MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 12897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022443	ATT	2	6	2518607	2518612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_022443	TA	3	6	2518614	2518619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_022443	ATG	2	6	2518635	2518640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_022443	TCA	2	6	2518672	2518677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_022443	CATT	2	8	2518749	2518756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12006	NC_022443	TATC	2	8	2518774	2518781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12007	NC_022443	GAT	2	6	2518802	2518807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_022443	T	7	7	2518807	2518813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_022443	TGT	2	6	2518886	2518891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_022443	AAC	2	6	2519886	2519891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_022443	T	6	6	2519919	2519924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_022443	GTC	2	6	2520899	2520904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_022443	CTC	2	6	2520906	2520911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12014	NC_022443	TGA	2	6	2520914	2520919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_022443	CTA	2	6	2520923	2520928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12016	NC_022443	TTA	2	6	2520954	2520959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_022443	ATG	2	6	2520987	2520992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_022443	CTT	2	6	2521383	2521388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_022443	ATTT	2	8	2521871	2521878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_022443	TTA	2	6	2521879	2521884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_022443	TTA	2	6	2521916	2521921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_022443	ACATAA	2	12	2521991	2522002	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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12024	NC_022443	TTCA	2	8	2522151	2522158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12025	NC_022443	A	6	6	2524290	2524295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_022443	AACA	2	8	2524305	2524312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12030	NC_022443	ATC	2	6	2524436	2524441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12033	NC_022443	TTCAA	2	10	2524521	2524530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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12035	NC_022443	GTA	3	9	2527372	2527380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12037	NC_022443	TAT	2	6	2527451	2527456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_022443	T	7	7	2527487	2527493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_022443	CT	3	6	2527525	2527530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12040	NC_022443	A	7	7	2527551	2527557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_022443	ATT	2	6	2527563	2527568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_022443	ATG	2	6	2527584	2527589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_022443	AAT	2	6	2527597	2527602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12049	NC_022443	GAGGT	2	10	2528655	2528664	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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12051	NC_022443	TAT	2	6	2528965	2528970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12053	NC_022443	TCTTT	2	10	2529010	2529019	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12054	NC_022443	AATC	2	8	2529057	2529064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12055	NC_022443	A	6	6	2529126	2529131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_022443	TTA	2	6	2529139	2529144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_022443	TTG	2	6	2529188	2529193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12059	NC_022443	A	7	7	2529213	2529219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12060	NC_022443	ATAA	2	8	2529230	2529237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_022443	A	7	7	2529250	2529256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12062	NC_022443	A	6	6	2529709	2529714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12063	NC_022443	T	6	6	2529766	2529771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_022443	GACT	2	8	2529803	2529810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12065	NC_022443	T	6	6	2531153	2531158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12066	NC_022443	ACT	2	6	2531171	2531176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12069	NC_022443	TGATA	2	10	2531331	2531340	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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12074	NC_022443	CTATT	2	10	2532716	2532725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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12078	NC_022443	TTA	2	6	2533504	2533509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_022443	TA	3	6	2533520	2533525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12080	NC_022443	AAT	2	6	2533587	2533592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12089	NC_022443	T	6	6	2536693	2536698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12092	NC_022443	AAT	2	6	2539205	2539210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12093	NC_022443	A	6	6	2539272	2539277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12095	NC_022443	ATT	2	6	2541875	2541880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12098	NC_022443	ATGG	2	8	2542843	2542850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_022443	CAT	2	6	2544474	2544479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12101	NC_022443	TAA	2	6	2545222	2545227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12103	NC_022443	TAC	2	6	2545369	2545374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12104	NC_022443	CATT	2	8	2545380	2545387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12105	NC_022443	T	6	6	2545386	2545391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12106	NC_022443	TCAT	2	8	2545681	2545688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12107	NC_022443	ATTA	2	8	2545701	2545708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_022443	CTT	2	6	2545712	2545717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12109	NC_022443	TA	3	6	2545719	