MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022544	TTGA	2	8	190135	190142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022544	CAA	2	6	190171	190176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_022544	GTG	2	6	194188	194193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022544	CCT	2	6	195000	195005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_022544	A	7	7	195901	195907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022544	CAT	2	6	195916	195921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_022544	ATT	2	6	195950	195955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022544	GGA	2	6	195972	195977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022544	CGA	2	6	196378	196383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022544	TAT	2	6	196388	196393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022544	TATTG	2	10	196421	196430	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022544	GCC	2	6	198171	198176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_022544	T	6	6	200632	200637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022544	TG	3	6	200665	200670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022544	TCA	2	6	200675	200680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_022544	GAAT	2	8	200709	200716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022544	GCG	2	6	200753	200758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_022544	TTA	2	6	200759	200764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022544	ATT	2	6	202126	202131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022544	AT	3	6	202138	202143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022544	AAGT	2	8	202160	202167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022544	CAA	2	6	202197	202202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022544	A	7	7	202206	202212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022544	CGG	2	6	202220	202225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_022544	ACC	2	6	202311	202316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_022544	TAT	2	6	202322	202327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022544	TAA	2	6	202340	202345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022544	TTTAAC	2	12	202434	202445	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_022544	TTA	2	6	202487	202492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022544	CG	4	8	202572	202579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_022544	GCC	2	6	202603	202608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_022544	TGA	2	6	202609	202614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022544	CG	3	6	202620	202625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_022544	CGG	2	6	202666	202671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_022544	CAC	2	6	202733	202738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_022544	ATT	2	6	202740	202745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022544	ACC	2	6	202749	202754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_022544	TAT	2	6	202796	202801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022544	TGG	2	6	202816	202821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022544	TGG	2	6	202930	202935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022544	GAGC	2	8	203000	203007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_022544	TAA	2	6	203033	203038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022544	GAA	2	6	203052	203057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022544	GCTTC	2	10	203902	203911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
545	NC_022544	GAT	2	6	209022	209027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022544	GAA	2	6	209039	209044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022544	AT	4	8	209078	209085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022544	ATT	2	6	209093	209098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022544	GTTT	2	8	209108	209115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022544	GCT	2	6	209162	209167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_022544	AAT	2	6	209180	209185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022544	T	7	7	209191	209197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022544	A	6	6	209202	209207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022544	GT	3	6	209222	209227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022544	A	7	7	209236	209242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022544	CAT	2	6	209251	209256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_022544	GGA	2	6	209275	209280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022544	GAC	2	6	209739	209744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_022544	T	6	6	209766	209771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022544	CTT	2	6	211408	211413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_022544	TGA	2	6	212376	212381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022544	GCGCT	2	10	212394	212403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
563	NC_022544	CGCGT	2	10	212446	212455	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
564	NC_022544	G	6	6	213326	213331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022544	TAA	2	6	215291	215296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022544	AG	3	6	215341	215346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022544	CAT	2	6	215368	215373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_022544	CGC	2	6	215377	215382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_022544	AACG	2	8	216381	216388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_022544	ACGC	2	8	216982	216989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
571	NC_022544	TAA	2	6	217002	217007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022544	GA	3	6	220841	220846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022544	TCT	3	9	220849	220857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_022544	GTC	2	6	220858	220863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022544	GAA	2	6	220869	220874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022544	TGC	2	6	220901	220906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_022544	TCC	2	6	223548	223553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_022544	ATAA	2	8	223554	223561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022544	TTA	2	6	223576	223581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022544	CCTT	2	8	223584	223591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_022544	CGA	2	6	223651	223656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_022544	TGC	2	6	223671	223676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_022544	TAA	3	9	223682	223690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022544	TCA	2	6	223716	223721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_022544	CAATAT	2	12	229775	229786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
586	NC_022544	CTGTC	2	10	229842	229851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
