MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 12897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022443	GAG	2	6	124637	124642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022443	CAG	2	6	126543	126548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_022443	CTG	2	6	126579	126584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_022443	TAT	2	6	126589	126594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022443	CTTT	2	8	129047	129054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_022443	AT	3	6	129187	129192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022443	TAA	2	6	130317	130322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022443	CTTT	2	8	130323	130330	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_022443	AT	3	6	130382	130387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022443	ATTT	2	8	130410	130417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022443	AT	3	6	131981	131986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022443	AAGA	2	8	131996	132003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022443	GAGT	2	8	132019	132026	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022443	AT	3	6	133570	133575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022443	ACTT	2	8	133581	133588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_022443	GTTTTT	2	12	133605	133616	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022443	A	6	6	133673	133678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022443	TA	3	6	133693	133698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022443	ATC	2	6	135703	135708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_022443	T	6	6	135723	135728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022443	TGT	2	6	135771	135776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022443	AT	3	6	135830	135835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022443	A	6	6	135860	135865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022443	ATTT	2	8	135921	135928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022443	ATA	2	6	135950	135955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022443	T	6	6	135969	135974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022443	GA	3	6	135998	136003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022443	AAT	2	6	136025	136030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022443	ATA	2	6	138676	138681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022443	ATC	2	6	138682	138687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022443	A	7	7	138712	138718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022443	TATT	2	8	138766	138773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022443	AG	3	6	138785	138790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022443	T	6	6	138809	138814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022443	TAC	2	6	138858	138863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_022443	ATT	2	6	138875	138880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022443	ATAA	2	8	138892	138899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022443	AAT	2	6	138909	138914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022443	TAAT	2	8	138927	138934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022443	TA	5	10	138964	138973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022443	TTA	2	6	141252	141257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022443	ATT	2	6	141294	141299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022443	CAT	2	6	141331	141336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_022443	ATTT	2	8	141345	141352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022443	GA	3	6	144011	144016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022443	TAA	2	6	150542	150547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022443	A	7	7	150571	150577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022443	GATTTT	2	12	150578	150589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022443	TCT	2	6	150618	150623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022443	TG	3	6	150685	150690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022443	TAA	2	6	150782	150787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022443	ATC	2	6	150807	150812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_022443	CCA	2	6	150894	150899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_022443	A	6	6	150942	150947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022443	TAAA	2	8	153234	153241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022443	AG	3	6	154602	154607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022443	A	6	6	155764	155769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022443	GTT	2	6	156652	156657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022443	TAT	2	6	156737	156742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022443	TAT	2	6	156748	156753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022443	ATT	2	6	156796	156801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022443	ACG	2	6	156815	156820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022443	ATT	2	6	156854	156859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022443	TA	3	6	156881	156886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022443	ATT	2	6	156911	156916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022443	ATG	2	6	156921	156926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022443	TAT	2	6	156939	156944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022443	GA	3	6	156960	156965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022443	AATA	2	8	158458	158465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022443	GTT	2	6	158523	158528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022443	ATA	2	6	158593	158598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022443	CTG	2	6	158633	158638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_022443	GTT	2	6	158683	158688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022443	ATTA	2	8	158690	158697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022443	GTTT	2	8	158738	158745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022443	T	6	6	158779	158784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022443	T	6	6	158820	158825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022443	TAAC	2	8	158838	158845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_022443	AAT	2	6	158848	158853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022443	ATT	2	6	158861	158866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022443	GAA	2	6	158977	158982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022443	ATTAAT	2	12	159017	159028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022443	ATT	2	6	159046	159051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022443	ACG	2	6	159074	159079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_022443	ATTG	2	8	160086	160093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022443	CGTTT	2	10	160108	160117	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
587	NC_022443	TA	4	8	160339	160346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022443	TTTA	2	8	160349	160356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022443	AT	3	6	160392	160397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022443	A	7	7	160423	160429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022443	T	6	6	160471	160476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022443	AGG	2	6	160490	160495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022443	TTA	2	6	160498	160503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022443	ACA	2	6	161021	161026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_022443	TGA	2	6	161030	161035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022443	AT	3	6	161037	161042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022443	TA	3	6	161044	161049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022443	AGT	2	6	161106	161111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022443	CGT	2	6	161198	161203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_022443	ATC	2	6	161250	161255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_022443	TTA	2	6	161323	161328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022443	GAGT	2	8	162100	162107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022443	GA	3	6	163846	163851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022443	TCG	2	6	164916	164921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_022443	ACT	2	6	164925	164930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_022443	GTA	2	6	164946	164951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022443	T	7	7	164953	164959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022443	ATT	2	6	165035	165040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022443	ATC	2	6	165052	165057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_022443	AAT	2	6	165061	165066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022443	AT	3	6	165065	165070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022443	AG	3	6	165075	165080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022443	TAT	2	6	165114	165119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022443	ATT	2	6	165253	165258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022443	CCCCA	2	10	165294	165303	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
616	NC_022443	ACT	2	6	165363	165368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_022443	TA	3	6	165371	165376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022443	TAAAT	2	10	165381	165390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022443	AAG	2	6	165398	165403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022443	ATTT	2	8	166778	166785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022443	TTA	2	6	166845	166850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022443	GTT	2	6	166892	166897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022443	AAC	2	6	166932	166937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022443	ATGT	2	8	167009	167016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022443	GAT	2	6	167048	167053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022443	AT	3	6	167076	167081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022443	TTAA	2	8	167130	167137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022443	TATCA	2	10	167150	167159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
629	NC_022443	TAT	2	6	167185	167190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022443	T	6	6	175114	175119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022443	CAT	2	6	175151	175156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_022443	AAGT	2	8	175177	175184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022443	AAT	2	6	175226	175231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022443	ACG	2	6	175240	175245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_022443	ATCAT	2	10	175282	175291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
636	NC_022443	TAA	2	6	175298	175303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022443	ATCA	2	8	175316	175323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_022443	GAT	2	6	175336	175341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022443	CT	3	6	175878	175883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
640	NC_022443	T	6	6	175883	175888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022443	AAT	2	6	175915	175920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_022443	ACC	2	6	176916	176921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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923	NC_022443	ATA	2	6	272203	272208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
924	NC_022443	TTA	2	6	272225	272230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
925	NC_022443	A	7	7	272235	272241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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933	NC_022443	A	6	6	275665	275670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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941	NC_022443	TA	3	6	276655	276660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
942	NC_022443	A	6	6	276688	276693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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945	NC_022443	GAT	2	6	276761	276766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
946	NC_022443	A	6	6	276780	276785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
947	NC_022443	TCATA	2	10	276830	276839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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951	NC_022443	ATG	2	6	279301	279306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_022443	TA	3	6	280369	280374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
954	NC_022443	ATT	2	6	280379	280384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
955	NC_022443	TCA	2	6	280389	280394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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958	NC_022443	AT	3	6	280492	280497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
959	NC_022443	TGA	2	6	280556	280561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
960	NC_022443	ATT	2	6	280576	280581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
961	NC_022443	A	7	7	280607	280613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
962	NC_022443	A	6	6	280619	280624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
963	NC_022443	ATG	2	6	280634	280639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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966	NC_022443	AG	3	6	280693	280698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
967	NC_022443	AAT	3	9	281112	281120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
968	NC_022443	GAA	2	6	281131	281136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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