MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	GAAAA	2	10	3349	3358	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022443	TGAAC	2	10	7719	7728	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022443	GTAGG	2	10	15141	15150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022443	TCGAT	2	10	24551	24560	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022443	ATATT	2	10	25089	25098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022443	TTTCA	2	10	35025	35034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022443	TAAAA	2	10	36478	36487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022443	AGATA	2	10	36636	36645	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022443	ATGAG	2	10	38930	38939	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022443	TTTGT	2	10	45336	45345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022443	GTATT	2	10	61822	61831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022443	GTAAT	2	10	88997	89006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022443	TTTTC	2	10	92305	92314	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022443	ATTTT	2	10	112564	112573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022443	TACTT	2	10	119309	119318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022443	TTTAG	2	10	121135	121144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022443	CGTTT	2	10	160108	160117	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022443	CCCCA	2	10	165294	165303	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_022443	TAAAT	2	10	165381	165390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022443	TATCA	2	10	167150	167159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022443	ATCAT	2	10	175282	175291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022443	CAACT	2	10	187427	187436	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_022443	GCTTT	2	10	191939	191948	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022443	TAACA	2	10	197018	197027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022443	AATAT	2	10	216303	216312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022443	TATTT	2	10	222294	222303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022443	AACAT	2	10	230738	230747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022443	GATAA	2	10	234671	234680	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022443	ATAAC	2	10	239318	239327	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022443	TGAAT	2	10	239429	239438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022443	ATTAA	2	10	239570	239579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022443	AAAGT	2	10	243314	243323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022443	ATTAA	2	10	245025	245034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022443	AAATT	2	10	246344	246353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022443	CATGC	2	10	260317	260326	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_022443	TAAAA	2	10	260489	260498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022443	ATAAA	2	10	268398	268407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022443	TCATA	2	10	276830	276839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022443	ATTTA	2	10	290763	290772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022443	TAAAT	2	10	322121	322130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022443	ATTTT	2	10	327679	327688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022443	ATAGA	2	10	333918	333927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022443	TGACA	2	10	334104	334113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022443	TAATA	2	10	338281	338290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022443	GATAA	2	10	345117	345126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022443	TTGCA	2	10	355429	355438	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022443	GTTGA	2	10	359788	359797	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022443	TATCA	2	10	359806	359815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022443	ATTCT	2	10	379791	379800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022443	CGCAA	2	10	382127	382136	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_022443	TTGAA	2	10	383027	383036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022443	AGAAT	2	10	383354	383363	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022443	TAAGG	2	10	383418	383427	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022443	TAAAT	2	10	392238	392247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022443	ACAGT	2	10	394810	394819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022443	TTTAT	2	10	402424	402433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022443	TTGAT	2	10	402526	402535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022443	GCTTT	2	10	404894	404903	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022443	TGTAA	2	10	405978	405987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022443	CATAA	2	10	410585	410594	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022443	GAAAA	2	10	411805	411814	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022443	TTTGA	2	10	412538	412547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022443	AATAT	2	10	413700	413709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022443	TATCC	2	10	421678	421687	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_022443	TTTAT	2	10	424485	424494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022443	AAATT	2	10	427767	427776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022443	TAAAG	2	10	438569	438578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022443	CAAAG	2	10	440512	440521	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022443	AGGCA	2	10	441261	441270	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022443	CTTAA	2	10	458190	458199	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022443	CAACT	2	10	476574	476583	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_022443	GGTAA	2	10	477047	477056	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022443	TCGTG	2	10	477866	477875	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022443	GATTG	2	10	480217	480226	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022443	GATTT	2	10	484870	484879	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022443	ATATA	2	10	487288	487297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022443	CAAAG	2	10	493836	493845	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022443	TTGAT	2	10	496997	497006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022443	GAAAA	2	10	497048	497057	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022443	ATGAA	2	10	497809	497818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022443	AAGTA	2	10	514147	514156	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022443	TTAAA	2	10	516271	516280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022443	GATAA	2	10	516310	516319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022443	GGTAA	2	10	521836	521845	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022443	TCGTG	2	10	522655	522664	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022443	GATTG	2	10	524997	525006	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022443	ATATA	2	10	531890	531899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022443	AAAAT	2	10	536666	536675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022443	TTTAT	2	10	536775	536784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022443	AAAAT	2	10	539407	539416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022443	TTATG	2	10	539781	539790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022443	ATTTA	2	10	539926	539935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022443	ACAAT	2	10	541731	541740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022443	GTATA	2	10	546255	546264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022443	TATAA	2	10	549972	549981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022443	GTTTA	2	10	566135	566144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022443	TAAAG	2	10	570328	570337	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022443	ATATT	2	10	576465	576474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022443	AATTT	2	10	579389	579398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022443	ATAAA	2	10	587557	587566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022443	TTTAG	2	10	592653	592662	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022443	ATATT	2	10	598165	598174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022443	TTATA	2	10	604370	604379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022443	GAAAA	2	10	610782	610791	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022443	ATGAT	2	10	614555	614564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022443	TAATT	2	10	618042	618051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022443	ATTAT	2	10	625294	625303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022443	TAAAT	2	10	628581	628590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022443	AAATT	2	10	630585	630594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022443	TAAAA	2	10	637535	637544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022443	ATTAA	2	10	639723	639732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022443	TTATT	2	10	639772	639781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022443	CAATA	2	10	639838	639847	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022443	TTAAT	2	10	642465	642474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022443	AACAA	2	10	644170	644179	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022443	AAATA	2	10	644730	644739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022443	ATTTT	2	10	644752	644761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022443	ATAAA	2	10	651444	651453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022443	AATTT	2	10	651753	651762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022443	AAAGG	2	10	652013	652022	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022443	ATTAA	2	10	653500	653509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022443	TTTTA	2	10	653697	653706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022443	AAAGG	2	10	654018	654027	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022443	ATATA	2	10	657188	657197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022443	AAACT	2	10	660713	660722	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022443	TTCAC	2	10	665926	665935	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022443	TTTGT	2	10	669834	669843	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022443	AATGA	2	10	669907	669916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022443	GGTTG	2	10	676909	676918	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022443	AGTAG	2	10	686618	686627	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022443	AAGTT	2	10	687067	687076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022443	AATTG	2	10	687099	687108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022443	AAACT	2	10	688974	688983	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022443	ATTTA	2	10	689363	689372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022443	TTGAT	2	10	690534	690543	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022443	AAAGT	2	10	691612	691621	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022443	AATTT	2	10	694221	694230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022443	AGAAT	2	10	696164	696173	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022443	CATGA	2	10	696381	696390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022443	ATCAT	2	10	701254	701263	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022443	AATTA	2	10	712935	712944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022443	TAAAA	2	10	715995	716004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022443	GAAAA	2	10	717717	717726	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022443	TAAAG	2	10	718963	718972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022443	TTTAA	2	10	719733	719742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022443	ATTTT	2	10	729527	729536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022443	TAAGT	2	10	732549	732558	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022443	TAAAA	2	10	735364	735373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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233	NC_022443	AATTG	2	10	1025281	1025290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
234	NC_022443	AAATA	2	10	1048692	1048701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_022443	TTATG	2	10	1122766	1122775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_022443	TATAT	2	10	1138222	1138231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_022443	CAAAA	2	10	1140650	1140659	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
276	NC_022443	TTTAT	2	10	1141542	1141551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_022443	AGGTG	2	10	1144782	1144791	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_022443	TAATG	2	10	1159719	1159728	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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