MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022544	CCT	2	6	4587650	4587655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_022544	CAG	2	6	4587656	4587661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_022544	CGC	2	6	4587725	4587730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13504	NC_022544	TGT	2	6	4587755	4587760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_022544	A	6	6	4587763	4587768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_022544	AAC	2	6	4587797	4587802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_022544	GCC	2	6	4587815	4587820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13508	NC_022544	AGG	2	6	4588082	4588087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_022544	AAT	2	6	4588091	4588096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_022544	T	6	6	4589610	4589615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_022544	ATT	2	6	4589676	4589681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_022544	CCT	2	6	4591319	4591324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13513	NC_022544	TCC	2	6	4591448	4591453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13514	NC_022544	AGA	2	6	4591472	4591477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_022544	GAT	2	6	4592170	4592175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_022544	CAG	2	6	4592208	4592213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_022544	ATTTT	2	10	4592222	4592231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_022544	CGT	2	6	4592240	4592245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_022544	CCG	2	6	4592342	4592347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13520	NC_022544	TCG	2	6	4592384	4592389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_022544	ACAG	2	8	4592424	4592431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13522	NC_022544	GAA	2	6	4592438	4592443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_022544	TGGCGC	2	12	4593871	4593882	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_022544	GCC	2	6	4593938	4593943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13525	NC_022544	AAT	2	6	4594650	4594655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_022544	CTC	2	6	4596635	4596640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13527	NC_022544	TTA	2	6	4596658	4596663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_022544	ACC	2	6	4596668	4596673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13529	NC_022544	ACTT	2	8	4596677	4596684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13530	NC_022544	AGTA	2	8	4596687	4596694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_022544	AC	3	6	4597153	4597158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13532	NC_022544	AGA	2	6	4599196	4599201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_022544	T	6	6	4599227	4599232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_022544	TAT	2	6	4599271	4599276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_022544	AAC	2	6	4599333	4599338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_022544	CTT	2	6	4600667	4600672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_022544	T	7	7	4600675	4600681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_022544	GCGG	2	8	4600762	4600769	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13539	NC_022544	ACG	2	6	4600880	4600885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_022544	ACA	2	6	4600979	4600984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_022544	A	6	6	4601215	4601220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_022544	A	8	8	4601223	4601230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_022544	GGAAG	2	10	4602647	4602656	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_022544	CA	3	6	4603497	4603502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13545	NC_022544	AAC	2	6	4603505	4603510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_022544	GTC	2	6	4603551	4603556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_022544	TTG	2	6	4603573	4603578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_022544	T	6	6	4603611	4603616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_022544	GTT	2	6	4609534	4609539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_022544	T	6	6	4609538	4609543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_022544	AAT	2	6	4611948	4611953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_022544	AT	3	6	4611971	4611976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_022544	GT	3	6	4611983	4611988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_022544	ATGTT	2	10	4611998	4612007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_022544	TTA	2	6	4612050	4612055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_022544	ATT	2	6	4612150	4612155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_022544	TAA	2	6	4612200	4612205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_022544	A	6	6	4612204	4612209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_022544	TAT	2	6	4612220	4612225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_022544	TAA	2	6	4612246	4612251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_022544	ACAA	2	8	4612893	4612900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13562	NC_022544	TAT	2	6	4612909	4612914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_022544	CGT	2	6	4612968	4612973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_022544	CGC	2	6	4613032	4613037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13565	NC_022544	GGC	2	6	4613061	4613066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_022544	TGG	2	6	4613085	4613090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_022544	ATTG	2	8	4614111	4614118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_022544	AACA	2	8	4614143	4614150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13569	NC_022544	GAT	2	6	4614156	4614161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_022544	A	7	7	4614251	4614257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_022544	CAGC	2	8	4615663	4615670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13572	NC_022544	TGGC	2	8	4615675	4615682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13573	NC_022544	CCG	2	6	4615830	4615835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13574	NC_022544	TCT	2	6	4615906	4615911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_022544	GCC	2	6	4615931	4615936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13576	NC_022544	TCAGAT	2	12	4615991	4616002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13577	NC_022544	TGT	2	6	4616063	4616068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_022544	GTTCA	2	10	4616078	4616087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13579	NC_022544	GAT	2	6	4616985	4616990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_022544	ATC	2	6	4617002	4617007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_022544	ATCT	2	8	4618485	4618492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13582	NC_022544	CGA	2	6	4618554	4618559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13583	NC_022544	AAT	2	6	4618617	4618622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_022544	T	6	6	4618675	4618680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_022544	TGC	2	6	4618691	4618696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_022544	CTC	2	6	4618712	4618717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13587	NC_022544	TGA	2	6	4618723	4618728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_022544	TCT	2	6	4618842	4618847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13589	NC_022544	AATG	2	8	4618848	4618855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_022544	AAAAT	2	10	4618858	4618867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_022544	GT	3	6	4618882	4618887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_022544	AGGG	2	8	4618905	4618912	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_022544	CTCC	2	8	4620414	4620421	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13594	NC_022544	ACC	2	6	4620468	4620473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13595	NC_022544	ATA	3	9	4620494	4620502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_022544	TCT	3	9	4620520	4620528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_022544	CAT	2	6	4620530	4620535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13598	NC_022544	TGG	2	6	4620554	4620559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_022544	GCCGT	2	10	4620562	4620571	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13600	NC_022544	TA	3	6	4620580	4620585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_022544	AAT	2	6	4620597	4620602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_022544	GT	3	6	4620634	4620639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_022544	A	6	6	4620655	4620660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_022544	TCT	2	6	4621517	4621522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_022544	T	6	6	4623048	4623053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_022544	GAC	2	6	4623073	4623078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13607	NC_022544	CTGA	2	8	4623082	4623089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13608	NC_022544	ATTT	2	8	4623170	4623177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_022544	ATTTT	2	10	4623185	4623194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_022544	GCA	2	6	4623231	4623236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13611	NC_022544	GT	3	6	4623285	4623290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_022544	TGT	2	6	4623305	4623310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_022544	A	6	6	4623328	4623333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_022544	TA	3	6	4623342	4623347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_022544	TGT	2	6	4623364	4623369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_022544	G	6	6	4623391	4623396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_022544	CAC	2	6	4623403	4623408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13618	NC_022544	GA	3	6	4623462	4623467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_022544	TGCT	2	8	4624310	4624317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13620	NC_022544	T	6	6	4624359	4624364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_022544	TGA	2	6	4624428	4624433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_022544	T	7	7	4624434	4624440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_022544	CTT	2	6	4624465	4624470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_022544	GATA	2	8	4624478	4624485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_022544	TGT	2	6	4624513	4624518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_022544	TAT	2	6	4626586	4626591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_022544	CTT	2	6	4626592	4626597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13628	NC_022544	TGA	2	6	4630002	4630007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13629	NC_022544	GGCA	2	8	4630008	4630015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13630	NC_022544	AGA	2	6	4631964	4631969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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