MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022525	GAC	2	6	216815	216820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022525	T	6	6	216842	216847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022525	AAT	2	6	223586	223591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022525	CCCT	2	8	224400	224407	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
505	NC_022525	TAAAAT	2	12	224420	224431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022525	ATAAAT	2	12	225110	225121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022525	AT	3	6	225125	225130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022525	TA	3	6	225132	225137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022525	TTG	2	6	225144	225149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022525	AG	3	6	225178	225183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022525	CCAT	2	8	225205	225212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_022525	T	7	7	225228	225234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022525	TAT	2	6	225252	225257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022525	ATAA	2	8	225270	225277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022525	ATA	2	6	225281	225286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022525	TTAT	2	8	225287	225294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022525	A	7	7	225304	225310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022525	TAT	2	6	225352	225357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022525	CTT	2	6	225747	225752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_022525	TGA	2	6	226715	226720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022525	GCGCT	2	10	226733	226742	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
522	NC_022525	CGCGT	2	10	226785	226794	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
523	NC_022525	G	6	6	227665	227670	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022525	TAA	2	6	229630	229635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022525	AG	3	6	229680	229685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022525	CAT	2	6	229707	229712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_022525	CGC	2	6	229716	229721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_022525	ACGC	2	8	231321	231328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_022525	TAA	2	6	231341	231346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022525	GA	3	6	235180	235185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022525	TCT	3	9	235188	235196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_022525	GTC	2	6	235197	235202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_022525	GAA	2	6	235208	235213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022525	TCC	2	6	237887	237892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_022525	ATAA	2	8	237893	237900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022525	TTA	2	6	237915	237920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022525	CCTT	2	8	237923	237930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_022525	GTT	2	6	237939	237944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022525	CGA	2	6	237990	237995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_022525	TGC	2	6	238010	238015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_022525	TAA	3	9	238021	238029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022525	TCA	2	6	238055	238060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_022525	CAATAT	2	12	244114	244125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
544	NC_022525	ATA	2	6	244132	244137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022525	CTGTC	2	10	244181	244190	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
546	NC_022525	AAG	2	6	244227	244232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022525	GC	3	6	244276	244281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_022525	TGA	2	6	244334	244339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022525	AAT	2	6	244362	244367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022525	TAA	3	9	244456	244464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022525	ATA	2	6	244485	244490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022525	ATT	2	6	244495	244500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022525	T	7	7	244499	244505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022525	TAA	2	6	244513	244518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022525	A	6	6	244517	244522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022525	AAAT	2	8	244534	244541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022525	A	8	8	244560	244567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022525	T	6	6	244580	244585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022525	T	8	8	244587	244594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022525	AAAT	2	8	244612	244619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022525	TA	3	6	244635	244640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022525	T	7	7	244662	244668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022525	T	6	6	244692	244697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022525	CTTG	2	8	244709	244716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_022525	TTTG	2	8	244718	244725	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022525	T	6	6	244726	244731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022525	TAT	2	6	244748	244753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022525	TAAA	2	8	244772	244779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022525	A	6	6	244777	244782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022525	TTAT	2	8	244834	244841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022525	GTT	2	6	244848	244853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022525	CTT	2	6	244856	244861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_022525	ATATA	2	10	244895	244904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022525	CTA	2	6	244908	244913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022525	TAA	2	6	244976	244981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022525	ATC	2	6	245559	245564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_022525	A	7	7	245599	245605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022525	TA	3	6	245611	245616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022525	ATTTT	2	10	250613	250622	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022525	TTG	2	6	250639	250644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022525	GCG	2	6	250655	250660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_022525	A	9	9	251484	251492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022525	GGC	2	6	251499	251504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_022525	GTT	2	6	251524	251529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022525	TCT	2	6	252988	252993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_022525	C	6	6	260305	260310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
587	NC_022525	TGCTC	2	10	260383	260392	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
588	NC_022525	AGG	2	6	260395	260400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022525	CGG	2	6	261567	261572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_022525	AT	3	6	261598	261603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022525	AC	3	6	261643	261648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_022525	TCA	2	6	262050	262055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_022525	AAT	2	6	262070	262075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022525	CCA	2	6	262097	262102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_022525	A	7	7	262111	262117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022525	AGA	2	6	262132	262137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022525	GCG	2	6	262165	262170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_022525	G	6	6	263593	263598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022525	ATAA	2	8	264464	264471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022525	CT	3	6	267292	267297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_022525	GCC	2	6	267299	267304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_022525	GAT	2	6	268202	268207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022525	AAT	2	6	268214	268219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022525	TCAG	2	8	268242	268249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_022525	T	6	6	268318	268323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022525	GCC	2	6	268371	268376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_022525	CAA	2	6	268420	268425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_022525	GC	3	6	268459	268464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_022525	AC	3	6	268490	268495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_022525	AAC	2	6	268528	268533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_022525	AC	4	8	268532	268539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_022525	GGC	2	6	269399	269404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_022525	GTA	2	6	269512	269517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022525	GAG	2	6	270474	270479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022525	CTT	2	6	270494	270499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_022525	CT	3	6	270507	270512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_022525	GAAA	2	8	270602	270609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022525	TTA	2	6	271385	271390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022525	TG	3	6	271435	271440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022525	GTCTG	2	10	271444	271453	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
621	NC_022525	GTG	2	6	272091	272096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022525	AGA	2	6	272112	272117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022525	GCG	2	6	272136	272141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022525	AGA	2	6	273393	273398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022525	T	6	6	273465	273470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022525	T	6	6	273500	273505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022525	CG	3	6	273594	273599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_022525	A	6	6	273678	273683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022525	TTAG	2	8	276688	276695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022525	GAA	2	6	276696	276701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022525	ATA	2	6	276705	276710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022525	TTA	2	6	280831	280836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022525	T	8	8	288382	288389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022525	GCAG	2	8	288485	288492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_022525	T	6	6	290340	290345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022525	GCGCT	2	10	294301	294310	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
637	NC_022525	CAC	2	6	294358	294363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_022525	CAA	2	6	294371	294376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_022525	CCT	2	6	294834	294839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_022525	TAA	2	6	296085	296090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022525	GGC	2	6	296124	296129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_022525	CGCAG	2	10	296735	296744	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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646	NC_022525	AAT	2	6	299825	299830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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650	NC_022525	ATCA	2	8	302492	302499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
651	NC_022525	CTG	2	6	302527	302532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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654	NC_022525	CGGT	2	8	303270	303277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
655	NC_022525	TG	3	6	303400	303405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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663	NC_022525	GGA	2	6	303962	303967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
664	NC_022525	TAA	2	6	303980	303985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_022525	TTGTT	2	10	325171	325180	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
772	NC_022525	T	6	6	325187	325192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_022525	TA	3	6	325217	325222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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985	NC_022525	TA	3	6	394531	394536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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