MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 12897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_022443	ACAA	2	8	1127029	1127036	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_022443	TGGGG	2	10	1127157	1127166	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_022443	AAT	2	6	1127201	1127206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_022443	T	6	6	1127294	1127299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_022443	ATA	2	6	1127340	1127345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_022443	AT	3	6	1127587	1127592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_022443	TGA	3	9	1127706	1127714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_022443	T	6	6	1127722	1127727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_022443	AAT	2	6	1127814	1127819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_022443	AAG	2	6	1127898	1127903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_022443	AT	4	8	1127908	1127915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_022443	ATG	2	6	1127918	1127923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_022443	AAG	2	6	1127924	1127929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_022443	CAT	2	6	1127945	1127950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_022443	TTG	2	6	1127951	1127956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_022443	TAA	2	6	1127958	1127963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_022443	TAAT	2	8	1127972	1127979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_022443	CATG	2	8	1127991	1127998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_022443	TA	4	8	1128000	1128007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_022443	CAC	2	6	1128040	1128045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_022443	CTT	2	6	1128067	1128072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5025	NC_022443	AAT	2	6	1128099	1128104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_022443	TA	4	8	1128144	1128151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_022443	CCT	2	6	1128428	1128433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5029	NC_022443	AT	3	6	1128606	1128611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_022443	TA	3	6	1128657	1128662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_022443	ACA	2	6	1128672	1128677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_022443	TTAAA	2	10	1128769	1128778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_022443	TTAA	2	8	1128790	1128797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_022443	CAT	2	6	1128829	1128834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5037	NC_022443	T	6	6	1129873	1129878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_022443	AAT	2	6	1129897	1129902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_022443	TGA	3	9	1129999	1130007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_022443	ATT	2	6	1130011	1130016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_022443	TTTA	2	8	1130037	1130044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_022443	TTTG	2	8	1130159	1130166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_022443	AATT	2	8	1130213	1130220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_022443	AATT	2	8	1130222	1130229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_022443	TAAA	2	8	1130236	1130243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_022443	TA	3	6	1130251	1130256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_022443	TAA	2	6	1130272	1130277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022443	ATTA	2	8	1130299	1130306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_022443	TCG	2	6	1130318	1130323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5051	NC_022443	TAAAA	2	10	1130412	1130421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_022443	TTAG	2	8	1130431	1130438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_022443	ATATT	2	10	1130949	1130958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5060	NC_022443	TGGGG	2	10	1131234	1131243	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_022443	AAT	2	6	1131334	1131339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5063	NC_022443	AT	3	6	1131419	1131424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_022443	TAT	2	6	1131438	1131443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_022443	TTA	2	6	1132341	1132346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_022443	ATT	2	6	1134236	1134241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5084	NC_022443	TAAAA	2	10	1134310	1134319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_022443	GTT	2	6	1134323	1134328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_022443	ATTTAT	2	12	1136398	1136409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_022443	TAT	2	6	1138029	1138034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_022443	TAATG	2	10	1138200	1138209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_022443	TATAT	2	10	1138222	1138231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_022443	AT	3	6	1138303	1138308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_022443	TAAAA	2	10	1138599	1138608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_022443	ATTA	2	8	1138615	1138622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_022443	TGC	2	6	1138650	1138655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_022443	TA	3	6	1138657	1138662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_022443	TAAA	2	8	1138668	1138675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_022443	TAC	2	6	1138720	1138725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5109	NC_022443	TAA	2	6	1139866	1139871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_022443	GT	3	6	1139877	1139882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_022443	GTAT	2	8	1139900	1139907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_022443	TATT	2	8	1140002	1140009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_022443	ATG	2	6	1140018	1140023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5115	NC_022443	AAT	2	6	1140247	1140252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_022443	AAT	2	6	1140263	1140268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_022443	T	6	6	1140299	1140304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_022443	TA	3	6	1140310	1140315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_022443	AAT	2	6	1140384	1140389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_022443	ATA	3	9	1140390	1140398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_022443	A	6	6	1140430	1140435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_022443	TTAA	2	8	1140499	1140506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_022443	TG	3	6	1140540	1140545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_022443	A	6	6	1140548	1140553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_022443	AAGC	2	8	1140567	1140574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_022443	CAT	2	6	1140627	1140632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_022443	CAAAA	2	10	1140650	1140659	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5128	NC_022443	GGGA	2	8	1140724	1140731	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_022443	CCGA	2	8	1140741	1140748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5131	NC_022443	ATT	2	6	1140810	1140815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_022443	TAAA	2	8	1140849	1140856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_022443	TAT	2	6	1140876	1140881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_022443	TGAT	2	8	1182064	1182071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5271	NC_022443	ATG	3	9	1182127	1182135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5277	NC_022443	TATC	2	8	1186118	1186125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5302	NC_022443	TAA	2	6	1196902	1196907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5303	NC_022443	TATAG	2	10	1196917	1196926	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5381	NC_022443	CAT	2	6	1223440	1223445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5389	NC_022443	ATTAG	2	10	1226125	1226134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5398	NC_022443	TTGA	2	8	1229857	1229864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_022443	TAAA	2	8	1229887	1229894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5403	NC_022443	TAAT	2	8	1229952	1229959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5441	NC_022443	A	6	6	1239706	1239711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5489	NC_022443	TGTA	2	8	1257628	1257635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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