MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022544	CT	3	6	1577301	1577306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_022544	ATAA	2	8	1578993	1579000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_022544	GAA	2	6	1579003	1579008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_022544	AAT	2	6	1579015	1579020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_022544	TC	3	6	1581781	1581786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_022544	TAT	2	6	1581796	1581801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_022544	AAAAG	2	10	1582314	1582323	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_022544	AAC	3	9	1582395	1582403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_022544	TA	3	6	1582460	1582465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_022544	CGGG	2	8	1584054	1584061	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_022544	AATG	2	8	1584067	1584074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_022544	AG	3	6	1584175	1584180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_022544	CCT	2	6	1584724	1584729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_022544	TGA	2	6	1584733	1584738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_022544	TAA	2	6	1584764	1584769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_022544	T	6	6	1584830	1584835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_022544	AAC	2	6	1584922	1584927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_022544	ATT	2	6	1584953	1584958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_022544	TGG	2	6	1584964	1584969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_022544	GGAT	2	8	1584985	1584992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_022544	GCT	2	6	1585419	1585424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_022544	ATT	2	6	1585439	1585444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_022544	AT	4	8	1585486	1585493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_022544	AAT	2	6	1585504	1585509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_022544	ATT	2	6	1586465	1586470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_022544	GC	3	6	1586492	1586497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_022544	TAT	2	6	1586524	1586529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_022544	CAA	2	6	1586530	1586535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_022544	AT	3	6	1586640	1586645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_022544	CAG	2	6	1586706	1586711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_022544	TGG	2	6	1586726	1586731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_022544	GTG	2	6	1586784	1586789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_022544	GCC	2	6	1586828	1586833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_022544	TGA	2	6	1586845	1586850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_022544	GC	3	6	1586858	1586863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_022544	TCC	2	6	1586944	1586949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_022544	CCAGCG	2	12	1586957	1586968	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_022544	GTT	2	6	1587066	1587071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_022544	CAG	2	6	1587105	1587110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_022544	TGGCG	2	10	1587121	1587130	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4541	NC_022544	CAG	2	6	1587146	1587151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_022544	TAT	2	6	1587321	1587326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_022544	A	6	6	1587384	1587389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_022544	TCCCT	2	10	1587410	1587419	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4545	NC_022544	GCA	2	6	1587479	1587484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_022544	CACGC	2	10	1587485	1587494	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4547	NC_022544	A	7	7	1587501	1587507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_022544	TCG	2	6	1587526	1587531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_022544	GCT	2	6	1587568	1587573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_022544	CTGA	2	8	1587578	1587585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_022544	ACA	2	6	1587644	1587649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_022544	TTG	2	6	1587656	1587661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_022544	GCA	2	6	1587729	1587734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_022544	AGC	2	6	1587826	1587831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_022544	TGG	2	6	1587877	1587882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_022544	T	6	6	1588076	1588081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_022544	AGGCC	2	10	1588151	1588160	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4558	NC_022544	TGC	3	9	1588170	1588178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_022544	T	8	8	1588261	1588268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_022544	ATT	2	6	1588341	1588346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_022544	T	6	6	1588447	1588452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_022544	AGA	2	6	1588527	1588532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_022544	ATTTA	2	10	1588539	1588548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_022544	AGA	2	6	1588723	1588728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_022544	CT	3	6	1588734	1588739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_022544	TGT	2	6	1588740	1588745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_022544	CTT	2	6	1588778	1588783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_022544	ATT	2	6	1588800	1588805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_022544	TAA	2	6	1588818	1588823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_022544	TCT	2	6	1588841	1588846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_022544	TTC	2	6	1588854	1588859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_022544	A	6	6	1588920	1588925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_022544	ATC	3	9	1589013	1589021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_022544	TAT	2	6	1589099	1589104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_022544	TGG	2	6	1589106	1589111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_022544	AG	3	6	1589131	1589136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_022544	ATG	2	6	1589170	1589175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4579	NC_022544	TAA	2	6	1589244	1589249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_022544	ATTT	2	8	1589309	1589316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_022544	ATATTT	2	12	1589421	1589432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_022544	ATTC	2	8	1589465	1589472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_022544	TAC	2	6	1589489	1589494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4585	NC_022544	ACC	2	6	1589513	1589518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_022544	CTA	2	6	1589614	1589619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_022544	GAT	2	6	1589644	1589649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_022544	ACA	2	6	1590910	1590915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_022544	GAA	2	6	1590919	