MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022544	TTA	2	6	2003469	2003474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_022544	CGG	2	6	2005010	2005015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_022544	GTC	2	6	2005074	2005079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_022544	TAT	2	6	2005101	2005106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_022544	ATT	3	9	2005179	2005187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_022544	CAT	2	6	2005239	2005244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_022544	GC	3	6	2005638	2005643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_022544	GCGTC	2	10	2005686	2005695	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6009	NC_022544	CGC	2	6	2005699	2005704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_022544	TGT	2	6	2005741	2005746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_022544	GAT	2	6	2006084	2006089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_022544	T	6	6	2006089	2006094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_022544	GCA	2	6	2006097	2006102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_022544	A	6	6	2006147	2006152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_022544	AAT	2	6	2006190	2006195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_022544	GAGT	2	8	2006229	2006236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_022544	A	6	6	2006252	2006257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_022544	AGG	2	6	2011035	2011040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_022544	CGA	2	6	2011042	2011047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_022544	GGACA	2	10	2012754	2012763	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6021	NC_022544	CGC	3	9	2015125	2015133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_022544	GCGG	2	8	2015168	2015175	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_022544	TCA	2	6	2015214	2015219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_022544	A	6	6	2016937	2016942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_022544	AT	3	6	2016954	2016959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_022544	TCAC	2	8	2016985	2016992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_022544	ACTTT	2	10	2017007	2017016	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6028	NC_022544	GAT	2	6	2017019	2017024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_022544	TGAG	2	8	2017160	2017167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_022544	TCC	2	6	2018038	2018043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_022544	GGT	2	6	2018151	2018156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_022544	A	7	7	2018398	2018404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_022544	AAG	2	6	2018442	2018447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_022544	T	7	7	2018503	2018509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_022544	T	6	6	2018526	2018531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_022544	ATGA	2	8	2018534	2018541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_022544	TGC	2	6	2018586	2018591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_022544	CTT	2	6	2018628	2018633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_022544	CCG	2	6	2018669	2018674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_022544	TCA	2	6	2021262	2021267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_022544	AGC	2	6	2021300	2021305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_022544	CGA	2	6	2021317	2021322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_022544	TCT	2	6	2022562	2022567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_022544	CGG	2	6	2022607	2022612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_022544	ATA	2	6	2022664	2022669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_022544	GTGA	2	8	2022708	2022715	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_022544	AAT	2	6	2025526	2025531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_022544	CT	3	6	2026283	2026288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_022544	TTA	2	6	2026305	2026310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_022544	CCA	2	6	2026349	2026354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_022544	ATTA	2	8	2026704	2026711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_022544	ATTC	2	8	2026773	2026780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_022544	CTG	2	6	2026825	2026830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_022544	AAC	2	6	2026887	2026892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_022544	TTTTA	2	10	2026917	2026926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_022544	TTA	2	6	2026954	2026959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_022544	ATTT	2	8	2026970	2026977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_022544	T	8	8	2027011	2027018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_022544	T	6	6	2027022	2027027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_022544	A	6	6	2027053	2027058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_022544	CAA	2	6	2027075	2027080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_022544	ATCAA	2	10	2027083	2027092	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6063	NC_022544	A	6	6	2027091	2027096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_022544	A	6	6	2027111	2027116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_022544	AT	4	8	2027130	2027137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_022544	TA	3	6	2027149	2027154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_022544	TAT	2	6	2027160	2027165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_022544	A	6	6	2027166	2027171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_022544	T	6	6	2027220	2027225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_022544	TTG	2	6	2027266	2027271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_022544	ATT	2	6	2027294	2027299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_022544	TTA	2	6	2028556	2028561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_022544	ACA	2	6	2028631	2028636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_022544	T	6	6	2028641	2028646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_022544	GGAAA	2	10	2028681	2028690	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_022544	GAT	2	6	2028702	2028707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_022544	GAT	2	6	2028725	2028730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_022544	ATC	2	6	2028732	2028737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_022544	A	6	6	2028745	2028750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_022544	ATT	2	6	2028774	2028779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_022544	A	6	6	2028855	2028860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_022544	TTA	2	6	2028953	2028958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_022544	GAA	2	6	2029229	2029234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_022544	AG	3	6	2029242	2029247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_022544	A	7	7	2029248	2029254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_022544	ATG	2	6	2029281	2029286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_022544	ACT	2	6	2029302	2029307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_022544	A	7	7	2029381	