MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022525	GGC	2	6	1521086	1521091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_022525	GCC	2	6	1521141	1521146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_022525	CG	3	6	1521172	1521177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_022525	AAT	2	6	1522128	1522133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_022525	ATT	2	6	1522189	1522194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_022525	TGA	2	6	1522256	1522261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_022525	A	7	7	1522282	1522288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_022525	GCTAA	2	10	1522302	1522311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4009	NC_022525	TAA	2	6	1522327	1522332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_022525	TTAAT	2	10	1522334	1522343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_022525	ATG	2	6	1522373	1522378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_022525	GCT	2	6	1522438	1522443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_022525	A	6	6	1522479	1522484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_022525	T	6	6	1522490	1522495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_022525	AG	3	6	1522532	1522537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_022525	CTG	2	6	1522555	1522560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_022525	CAT	2	6	1522618	1522623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_022525	GCG	2	6	1525592	1525597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_022525	TTG	2	6	1525646	1525651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_022525	TTC	2	6	1525700	1525705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_022525	GCC	2	6	1525710	1525715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_022525	TGTA	2	8	1525739	1525746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_022525	AAT	3	9	1526818	1526826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_022525	GTCG	2	8	1526832	1526839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4025	NC_022525	AAG	2	6	1526873	1526878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_022525	ATC	2	6	1526947	1526952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_022525	TC	3	6	1527095	1527100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_022525	ATTTT	2	10	1527139	1527148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_022525	T	6	6	1527145	1527150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_022525	TGC	2	6	1527155	1527160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_022525	GCA	2	6	1527163	1527168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_022525	TGG	2	6	1528755	1528760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_022525	ATT	2	6	1528770	1528775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_022525	AAC	2	6	1528776	1528781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_022525	TAC	2	6	1528792	1528797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_022525	T	6	6	1528926	1528931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_022525	GGC	2	6	1528944	1528949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_022525	GC	3	6	1528992	1528997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_022525	GCA	2	6	1528999	1529004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_022525	GTGA	2	8	1529345	1529352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_022525	ATA	2	6	1529412	1529417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_022525	GGT	2	6	1529515	1529520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_022525	ATT	2	6	1529646	1529651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_022525	AT	3	6	1530996	1531001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_022525	CA	3	6	1532015	1532020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_022525	ATT	2	6	1532022	1532027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_022525	T	6	6	1533280	1533285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_022525	TGT	2	6	1533289	1533294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_022525	TAT	2	6	1533355	1533360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_022525	ATA	2	6	1535421	1535426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_022525	AAT	2	6	1535435	1535440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_022525	CGG	2	6	1535468	1535473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_022525	TTAT	2	8	1538203	1538210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_022525	GT	3	6	1538930	1538935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_022525	GTT	2	6	1538977	1538982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_022525	TG	3	6	1539149	1539154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_022525	CGCA	2	8	1539875	1539882	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_022525	A	6	6	1543831	1543836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_022525	GGC	2	6	1543902	1543907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_022525	TTA	2	6	1546364	1546369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_022525	TA	3	6	1546376	1546381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_022525	ATT	2	6	1546399	1546404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_022525	ATG	2	6	1546414	1546419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_022525	ATT	2	6	1546448	1546453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_022525	AGG	3	9	1546494	1546502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_022525	ATG	2	6	1546880	1546885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_022525	ACC	2	6	1548639	1548644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_022525	TGT	2	6	1548714	1548719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_022525	CG	3	6	1549088	1549093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4070	NC_022525	GTA	2	6	1549146	1549151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_022525	AAT	2	6	1551452	1551457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_022525	TGC	2	6	1552925	1552930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_022525	T	8	8	1554847	1554854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_022525	TGT	2	6	1556528	1556533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_022525	GTT	2	6	1558694	1558699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_022525	AAC	2	6	1558711	1558716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_022525	TGA	2	6	1558742	1558747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_022525	GTG	2	6	1558825	1558830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_022525	TTA	2	6	1558848	1558853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_022525	AT	3	6	1558880	1558885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_022525	TAT	2	6	1558903	1558908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_022525	AAT	2	6	1558912	1558917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_022525	CATAT	2	10	1558986	1558995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4084	NC_022525	CAT	3	9	1559007	1559015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_022525	AT	3	6	1559233	1559238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_022525	T	7	7	1559279	1559285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_022525	