1590924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_022544	AGA	2	6	1591854	1591859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_022544	AC	3	6	1591905	1591910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_022544	AAT	2	6	1592280	1592285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_022544	TA	3	6	1592286	1592291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_022544	ATA	2	6	1592340	1592345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_022544	CTC	2	6	1592349	1592354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_022544	TC	3	6	1592353	1592358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_022544	TAT	2	6	1592389	1592394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_022544	TGA	2	6	1592424	1592429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_022544	GAGC	2	8	1592547	1592554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_022544	TCA	2	6	1592574	1592579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_022544	A	6	6	1593069	1593074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_022544	TGC	2	6	1593089	1593094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_022544	TGT	2	6	1593128	1593133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_022544	T	6	6	1593172	1593177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_022544	TGA	2	6	1593181	1593186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_022544	CTTT	2	8	1593208	1593215	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_022544	AT	3	6	1593221	1593226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_022544	CCT	2	6	1593228	1593233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_022544	TCT	2	6	1593249	1593254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_022544	TATCC	2	10	1593299	1593308	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4611	NC_022544	TAA	2	6	1593314	1593319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_022544	AT	3	6	1593403	1593408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_022544	TTC	2	6	1593410	1593415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_022544	AATT	2	8	1593508	1593515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_022544	TAAA	2	8	1593531	1593538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_022544	TTTC	2	8	1593814	1593821	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_022544	GAG	2	6	1593860	1593865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_022544	TGG	2	6	1594123	1594128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_022544	AT	3	6	1594135	1594140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_022544	GAT	2	6	1594141	1594146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_022544	ACG	2	6	1594149	1594154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_022544	CGG	2	6	1595897	1595902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_022544	GCC	2	6	1595908	1595913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_022544	TCT	2	6	1595925	1595930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_022544	AC	3	6	1595952	1595957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_022544	CTA	2	6	1595988	1595993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_022544	GCC	2	6	1596067	1596072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_022544	TCA	2	6	1596082	1596087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_022544	TTAC	2	8	1596129	1596136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4630	NC_022544	TAA	2	6	1596156	1596161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_022544	GCT	2	6	1596180	1596185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_022544	CA	3	6	1596191	1596196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4633	NC_022544	ATC	2	6	1596199	1596204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_022544	GTC	2	6	1597198	1597203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_022544	ACAG	2	8	1597211	1597218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4636	NC_022544	T	6	6	1601880	1601885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_022544	CCT	2	6	1601899	1601904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4638	NC_022544	GCA	2	6	1601912	1601917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4639	NC_022544	T	6	6	1601978	1601983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_022544	A	6	6	1602060	1602065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4641	NC_022544	TTG	2	6	1602178	1602183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4642	NC_022544	CGGG	2	8	1603035	1603042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4643	NC_022544	GATATT	2	12	1603045	1603056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4644	NC_022544	CTC	2	6	1603149	1603154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4645	NC_022544	TAATG	2	10	1603213	1603222	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4646	NC_022544	AT	3	6	1603241	1603246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4647	NC_022544	TTA	2	6	1603269	1603274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4648	NC_022544	ATA	2	6	1603281	1603286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4649	NC_022544	TAC	2	6	1603296	1603301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4650	NC_022544	AT	3	6	1603343	1603348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4651	NC_022544	TTA	2	6	1603350	1603355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4652	NC_022544	CA	3	6	1603407	1603412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4653	NC_022544	AAT	2	6	1603419	1603424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4654	NC_022544	TTA	2	6	1603442	1603447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4655	NC_022544	TGT	2	6	1604645	1604650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4656	NC_022544	GGCT	2	8	1604679	1604686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4662	NC_022544	A	7	7	1607495	1607501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4663	NC_022544	T	6	6	1607542	1607547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4664	NC_022544	TTC	2	6	1607554	1607559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4665	NC_022544	CGT	2	6	1615769	1615774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4666	NC_022544	ATG	2	6	1615795	1615800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4667	NC_022544	TTC	2	6	1615802	1615807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4669	NC_022544	CATTAA	2	12	1617611	1617622	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4671	NC_022544	A	7	7	1617706	1617712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4676	NC_022544	TCAA	2	8	1618584	1618591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4682	NC_022544	CCG	2	6	1618899	1618904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4692	NC_022544	ATT	2	6	1622124	1622129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4693	NC_022544	CTTAA	2	10	1622192	1622201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4694	NC_022544	TCCT	2	8	1625145	1625152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4751	NC_022544	ATA	2	6	1640496	1640501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4754	NC_022544	AAT	2	6	1641596	1641601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4761	NC_022544	C	6	6	1644598	1644603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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