587	NC_022544	AAG	2	6	229888	229893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022544	GC	3	6	229937	229942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_022544	TGA	2	6	229995	230000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022544	AAT	2	6	230023	230028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022544	TAA	3	9	230117	230125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022544	ATA	2	6	230146	230151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022544	ATT	2	6	230156	230161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022544	T	6	6	230160	230165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022544	TAA	2	6	230173	230178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022544	A	6	6	230177	230182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022544	AAAT	2	8	230194	230201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022544	A	8	8	230220	230227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022544	T	6	6	230240	230245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022544	T	8	8	230247	230254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022544	AAAT	2	8	230272	230279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022544	TA	3	6	230295	230300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022544	T	7	7	230322	230328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022544	T	7	7	230351	230357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022544	CTTG	2	8	230369	230376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_022544	TTTG	2	8	230378	230385	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022544	T	6	6	230386	230391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022544	TAT	2	6	230408	230413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022544	TAAA	2	8	230432	230439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022544	A	6	6	230437	230442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022544	TTAT	2	8	230494	230501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022544	GTT	2	6	230508	230513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022544	CTT	2	6	230516	230521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_022544	ATATA	2	10	230555	230564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022544	CTA	2	6	230568	230573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_022544	TG	3	6	230603	230608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022544	TAA	2	6	230636	230641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022544	ATC	2	6	231219	231224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_022544	GAT	2	6	231244	231249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022544	A	7	7	231259	231265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022544	TA	3	6	231271	231276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022544	A	9	9	237144	237152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022544	GGC	2	6	237159	237164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022544	GTT	2	6	237184	237189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022544	TCT	2	6	238648	238653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_022544	C	6	6	245965	245970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
627	NC_022544	TGCTC	2	10	246043	246052	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
628	NC_022544	AGG	2	6	246055	246060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022544	CGG	2	6	247227	247232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022544	AT	3	6	247258	247263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022544	AC	3	6	247303	247308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_022544	TCA	2	6	247710	247715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_022544	AAT	2	6	247730	247735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022544	CCA	2	6	247757	247762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_022544	A	7	7	247771	247777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022544	AGA	2	6	247792	247797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022544	GCG	2	6	247825	247830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_022544	G	6	6	249253	249258	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022544	ATAA	2	8	250124	250131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022544	CT	3	6	252951	252956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_022544	GCC	2	6	252958	252963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_022544	GAT	2	6	253861	253866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_022544	AAT	2	6	253873	253878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_022544	TCAG	2	8	253901	253908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
645	NC_022544	T	6	6	253977	253982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_022544	GC	3	6	254118	254123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
650	NC_022544	AC	3	6	254149	254154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
651	NC_022544	AAC	2	6	254187	254192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_022544	GGC	2	6	255058	255063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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656	NC_022544	CTT	2	6	256153	256158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_022544	CT	3	6	256166	256171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
658	NC_022544	GAAA	2	8	256261	256268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
659	NC_022544	TTA	2	6	257044	257049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
660	NC_022544	TG	3	6	257094	257099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
661	NC_022544	GTCTG	2	10	257103	257112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
662	NC_022544	GTG	2	6	257750	257755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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664	NC_022544	GCG	2	6	257795	257800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_022544	AGA	2	6	259052	259057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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667	NC_022544	T	6	6	259159	259164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_022544	CG	3	6	259253	259258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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672	NC_022544	ATA	2	6	262364	262369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NC_022544	TTA	2	6	266490	266495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
674	NC_022544	T	7	7	274041	274047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
675	NC_022544	GCAG	2	8	274143	274150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
676	NC_022544	T	6	6	275998	276003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
677	NC_022544	CT	3	6	278694	278699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
678	NC_022544	GCG	2	6	278725	278730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
679	NC_022544	GCGCT	2	10	279959	279968	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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756	NC_022544	G	6	6	292828	292833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
757	NC_022544	GT	4	8	292886	292893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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777	NC_022544	GAC	3	9	294231	294239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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