2029387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_022544	T	6	6	2029397	2029402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_022544	GAT	2	6	2029603	2029608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_022544	TA	3	6	2031356	2031361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_022544	AGT	2	6	2031363	2031368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_022544	GC	3	6	2031382	2031387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_022544	TCG	2	6	2031421	2031426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_022544	TC	4	8	2031442	2031449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_022544	AGA	2	6	2031896	2031901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_022544	GA	3	6	2031927	2031932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_022544	TAA	2	6	2032015	2032020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_022544	A	6	6	2032027	2032032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_022544	T	6	6	2032107	2032112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_022544	CAA	2	6	2032144	2032149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_022544	TGG	2	6	2032177	2032182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_022544	CAATA	2	10	2032455	2032464	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6104	NC_022544	AAG	2	6	2032479	2032484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_022544	C	7	7	2032518	2032524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6106	NC_022544	TTA	2	6	2032604	2032609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_022544	TCGA	2	8	2033765	2033772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6108	NC_022544	CG	3	6	2033787	2033792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_022544	GTG	2	6	2033824	2033829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_022544	AAAAG	2	10	2033941	2033950	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_022544	TAA	2	6	2033956	2033961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_022544	CG	5	10	2037208	2037217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_022544	CTC	2	6	2037230	2037235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_022544	CTCCAG	2	12	2043100	2043111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_022544	CGC	2	6	2043124	2043129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_022544	CCG	2	6	2043130	2043135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_022544	AGT	2	6	2045383	2045388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_022544	TCA	2	6	2045394	2045399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_022544	CCT	2	6	2045409	2045414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_022544	AGCC	2	8	2046956	2046963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_022544	ATC	2	6	2047057	2047062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_022544	TCCG	2	8	2047139	2047146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_022544	CAG	2	6	2047165	2047170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_022544	TTC	2	6	2047228	2047233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_022544	CCA	2	6	2047492	2047497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_022544	CCG	2	6	2050601	2050606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_022544	CTG	2	6	2050612	2050617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_022544	CCA	2	6	2050638	2050643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_022544	CAA	3	9	2050674	2050682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_022544	CCG	2	6	2050686	2050691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_022544	CCA	2	6	2050743	2050748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_022544	GGGC	2	8	2053061	2053068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_022544	ATT	2	6	2053128	2053133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_022544	TAA	2	6	2053521	2053526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_022544	CCT	2	6	2053854	2053859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6136	NC_022544	CAT	2	6	2053895	2053900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6137	NC_022544	CTG	2	6	2053921	2053926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6138	NC_022544	TTCA	2	8	2053987	2053994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6139	NC_022544	CCA	2	6	2054033	2054038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6140	NC_022544	TGA	2	6	2054505	2054510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_022544	CA	3	6	2054518	2054523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6142	NC_022544	CG	3	6	2054604	2054609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6145	NC_022544	CG	3	6	2056233	2056238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6146	NC_022544	GGC	2	6	2056241	2056246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6147	NC_022544	TTG	2	6	2056265	2056270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6148	NC_022544	ATC	2	6	2056332	2056337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6150	NC_022544	GGTAT	2	10	2056412	2056421	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_022544	AGA	2	6	2056467	2056472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_022544	TGC	2	6	2056473	2056478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6155	NC_022544	CTG	2	6	2056494	2056499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6164	NC_022544	GTC	2	6	2059672	2059677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6166	NC_022544	GAT	2	6	2059765	2059770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6175	NC_022544	TAATG	2	10	2064410	2064419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6252	NC_022544	AAAAG	2	10	2082769	2082778	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6254	NC_022544	AAG	2	6	2082812	2082817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6258	NC_022544	CCA	2	6	2083774	2083779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6260	NC_022544	C	6	6	2083939	2083944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6261	NC_022544	A	6	6	2083961	2083966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6379	NC_022544	AT	3	6	2147767	2147772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6380	NC_022544	ATT	2	6	2147801	2147806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6381	NC_022544	ATC	2	6	2147823	2147828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6390	NC_022544	ATAA	2	8	2157248	2157255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6391	NC_022544	TAA	2	6	2157286	2157291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6392	NC_022544	AT	3	6	2157344	2157349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6393	NC_022544	TAT	3	9	2157347	2157355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6395	NC_022544	AGT	2	6	2157383	2157388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6397	NC_022544	AT	4	8	2157409	2157416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6398	NC_022544	AAAAG	2	10	2157436	2157445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6401	NC_022544	ATTT	2	8	2159868	2159875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6432	NC_022544	ACTCC	2	10	2193026	2193035	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6433	NC_022544	AT	3	6	2193054	2193059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6434	NC_022544	ATT	2	6	2193067	2193072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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