GGCC	2	8	1559307	1559314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_022525	ATT	2	6	1559322	1559327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_022525	GTTC	2	8	1559893	1559900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_022525	ATTT	2	8	1559917	1559924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_022525	ATT	2	6	1559945	1559950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_022525	CAA	2	6	1559963	1559968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_022525	GCG	2	6	1560000	1560005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_022525	A	6	6	1560043	1560048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_022525	ATT	2	6	1560057	1560062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_022525	TTA	2	6	1560268	1560273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_022525	GA	3	6	1560276	1560281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_022525	CG	3	6	1560677	1560682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_022525	CGG	2	6	1560930	1560935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_022525	T	9	9	1560936	1560944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_022525	GCA	2	6	1560984	1560989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_022525	T	6	6	1561151	1561156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_022525	A	6	6	1561157	1561162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_022525	TATT	2	8	1561214	1561221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_022525	CAG	2	6	1561291	1561296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_022525	AT	3	6	1561311	1561316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_022525	CCTG	2	8	1562559	1562566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_022525	ATG	2	6	1562617	1562622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_022525	GT	3	6	1562676	1562681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_022525	AAAAG	2	10	1562705	1562714	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_022525	TAA	2	6	1562764	1562769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_022525	AAG	2	6	1563699	1563704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_022525	GCG	2	6	1563741	1563746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_022525	A	7	7	1563771	1563777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_022525	T	6	6	1564442	1564447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_022525	TAAT	2	8	1564903	1564910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_022525	GC	3	6	1565077	1565082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_022525	GTC	2	6	1565817	1565822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_022525	ATT	2	6	1568066	1568071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_022525	ATG	2	6	1568099	1568104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_022525	GA	3	6	1568124	1568129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_022525	GT	3	6	1570887	1570892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_022525	AGC	2	6	1570936	1570941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_022525	AT	3	6	1570953	1570958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_022525	ACA	2	6	1570986	1570991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_022525	GTT	2	6	1571000	1571005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_022525	T	7	7	1571004	1571010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_022525	A	7	7	1571032	1571038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_022525	CAGGG	2	10	1571046	1571055	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4130	NC_022525	A	6	6	1572726	1572731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_022525	TTTG	2	8	1572786	1572793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_022525	TTG	3	9	1572835	1572843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_022525	TATT	2	8	1572862	1572869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_022525	CA	3	6	1620205	1620210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4262	NC_022525	AAT	2	6	1620217	1620222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_022525	TTA	2	6	1620240	1620245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_022525	TGT	2	6	1621443	1621448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_022525	GGCT	2	8	1621477	1621484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4267	NC_022525	TGCC	2	8	1621597	1621604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4268	NC_022525	TCA	2	6	1621973	1621978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4269	NC_022525	TAA	2	6	1624186	1624191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_022525	CAT	2	6	1624230	1624235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4271	NC_022525	CGCGC	2	10	1624246	1624255	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4272	NC_022525	T	6	6	1624264	1624269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_022525	A	7	7	1624294	1624300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_022525	T	6	6	1624341	1624346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4275	NC_022525	T	7	7	1624350	1624356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4276	NC_022525	CGT	2	6	1632553	1632558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4279	NC_022525	A	6	6	1633533	1633538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4280	NC_022525	CATTAA	2	12	1634395	1634406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4282	NC_022525	A	6	6	1634490	1634495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4286	NC_022525	CTT	2	6	1635305	1635310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4287	NC_022525	CTC	2	6	1635342	1635347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4288	NC_022525	TC	3	6	1635346	1635351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4289	NC_022525	TCAA	2	8	1635366	1635373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4290	NC_022525	CTTAT	2	10	1635432	1635441	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4292	NC_022525	ATTA	2	8	1635514	1635521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4293	NC_022525	CAC	2	6	1635586	1635591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4295	NC_022525	TCT	2	6	1635627	1635632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4306	NC_022525	ATT	2	6	1638901	1638906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4307	NC_022525	CTTAA	2	10	1638969	1638978	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4308	NC_022525	TCCT	2	8	1641911	1641918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4380	NC_022525	GTT	2	6	1666763	1666768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4382	NC_022525	T	6	6	1666849	1666854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4386	NC_022525	AGGA	2	8	1674870	1674877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_022525	T	6	6	1676701	1676706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_022525	CAG	2	6	1676707	1676712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4390	NC_022525	TTG	2	6	1676769	1676774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4392	NC_022525	GCA	2	6	1676849	1676854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4394	NC_022525	CCTT	2	8	1678388	1678395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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