MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022544	AG	3	6	563991	563996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_022544	CT	3	6	564861	564866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_022544	GC	3	6	564901	564906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_022544	CGTT	2	8	565759	565766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_022544	GCC	2	6	565813	565818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_022544	ATG	2	6	569524	569529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_022544	AAT	2	6	569532	569537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_022544	T	6	6	569567	569572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_022544	TAG	2	6	569603	569608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_022544	A	6	6	569620	569625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_022544	ACA	2	6	569629	569634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_022544	TTA	2	6	569653	569658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_022544	CTAT	2	8	569685	569692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_022544	AC	3	6	570912	570917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_022544	GCCT	2	8	570926	570933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_022544	AC	3	6	570947	570952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_022544	CAT	2	6	570960	570965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_022544	AAT	2	6	570968	570973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_022544	CAG	2	6	570982	570987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_022544	ATC	2	6	574785	574790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_022544	CCT	2	6	575770	575775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_022544	AGT	2	6	575818	575823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_022544	ATA	2	6	575829	575834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_022544	CTT	2	6	576480	576485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_022544	CGCT	2	8	577376	577383	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_022544	T	6	6	577394	577399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_022544	AAT	2	6	580029	580034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_022544	T	8	8	580046	580053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_022544	GAA	2	6	581059	581064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_022544	AAT	2	6	582315	582320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_022544	CTA	2	6	582326	582331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_022544	TTTAT	2	10	582336	582345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_022544	ATTT	2	8	582346	582353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_022544	AAC	2	6	582375	582380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_022544	AG	3	6	582421	582426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_022544	CAG	2	6	582433	582438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_022544	TTA	2	6	582457	582462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_022544	ATGG	2	8	582513	582520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_022544	CGG	2	6	582555	582560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_022544	T	7	7	582561	582567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_022544	ATT	2	6	582604	582609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_022544	ATT	2	6	582618	582623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_022544	GCG	3	9	582628	582636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_022544	AATG	2	8	582642	582649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_022544	GGCA	2	8	582654	582661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_022544	GC	3	6	582716	582721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_022544	ATT	2	6	582732	582737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_022544	GCT	2	6	582858	582863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_022544	T	6	6	582899	582904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_022544	ATT	2	6	582907	582912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_022544	GGT	2	6	582934	582939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_022544	TAAA	2	8	582947	582954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_022544	GGC	2	6	582994	582999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_022544	TGG	2	6	583096	583101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_022544	CATT	2	8	583170	583177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_022544	TA	3	6	583221	583226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_022544	ATT	2	6	583251	583256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_022544	TATGG	2	10	583275	583284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_022544	TGA	2	6	583360	583365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022544	CAAC	2	8	583375	583382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_022544	GCG	2	6	583419	583424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_022544	TAT	2	6	583472	583477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_022544	CGG	2	6	583547	583552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_022544	ATT	2	6	583588	583593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_022544	TGA	2	6	583622	583627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_022544	GGC	2	6	583722	583727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_022544	CGTT	2	8	583789	583796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_022544	GAA	2	6	583811	583816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_022544	GA	3	6	583840	583845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_022544	A	6	6	583845	583850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_022544	CGT	2	6	585322	585327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_022544	ACG	2	6	585329	585334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_022544	A	7	7	587835	587841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_022544	AGG	2	6	587893	587898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_022544	CCG	2	6	587904	587909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_022544	ACG	2	6	591028	591033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_022544	AAAAT	2	10	591066	591075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_022544	A	7	7	591097	591103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_022544	ATTT	2	8	591114	591121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_022544	TAAA	2	8	591151	591158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_022544	T	6	6	591163	591168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_022544	GTT	2	6	591195	591200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_022544	TAA	2	6	591214	591219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_022544	AT	3	6	591258	591263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_022544	TGCAAT	2	12	591292	591303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1586	NC_022544	TGCAAT	2	12	591307	591318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1587	NC_022544	ATT	2	6	591326	591331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_022544	GTT	2	6	591337	591342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_022544	GGC	2	6	596003	596008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_022544	GCC	2	6	596021	596026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_022544	GCT	2	6	597639	597644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_022544	TGCG	2	8	597691	597698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_022544	CGA	2	6	597716	597721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_022544	AG	3	6	598963	598968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_022544	TGC	2	6	599047	599052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_022544	AAT	2	6	599063	599068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_022544	ATT	2	6	599084	599089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_022544	CA	3	6	599093	599098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_022544	GAT	2	6	602401	602406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_022544	AG	3	6	603553	603558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_022544	GC	3	6	603700	603705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_022544	TCA	2	6	603730	603735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_022544	TCG	2	6	603761	603766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_022544	GGC	2	6	603779	603784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_022544	CTT	2	6	603820	603825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_022544	T	6	6	603874	603879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_022544	TTA	2	6	603899	603904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_022544	ATTA	2	8	603932	603939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_022544	TAAT	2	8	603973	603980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_022544	ATCT	2	8	603988	603995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_022544	ATA	2	6	604036	604041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_022544	GT	4	8	604075	604082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_022544	AGGGA	2	10	604674	604683	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_022544	T	6	6	605300	605305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_022544	AG	3	6	606004	606009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_022544	TAA	2	6	610911	610916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_022544	AC	3	6	610955	610960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_022544	CA	3	6	610961	610966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_022544	AAT	2	6	610974	610979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_022544	TAA	2	6	611023	611028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_022544	CAA	2	6	611053	611058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_022544	A	6	6	611057	611062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022544	GTG	2	6	611186	611191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_022544	AGT	2	6	611219	611224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022544	TGT	2	6	611231	611236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022544	ATA	2	6	611251	611256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022544	TAA	2	6	611287	611292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022544	GAG	2	6	611327	611332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_022544	A	7	7	611352	611358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_022544	A	6	6	611445	611450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_022544	CTC	2	6	612532	612537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_022544	ATG	2	6	612547	612552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_022544	AT	3	6	612558	612563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_022544	CAT	2	6	612597	612602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_022544	A	7	7	612615	612621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_022544	ATT	2	6	612644	612649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_022544	A	7	7	613287	613293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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