MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022544	A	6	6	370595	370600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022544	AAAG	2	8	370646	370653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022544	CGG	2	6	370675	370680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_022544	TC	3	6	370705	370710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_022544	GGC	2	6	371082	371087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_022544	TA	3	6	371153	371158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022544	AATA	2	8	371166	371173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022544	TA	3	6	371172	371177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022544	TAC	2	6	371188	371193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_022544	GAT	2	6	371218	371223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022544	AAAAT	2	10	371268	371277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022544	GT	3	6	372629	372634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022544	ATC	2	6	372656	372661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_022544	T	6	6	372663	372668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022544	GGC	2	6	373960	373965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_022544	ATGA	2	8	373992	373999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022544	GAC	2	6	374056	374061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_022544	TGA	2	6	374086	374091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022544	GCG	4	12	374106	374117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_022544	CAGG	2	8	374154	374161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_022544	GAA	2	6	374798	374803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022544	CA	3	6	377900	377905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_022544	GATT	2	8	377924	377931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022544	ACT	2	6	377937	377942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_022544	TAT	2	6	377975	377980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022544	A	6	6	378006	378011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022544	CCAT	2	8	378017	378024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_022544	CA	3	6	378113	378118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_022544	CTCATT	2	12	378166	378177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_022544	AATGT	2	10	378187	378196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022544	GCA	2	6	378229	378234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_022544	ATT	2	6	378289	378294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_022544	TCT	2	6	378358	378363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_022544	TTTC	2	8	378367	378374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_022544	TGAAA	2	10	378471	378480	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022544	TA	3	6	378499	378504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022544	CAA	2	6	384324	384329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_022544	GGA	2	6	384991	384996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_022544	CCT	2	6	385045	385050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_022544	AAAC	2	8	385072	385079	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_022544	TTGA	2	8	385162	385169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022544	TC	3	6	385188	385193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_022544	ATAG	2	8	385203	385210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_022544	ATA	2	6	385279	385284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022544	T	6	6	385347	385352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022544	ATT	2	6	385462	385467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_022544	T	6	6	385524	385529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022544	ATA	2	6	385537	385542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_022544	GTC	2	6	385544	385549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_022544	ATG	2	6	385553	385558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022544	ATGA	2	8	385583	385590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_022544	CTT	2	6	385694	385699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_022544	A	6	6	385721	385726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022544	ATT	2	6	385733	385738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022544	TTTG	2	8	385742	385749	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022544	TAG	2	6	385819	385824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022544	CTGT	2	8	385877	385884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_022544	A	9	9	385900	385908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022544	GTGA	2	8	385923	385930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022544	CAC	2	6	385946	385951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_022544	TTC	2	6	386017	386022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_022544	TA	4	8	386048	386055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022544	T	7	7	386084	386090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022544	AGT	2	6	386159	386164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022544	CT	3	6	386177	386182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_022544	AAAATT	2	12	386184	386195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022544	TAT	2	6	386220	386225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022544	AAT	2	6	386794	386799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022544	TCA	2	6	386837	386842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_022544	TC	3	6	386999	387004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_022544	AAGG	2	8	387064	387071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_022544	A	7	7	388684	388690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_022544	AT	3	6	388703	388708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022544	GAA	2	6	388731	388736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022544	TGT	2	6	389977	389982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_022544	T	6	6	390081	390086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_022544	TAA	2	6	390187	390192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_022544	A	6	6	390191	390196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022544	AT	3	6	390236	390241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_022544	TAA	2	6	390276	390281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022544	TG	3	6	390314	390319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_022544	TA	3	6	390345	390350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_022544	ATA	2	6	390938	390943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_022544	GCT	2	6	390948	390953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1088	NC_022544	AT	3	6	392349	392354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022544	GC	5	10	392364	392373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1091	NC_022544	GGC	2	6	398139	398144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_022544	GC	3	6	398143	398148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_022544	G	6	6	398154	398159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_022544	GGC	2	6	398219	398224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_022544	CAT	2	6	398418	398423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022544	GTC	2	6	398537	398542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_022544	CA	3	6	401366	401371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_022544	CGCTT	2	10	401630	401639	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1099	NC_022544	TAA	2	6	401700	401705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022544	TA	3	6	401746	401751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022544	GAC	2	6	401801	401806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_022544	T	6	6	401849	401854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022544	TCC	2	6	403167	403172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_022544	CGT	2	6	403173	403178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_022544	AAC	2	6	403197	403202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_022544	ATG	2	6	403211	403216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022544	ATC	2	6	403242	403247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_022544	T	6	6	403254	403259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022544	ATTG	2	8	403271	403278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022544	TGAA	2	8	408261	408268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022544	GCC	2	6	408306	