MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022525	CCAT	2	8	401376	401383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_022525	CA	3	6	401472	401477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_022525	CTCATT	2	12	401525	401536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_022525	AATGT	2	10	401546	401555	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_022525	GCA	2	6	401588	401593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_022525	ATT	2	6	401648	401653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022525	TCT	2	6	401717	401722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_022525	TTTC	2	8	401726	401733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_022525	TGAAA	2	10	401830	401839	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_022525	TA	3	6	401858	401863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022525	GGA	2	6	407552	407557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022525	ATT	2	6	407574	407579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022525	CAA	2	6	407689	407694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_022525	GGA	2	6	408356	408361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022525	CCT	2	6	408410	408415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_022525	AAAC	2	8	408437	408444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_022525	TC	3	6	408454	408459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_022525	TC	3	6	408553	408558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_022525	ATAG	2	8	408568	408575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022525	ATA	2	6	408644	408649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022525	T	6	6	408712	408717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022525	ATT	2	6	408827	408832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022525	T	6	6	408889	408894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022525	ATA	2	6	408902	408907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022525	GTC	2	6	408909	408914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_022525	ATG	2	6	408918	408923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022525	AAT	2	6	410158	410163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022525	TC	3	6	410363	410368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_022525	AAGG	2	8	410428	410435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022525	A	7	7	412048	412054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022525	AT	3	6	412067	412072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_022525	GAA	2	6	412095	412100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_022525	TGT	2	6	413341	413346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022525	T	6	6	413444	413449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022525	GATGC	2	10	413505	413514	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_022525	TAA	2	6	413550	413555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022525	A	6	6	413554	413559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_022525	AT	3	6	413599	413604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_022525	TAA	2	6	413639	413644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022525	TG	3	6	413678	413683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022525	TA	3	6	413709	413714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022525	ATA	2	6	414302	414307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022525	GCT	2	6	414312	414317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_022525	TGA	2	6	414393	414398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022525	TTA	2	6	415303	415308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022525	AT	3	6	415713	415718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_022525	GC	5	10	415728	415737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_022525	CG	4	8	415749	415756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_022525	CAT	2	6	421782	421787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_022525	CA	3	6	424730	424735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_022525	CGCTT	2	10	424994	425003	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1052	NC_022525	TAA	2	6	425064	425069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_022525	TA	3	6	425110	425115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022525	GAC	2	6	425165	425170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_022525	CGC	2	6	425189	425194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_022525	T	6	6	425212	425217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022525	C	6	6	426531	426536	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1058	NC_022525	AAC	2	6	426560	426565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_022525	ATG	2	6	426574	426579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022525	ATC	2	6	426605	426610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_022525	T	6	6	426617	426622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022525	ATTG	2	8	426634	426641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022525	GCC	2	6	431669	431674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_022525	AGCG	2	8	431679	431686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_022525	CCCGT	2	10	431714	431723	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1066	NC_022525	T	7	7	431819	431825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022525	TAC	2	6	431906	431911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_022525	GAC	2	6	431930	431935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_022525	CAGC	2	8	431971	431978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_022525	A	8	8	431982	431989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_022525	CGTTT	2	10	432041	432050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_022525	TA	4	8	432091	432098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_022525	GGGA	2	8	432102	432109	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022525	A	6	6	434534	434539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022525	ATGG	2	8	434557	434564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_022525	CTG	2	6	434591	434596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_022525	CTGA	2	8	434650	434657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_022525	C	6	6	434660	434665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1079	NC_022525	TC	3	6	434679	434684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_022525	C	6	6	434745	434750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1081	NC_022525	ATT	2	6	434767	434772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022525	CCG	2	6	435889	435894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_022525	T	6	6	435924	435929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_022525	TAA	2	6	435986	435991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_022525	CTCTT	2	10	438798	438807	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1086	NC_022525	TTA	2	6	438831	438836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_022525	GAT	2	6	438849	438854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_022525	GTT	2	6	438893	438898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022525	ACT	2	6	438943	438948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_022525	GAT	2	6	438989	438994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_022525	TAA	3	9	438999	439007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022525	CAT	2	6	439307	439312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_022525	CGG	2	6	439334	439339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_022525	T	6	6	441087	441092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_022525	TTTTC	2	10	441164	441173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_022525	CTTTG	2	10	441271	441280	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_022525	GCC	2	6	442235	442240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_022525	TACGG	2	10	442278	442287	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_022525	AAT	2	6	442317	442322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022525	TTA	2	6	443512	443517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022525	CCAG	2	8	444997	445004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_022525	GCG	2	6	446999	447004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_022525	GC	3	6	447008	447013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_022525	GCAG	2	8	448051	448058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_022525	CTT	2	6	448121	448126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_022525	TA	3	6	448128	448133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022525	GTT	2	6	448187	448192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022525	ATT	2	6	448237	448242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022525	TATAT	2	10	448275	448284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022525	T	7	7	448293	448299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022525	TTA	2	6	448352	448357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022525	AAT	2	6	448399	448404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_022525	CGC	2	6	448423	448428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_022525	CTT	2	6	448435	448440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_022525	GAG	2	6	448501	448506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022525	TC	3	6	451495	451500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_022525	ATT	2	6	451555	451560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022525	CGA	2	6	452235	452240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_022525	GGT	2	6	453425	453430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022525	TAC	2	6	453443	453448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_022525	CGG	2	6	453450	453455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_022525	A	6	6	453478	453483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022525	A	6	6	453491	453496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022525	CGG	2	6	453502	453507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_022525	CTG	2	6	453576	453581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022525	TCG	2	6	453592	453597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_022525	GCC	2	6	453695	453700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_022525	CAG	2	6	453705	453710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_022525	TAA	2	6	453714	453719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_022525	AAG	2	6	453724	453729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022525	GC	3	6	456101	456106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_022525	GAT	2	6	456434	456439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022525	CTCG	2	8	456629	456636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_022525	TTG	2	6	456661	456666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022525	TA	3	6	458841	458846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022525	ATG	2	6	458867	458872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022525	ACC	2	6	458918	458923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_022525	GCTAA	2	10	458940	458949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1268	NC_022525	AAAG	2	8	516646	516653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_022525	TAT	2	6	521736	521741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_022525	AAATTT	2	12	521766	521777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1275	NC_022525	T	6	6	521865	521870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_022525	TTA	2	6	521910	521915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1281	NC_022525	TGT	2	6	524249	524254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1283	NC_022525	GTTTT	2	10	524725	524734	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_022525	ACGG	2	8	569370	569377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1410	NC_022525	AGCGCC	2	12	569515	569526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1411	NC_022525	T	6	6	569535	569540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_022525	GGC	2	6	569591	569596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_022525	TGG	2	6	569618	569623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_022525	A	6	6	569642	569647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_022525	T	6	6	570322	570327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_022525	GGC	2	6	570409	570414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1436	NC_022525	A	6	6	579575	579580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_022525	ATA	3	9	579662	579670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_022525	TAA	2	6	581538	581543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_022525	GAT	2	6	587574	587579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_022525	AG	3	6	587642	587647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_022525	CT	3	6	588512	588517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1454	NC_022525	GC	3	6	588552	588557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1459	NC_022525	TTTA	2	8	593218	593225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1474	NC_022525	ATA	2	6	599471	599476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1475	NC_022525	CTT	2	6	600122	600127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1479	NC_022525	T	8	8	603688	603695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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