	3	6	1100133	1100138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_022544	ATT	2	6	1100185	1100190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_022544	ATT	2	6	1100233	1100238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_022544	AAT	2	6	1100290	1100295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_022544	GAG	2	6	1100304	1100309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_022544	ATA	2	6	1100363	1100368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_022544	TA	3	6	1100401	1100406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_022544	TGT	2	6	1100436	1100441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_022544	ATT	3	9	1100444	1100452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_022544	ATTA	2	8	1100459	1100466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_022544	TTG	2	6	1100489	1100494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_022544	TTG	2	6	1100510	1100515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_022544	TATTG	2	10	1100539	1100548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_022544	TAAATG	2	12	1100591	1100602	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_022544	TAA	2	6	1100628	1100633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_022544	TAA	2	6	1100838	1100843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_022544	TA	3	6	1100851	1100856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_022544	TGTC	2	8	1100880	1100887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_022544	TG	3	6	1100992	1100997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_022544	ATGG	2	8	1101002	1101009	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_022544	ATCTCG	2	12	1101057	1101068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_022544	T	6	6	1101247	1101252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_022544	T	7	7	1103922	1103928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_022544	TATT	2	8	1103986	1103993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_022544	ATA	2	6	1104030	1104035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_022544	GTT	2	6	1105128	1105133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_022544	TAT	2	6	1105176	1105181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_022544	TAA	2	6	1105187	1105192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_022544	GA	3	6	1105239	1105244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_022544	CAA	2	6	1106966	1106971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_022544	T	7	7	1114547	1114553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_022544	GTT	2	6	1114575	1114580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_022544	T	6	6	1114591	1114596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_022544	TTTTC	2	10	1114713	1114722	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3142	NC_022544	TTATT	2	10	1115553	1115562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_022544	GAT	2	6	1117201	1117206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3145	NC_022544	TGT	2	6	1117386	1117391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_022544	G	6	6	1117396	1117401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_022544	TTCTT	2	10	1117486	1117495	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3148	NC_022544	A	6	6	1117505	1117510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_022544	CCAGA	2	10	1118025	1118034	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3151	NC_022544	T	6	6	1118058	1118063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_022544	ATC	2	6	1119145	1119150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_022544	A	7	7	1119321	1119327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_022544	CAT	2	6	1119343	1119348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3157	NC_022544	A	8	8	1119454	1119461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_022544	AATC	2	8	1119996	1120003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3161	NC_022544	T	7	7	1123471	1123477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_022544	GCGG	2	8	1125604	1125611	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3163	NC_022544	CCCG	2	8	1125620	1125627	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3166	NC_022544	A	7	7	1126160	1126166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_022544	GC	3	6	1126169	1126174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3168	NC_022544	TAA	2	6	1126881	1126886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3174	NC_022544	GAT	2	6	1132017	1132022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3184	NC_022544	A	6	6	1132611	1132616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3229	NC_022544	GCGCT	2	10	1149348	1149357	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3230	NC_022544	A	7	7	1149370	1149376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3233	NC_022544	AGCGC	2	10	1151090	1151099	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3234	NC_022544	GTA	2	6	1151112	1151117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3237	NC_022544	ATG	2	6	1154415	1154420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3246	NC_022544	T	6	6	1155288	1155293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_022544	TTAT	2	8	1155300	1155307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_022544	GTG	2	6	1155357	1155362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_022544	ATT	2	6	1155398	1155403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_022544	TGT	2	6	1155418	1155423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_022544	TTAT	2	8	1155429	1155436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_022544	AG	3	6	1155507	1155512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_022544	AT	3	6	1155530	1155535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_022544	A	6	6	1155585	1155590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_022544	TTTA	2	8	1155610	1155617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_022544	GAT	2	6	1155621	1155626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_022544	TTC	2	6	1155698	1155703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_022544	TAT	2	6	1155735	1155740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_022544	CAT	2	6	1157034	1157039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_022544	ATAC	2	8	1157052	1157059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3261	NC_022544	GTT	2	6	1157155	1157160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_022544	GC	3	6	1157182	1157187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_022544	A	6	6	1157670	1157675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3265	NC_022544	TCC	2	6	1162320	1162325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3400	NC_022544	T	8	8	1189057	1189064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3401	NC_022544	GGA	2	6	1189067	1189072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3403	NC_022544	GAG	2	6	1189523	1189528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3405	NC_022544	CTG	2	6	1189898	1189903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3407	NC_022544	CG	3	6	1191912	1191917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3442	NC_022544	ACAT	2	8	1205099	1205106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3444	NC_022544	TA	3	6	1205416	1205421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3445	NC_022544	TAA	2	6	1206489	1206494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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