MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022525	CGC	2	6	1706748	1706753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_022525	TC	3	6	1707024	1707029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_022525	ATA	2	6	1707065	1707070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_022525	GCA	2	6	1707072	1707077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_022525	GC	3	6	1707102	1707107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_022525	T	6	6	1707139	1707144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_022525	TCC	2	6	1707173	1707178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_022525	TAAAA	2	10	1707222	1707231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_022525	T	6	6	1707272	1707277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_022525	A	7	7	1710851	1710857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_022525	ATT	2	6	1711056	1711061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_022525	ATTA	2	8	1711064	1711071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_022525	ATT	2	6	1711147	1711152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_022525	AGC	2	6	1711217	1711222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_022525	AGG	2	6	1711294	1711299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_022525	AG	3	6	1711756	1711761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_022525	ATCA	2	8	1711773	1711780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_022525	CTG	2	6	1712280	1712285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_022525	GCCA	2	8	1712319	1712326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_022525	TGA	2	6	1712378	1712383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_022525	ACG	2	6	1712389	1712394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_022525	CAG	2	6	1714863	1714868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_022525	TTC	2	6	1714916	1714921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_022525	CGG	3	9	1714925	1714933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_022525	ATA	2	6	1715020	1715025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_022525	A	8	8	1715103	1715110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_022525	CGT	2	6	1715130	1715135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_022525	A	6	6	1715164	1715169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_022525	GA	4	8	1715225	1715232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_022525	T	6	6	1715285	1715290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_022525	TC	3	6	1716363	1716368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_022525	A	6	6	1716407	1716412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_022525	TTTTAT	2	12	1717637	1717648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_022525	CATC	2	8	1717769	1717776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_022525	TTA	2	6	1717883	1717888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_022525	CG	3	6	1717952	1717957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_022525	TCC	2	6	1718566	1718571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_022525	GA	3	6	1718807	1718812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_022525	CAA	3	9	1719378	1719386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_022525	TCA	2	6	1719420	1719425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_022525	ATT	2	6	1719439	1719444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_022525	TCT	2	6	1720305	1720310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_022525	TTCA	2	8	1720365	1720372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_022525	T	6	6	1721710	1721715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_022525	CAA	2	6	1721725	1721730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_022525	CG	3	6	1721743	1721748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_022525	TCT	2	6	1721824	1721829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_022525	GAT	2	6	1721841	1721846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_022525	AGGA	2	8	1721905	1721912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_022525	GTT	2	6	1723018	1723023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_022525	AGA	2	6	1723659	1723664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_022525	AGG	2	6	1724777	1724782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_022525	ATT	2	6	1725410	1725415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_022525	CTA	2	6	1725423	1725428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_022525	ATA	2	6	1725448	1725453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_022525	ATT	2	6	1725479	1725484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_022525	CCTG	2	8	1728358	1728365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_022525	TTTA	2	8	1728391	1728398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_022525	TTA	2	6	1729267	1729272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_022525	AAT	2	6	1729283	1729288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_022525	TCTT	2	8	1729446	1729453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_022525	AAC	2	6	1729471	1729476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_022525	C	6	6	1729476	1729481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4564	NC_022525	TAA	2	6	1729489	1729494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_022525	TAA	2	6	1730460	1730465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_022525	A	8	8	1730531	1730538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_022525	GGC	2	6	1730672	1730677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_022525	TC	3	6	1730726	1730731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_022525	TTAA	2	8	1730774	1730781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_022525	CT	3	6	1730786	1730791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_022525	AAC	2	6	1731989	1731994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_022525	GAC	2	6	1732004	1732009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_022525	ATTCA	2	10	1732053	1732062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4574	NC_022525	GATG	2	8	1732415	1732422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_022525	T	6	6	1732468	1732473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_022525	CTA	2	6	1733125	1733130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4578	NC_022525	TAA	2	6	1734925	1734930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_022525	T	6	6	1734943	1734948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_022525	TGCT	2	8	1734968	1734975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_022525	AAT	2	6	1735092	1735097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_022525	C	6	6	1736012	1736017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4583	NC_022525	TCTA	2	8	1736092	1736099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4584	NC_022525	AG	3	6	1736115	1736120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_022525	CGG	2	6	1737060	1737065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_022525	GGC	2	6	1737108	1737113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_022525	ATT	2	6	1738802	1738807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_022525	CAG	2	6	1738813	1738818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_022525	CGG	2	6	1738895	1738900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_022525	ACA	2	6	1738908	1738913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_022525	GAT	2	6	1738918	1738923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_022525	AAT	2	6	1740685	1740690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_022525	CTG	2	6	1741255	1741260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_022525	TAC	2	6	1741277	1741282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_022525	AAG	2	6	1741303	1741308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_022525	CTT	2	6	1741325	1741330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_022525	T	7	7	1741329	1741335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_022525	AAT	2	6	1742893	1742898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_022525	GAT	2	6	1742912	1742917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_022525	AGGA	2	8	1742937	1742944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_022525	CAA	2	6	1742951	1742956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_022525	GCG	2	6	1742988	1742993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_022525	GAAGA	2	10	1745499	1745508	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_022525	A	6	6	1745508	1745513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_022525	TAA	2	6	1745514	1745519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_022525	TTA	2	6	1745551	1745556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_022525	GA	3	6	1745568	1745573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_022525	CAA	2	6	1745575	1745580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_022525	CA	3	6	1745973	1745978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_022525	AT	3	6	1746251	1746256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_022525	TGA	2	6	1746866	1746871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_022525	GCC	2	6	1746890	1746895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_022525	ATA	2	6	1747659	1747664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_022525	A	6	6	1747694	1747699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_022525	GTG	2	6	1747707	1747712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_022525	GAC	2	6	1748741	1748746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_022525	GGAA	2	8	1754207	1754214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_022525	TGCC	2	8	1754239	1754246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_022525	GT	3	6	1754269	1754274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_022525	C	6	6	1754283	1754288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4621	NC_022525	AGC	2	6	1754328	1754333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_022525	T	6	6	1754344	1754349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_022525	A	6	6	1754363	1754368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_022525	CGC	2	6	1754386	1754391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_022525	GCA	2	6	1754415	1754420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_022525	GTA	2	6	1754560	1754565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_022525	CGA	2	6	1754759	1754764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_022525	A	7	7	1754831	1754837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_022525	CCACT	2	10	1754850	1754859	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4630	NC_022525	ATCA	2	8	1754896	1754903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_022525	AT	3	6	1754917	1754922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_022525	A	7	7	1754935	1754941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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