MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022544	CAC	2	6	1886593	1886598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_022544	GGAA	2	8	1886635	1886642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_022544	TCAA	2	8	1886909	1886916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_022544	CTAA	2	8	1886936	1886943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_022544	AAAAG	2	10	1886944	1886953	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_022544	GTA	2	6	1886956	1886961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_022544	AATA	2	8	1887207	1887214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_022544	AAT	2	6	1887237	1887242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_022544	TGT	2	6	1887257	1887262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_022544	ATA	2	6	1887279	1887284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_022544	TAA	2	6	1887288	1887293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_022544	A	7	7	1887353	1887359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_022544	GCT	2	6	1887378	1887383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_022544	T	8	8	1887383	1887390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_022544	TAA	2	6	1887401	1887406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_022544	TAT	2	6	1888250	1888255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_022544	AAC	2	6	1888316	1888321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_022544	ATT	3	9	1888339	1888347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_022544	TTA	2	6	1888364	1888369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_022544	GAC	2	6	1890819	1890824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_022544	A	9	9	1890838	1890846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_022544	T	6	6	1890856	1890861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_022544	GGCCT	2	10	1892929	1892938	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5524	NC_022544	CAA	2	6	1893659	1893664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_022544	GCA	2	6	1893665	1893670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_022544	ATT	2	6	1894326	1894331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_022544	GC	3	6	1898286	1898291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_022544	T	7	7	1898295	1898301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_022544	A	7	7	1899766	1899772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_022544	TTAT	2	8	1900138	1900145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_022544	C	6	6	1900163	1900168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5532	NC_022544	AGT	2	6	1900199	1900204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_022544	T	7	7	1901136	1901142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_022544	TGT	2	6	1901160	1901165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_022544	ATC	2	6	1901205	1901210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_022544	TCC	2	6	1901299	1901304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_022544	CAT	2	6	1901512	1901517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_022544	AAC	2	6	1901541	1901546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_022544	A	7	7	1901559	1901565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_022544	TAA	2	6	1901593	1901598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_022544	ATT	2	6	1901601	1901606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_022544	GAC	2	6	1901653	1901658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_022544	AT	3	6	1901689	1901694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_022544	GTATT	2	10	1901736	1901745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_022544	TAC	2	6	1901746	1901751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_022544	A	6	6	1902536	1902541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_022544	ATTTT	2	10	1902586	1902595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_022544	TTC	2	6	1902610	1902615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_022544	T	8	8	1902630	1902637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_022544	TTCAA	2	10	1902708	1902717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5551	NC_022544	ATT	3	9	1902747	1902755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_022544	TGT	2	6	1902764	1902769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_022544	GGCT	2	8	1902792	1902799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_022544	CGCCA	2	10	1902849	1902858	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5555	NC_022544	AATT	2	8	1902894	1902901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_022544	TA	3	6	1902912	1902917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_022544	AAATG	2	10	1902950	1902959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_022544	A	7	7	1902983	1902989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_022544	AAT	2	6	1903002	1903007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_022544	ATT	3	9	1903063	1903071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_022544	GCT	2	6	1903096	1903101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_022544	CAA	2	6	1903108	1903113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_022544	ACA	2	6	1903123	1903128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_022544	TAA	2	6	1903566	1903571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_022544	CCGA	2	8	1903667	1903674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_022544	GCA	2	6	1903676	1903681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_022544	ACA	2	6	1903701	1903706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_022544	TCTA	2	8	1903784	1903791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_022544	A	6	6	1903866	1903871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_022544	TCT	2	6	1904366	1904371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_022544	ATTA	2	8	1904408	1904415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_022544	CAG	2	6	1904434	1904439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_022544	TAT	2	6	1904462	1904467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_022544	TA	3	6	1904490	1904495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_022544	GCC	2	6	1904527	1904532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_022544	GT	3	6	1904664	1904669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_022544	CAA	2	6	1904676	1904681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_022544	AT	3	6	1904686	1904691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_022544	GCA	2	6	1904740	1904745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_022544	TTAA	2	8	1905219	1905226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_022544	GTTT	2	8	1905242	1905249	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_022544	CAC	2	6	1905469	1905474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_022544	GAT	2	6	1905523	1905528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_022544	AAGC	2	8	1905821	1905828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_022544	AAGG	2	8	1905861	1905868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_022544	AGA	2	6	1905905	1905910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_022544	ACA	2	6	1905918	1905923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_022544	TCAA	2	8	1905959	1905966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_022544	CAA	2	6	1906056	1906061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_022544	CAG	2	6	1906090	1906095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_022544	AGA	2	6	1906132	1906137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_022544	AG	3	6	1906201	1906206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_022544	TTA	2	6	1906256	1906261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_022544	ATA	2	6	1906293	1906298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_022544	GCC	2	6	1906315	1906320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_022544	T	6	6	1906343	1906348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_022544	ATAA	2	8	1906369	1906376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_022544	CGG	2	6	1906489	1906494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_022544	CATC	2	8	1906584	1906591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_022544	GCC	2	6	1906601	1906606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_022544	TCGG	2	8	1906610	1906617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5602	NC_022544	TGG	2	6	1906631	1906636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_022544	CA	3	6	1906761	1906766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_022544	GCCA	2	8	1906846	1906853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_022544	TTG	2	6	1906912	1906917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_022544	GAC	2	6	1906944	1906949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_022544	CGT	2	6	1907066	1907071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_022544	CGA	2	6	1907090	1907095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_022544	CTT	2	6	1907169	1907174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_022544	AGC	2	6	1907176	1907181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_022544	GT	3	6	1907213	1907218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_022544	CAGC	2	8	1907321	1907328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_022544	TTAC	2	8	1907510	1907517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5614	NC_022544	TCAGT	2	10	1907522	1907531	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5615	NC_022544	ATT	2	6	1907535	1907540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_022544	ATT	2	6	1908057	1908062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_022544	A	7	7	1908087	1908093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_022544	ATTA	2	8	1908160	1908167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_022544	CAAA	2	8	1908284	1908291	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_022544	CAA	2	6	1908378	1908383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_022544	ATC	2	6	1908938	1908943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_022544	CAA	2	6	1908982	1908987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_022544	ATG	2	6	1909000	1909005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_022544	CTG	2	6	1909065	1909070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_022544	TAT	2	6	1909122	1909127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_022544	TCT	2	6	1909151	1909156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_022544	A	6	6	1909184	1909189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_022544	GAA	2	6	1909196	1909201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_022544	T	6	6	1909210	1909215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_022544	T	7	7	1909237	1909243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_022544	TAA	2	6	1910181	1910186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_022544	AAT	2	6	1910191	1910196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_022544	TAA	2	6	1910288	1910293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_022544	T	6	6	1910299	1910304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_022544	GT	3	6	1910467	1910472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5636	NC_022544	AT	3	6	1911115	1911120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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