408311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_022544	AGCG	2	8	408316	408323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_022544	CCCGT	2	10	408351	408360	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1114	NC_022544	T	7	7	408456	408462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_022544	CGTTT	2	10	408678	408687	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_022544	TA	4	8	408728	408735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022544	GGGA	2	8	408739	408746	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022544	ATT	2	6	411403	411408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022544	CCG	2	6	412525	412530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_022544	T	6	6	412560	412565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022544	TAA	2	6	412622	412627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022544	TTA	2	6	415467	415472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022544	GAT	2	6	415485	415490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022544	GTT	2	6	415529	415534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022544	ACT	2	6	415579	415584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022544	GAT	2	6	415625	415630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_022544	TAA	3	9	415635	415643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022544	CAT	2	6	415943	415948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_022544	CGG	2	6	415970	415975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_022544	TATT	2	8	415979	415986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022544	T	6	6	417723	417728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022544	T	9	9	417799	417807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022544	CTTTG	2	10	417906	417915	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1134	NC_022544	GCC	2	6	418870	418875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_022544	TACGG	2	10	418913	418922	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1136	NC_022544	AAT	2	6	418952	418957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_022544	GC	3	6	423640	423645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1275	NC_022544	GGC	2	6	479314	479319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_022544	AGAC	2	8	483101	483108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1277	NC_022544	AAAT	2	8	483227	483234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1278	NC_022544	GAT	2	6	483247	483252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1309	NC_022544	TAT	2	6	498386	498391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1313	NC_022544	T	6	6	498515	498520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_022544	G	6	6	523296	523301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_022544	CTG	2	6	523308	523313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_022544	TGA	2	6	523320	523325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_022544	CAGGT	2	10	524447	524456	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1414	NC_022544	GGAA	2	8	524459	524466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_022544	CCCA	2	8	524514	524521	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1416	NC_022544	CTG	2	6	524548	524553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_022544	GCC	2	6	526242	526247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1418	NC_022544	TGTTA	2	10	526305	526314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_022544	AGGG	2	8	526776	526783	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_022544	T	6	6	526791	526796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_022544	GTA	2	6	527300	527305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_022544	A	6	6	527336	527341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_022544	CG	3	6	527937	527942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1424	NC_022544	TGG	2	6	527950	527955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_022544	AAT	2	6	527975	527980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_022544	TGCTAT	2	12	528004	528015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1427	NC_022544	TTA	2	6	528052	528057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_022544	GAG	2	6	528066	528071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_022544	TAA	2	6	528352	528357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_022544	AACT	2	8	528790	528797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1431	NC_022544	A	6	6	528846	528851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_022544	TCG	2	6	528931	528936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_022544	T	6	6	528988	528993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_022544	TTAA	2	8	529059	529066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_022544	TTA	2	6	529132	529137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_022544	A	6	6	529145	529150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_022544	AATC	2	8	529152	529159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1439	NC_022544	A	6	6	529191	529196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_022544	TGC	2	6	533656	533661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_022544	TAT	2	6	533667	533672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_022544	CGT	2	6	533673	533678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_022544	TACA	2	8	533686	533693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1444	NC_022544	ATGT	2	8	533701	533708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_022544	TGTT	2	8	534436	534443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_022544	ATT	2	6	534469	534474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_022544	CG	3	6	537885	537890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1448	NC_022544	GC	3	6	537901	537906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1449	NC_022544	TTG	2	6	538860	538865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_022544	TTCAA	2	10	539623	539632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1451	NC_022544	CAGGCG	2	12	540135	540146	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_022544	AT	3	6	540218	540223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_022544	AG	3	6	540807	540812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_022544	AG	5	10	542852	542861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_022544	GGC	2	6	543809	543814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1456	NC_022544	TTG	2	6	543892	543897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_022544	AGCGCC	2	12	545863	545874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1458	NC_022544	T	6	6	545883	545888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_022544	ATA	2	6	545889	545894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_022544	TGG	2	6	545966	545971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_022544	A	6	6	545990	545995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_022544	T	6	6	546670	546675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_022544	CTG	2	6	546700	546705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1465	NC_022544	GGC	2	6	546757	546762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1467	NC_022544	TTC	2	6	546839	546844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1469	NC_022544	GGC	2	6	546891	546896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1471	NC_022544	TCG	2	6	548887	548892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1481	NC_022544	GC	3	6	555299	555304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1482	NC_022544	CTG	2	6	555329	555334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1483	NC_022544	CTT	2	6	555874	555879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1484	NC_022544	A	6	6	555924	555929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1485	NC_022544	ATA	3	9	556011	556019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1486	NC_022544	TCGG	2	8	556939	556946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1487	NC_022544	A	7	7	557798	557804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1488	NC_022544	TGT	2	6	557815	557820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1489	NC_022544	T	6	6	557820	557825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1490	NC_022544	TA	3	6	557856	557861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1491	NC_022544	TAA	2	6	557887	557892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1495	NC_022544	C	6	6	562406	562411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1496	NC_022544	TTA	2	6	562412	562417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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