2545724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12110	NC_022443	AG	3	6	2545735	2545740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12111	NC_022443	TTG	2	6	2545742	2545747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12112	NC_022443	TC	3	6	2545767	2545772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12113	NC_022443	GTAAAA	2	12	2545791	2545802	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12114	NC_022443	TA	3	6	2545817	2545822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_022443	AAT	2	6	2545869	2545874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12117	NC_022443	AT	3	6	2548381	2548386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12118	NC_022443	ATT	2	6	2548452	2548457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_022443	ATAA	2	8	2548458	2548465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12120	NC_022443	AGT	2	6	2548561	2548566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12122	NC_022443	CGG	2	6	2548622	2548627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12126	NC_022443	AGG	2	6	2548736	2548741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12128	NC_022443	A	6	6	2548990	2548995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12129	NC_022443	TGA	2	6	2549002	2549007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12130	NC_022443	CAA	2	6	2549014	2549019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12131	NC_022443	TCA	2	6	2549031	2549036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12132	NC_022443	TCC	2	6	2551227	2551232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12133	NC_022443	AAC	2	6	2551272	2551277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12134	NC_022443	AC	3	6	2551346	2551351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12135	NC_022443	TGAA	2	8	2551359	2551366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12136	NC_022443	TAGG	2	8	2551380	2551387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12137	NC_022443	ATT	2	6	2551394	2551399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12138	NC_022443	TA	3	6	2551491	2551496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12139	NC_022443	TCAT	2	8	2551547	2551554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12140	NC_022443	TAAA	2	8	2551558	2551565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12141	NC_022443	CTT	2	6	2551567	2551572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12142	NC_022443	ACT	2	6	2551639	2551644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12144	NC_022443	TTA	2	6	2557233	2557238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12145	NC_022443	ATTTAT	2	12	2557275	2557286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12146	NC_022443	TCC	2	6	2558127	2558132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12148	NC_022443	ATT	2	6	2558175	2558180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12150	NC_022443	T	7	7	2558200	2558206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12151	NC_022443	AAT	2	6	2558215	2558220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12152	NC_022443	ACAAA	2	10	2558242	2558251	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12153	NC_022443	CAT	2	6	2558315	2558320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12161	NC_022443	TTAA	2	8	2560388	2560395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12162	NC_022443	T	6	6	2560408	2560413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12163	NC_022443	ATT	2	6	2560429	2560434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12169	NC_022443	TAA	2	6	2561384	2561389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12171	NC_022443	A	7	7	2561479	2561485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12172	NC_022443	TA	3	6	2561512	2561517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12173	NC_022443	ATTA	2	8	2561541	2561548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12181	NC_022443	CTTT	2	8	2562405	2562412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12213	NC_022443	AGG	2	6	2565803	2565808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12236	NC_022443	ATTTT	2	10	2576174	2576183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12244	NC_022443	AT	3	6	2577302	2577307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12245	NC_022443	AT	3	6	2577313	2577318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12246	NC_022443	TTA	2	6	2578474	2578479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12248	NC_022443	AT	3	6	2578503	2578508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12249	NC_022443	AAT	2	6	2578526	2578531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12250	NC_022443	TA	3	6	2578927	2578932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12251	NC_022443	GCCT	2	8	2579020	2579027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12252	NC_022443	TAT	2	6	2579802	2579807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12253	NC_022443	AT	3	6	2579806	2579811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12254	NC_022443	GTCA	2	8	2579826	2579833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12255	NC_022443	A	6	6	2579833	2579838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12256	NC_022443	T	6	6	2579897	2579902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12257	NC_022443	ACA	2	6	2579926	2579931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12258	NC_022443	TCATTT	2	12	2579946	2579957	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12259	NC_022443	T	6	6	2579955	2579960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12260	NC_022443	TA	4	8	2579967	2579974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12378	NC_022443	TA	3	6	2601430	2601435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12383	NC_022443	CAATA	2	10	2601646	2601655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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12389	NC_022443	ACAAA	2	10	2603601	2603610	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12390	NC_022443	CAA	2	6	2605148	2605153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12393	NC_022443	TTTA	2	8	2605276	2605283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12394	NC_022443	T	7	7	2605325	2605331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12395	NC_022443	TATT	2	8	2605356	2605363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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