MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 1163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022248	GAA	2	6	79739	79744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022248	GTG	2	6	79760	79765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022248	TGG	2	6	79880	79885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022248	AAC	2	6	79894	79899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022248	CG	3	6	79914	79919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_022248	A	7	7	79932	79938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022248	CGTT	2	8	80178	80185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_022248	GACC	2	8	80219	80226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_022248	GC	3	6	80243	80248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_022248	AACG	2	8	80312	80319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_022248	CTG	2	6	80326	80331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_022248	GGA	2	6	80346	80351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022248	AAG	2	6	80380	80385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022248	CAC	2	6	80403	80408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_022248	CG	3	6	80425	80430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_022248	TCA	2	6	80441	80446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_022248	GA	3	6	80470	80475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022248	GGA	2	6	80514	80519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022248	C	6	6	80527	80532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1020	NC_022248	CAG	2	6	80536	80541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_022248	GCA	2	6	80549	80554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_022248	GGCA	2	8	80594	80601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_022248	GCC	2	6	80623	80628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_022248	CTA	2	6	80709	80714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_022248	CAT	2	6	80766	80771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_022248	AGGC	2	8	80828	80835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_022248	ATTT	2	8	80879	80886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022248	GAGC	2	8	80910	80917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_022248	ACT	2	6	81015	81020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_022248	ATT	2	6	81156	81161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022248	TC	3	6	81172	81177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_022248	GC	3	6	81271	81276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_022248	TTC	2	6	81289	81294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_022248	AGG	2	6	81331	81336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022248	TCG	2	6	81395	81400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_022248	CAT	2	6	81429	81434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_022248	CTG	2	6	81576	81581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_022248	TTGA	2	8	81643	81650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_022248	TCA	2	6	81743	81748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_022248	GAA	2	6	81871	81876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022248	CTG	2	6	81877	81882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_022248	ATA	2	6	81899	81904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022248	CTT	2	6	82049	82054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_022248	GTCA	2	8	82060	82067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_022248	TCT	2	6	82114	82119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_022248	ATG	2	6	83347	83352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_022248	T	6	6	83353	83358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022248	AAAT	2	8	83391	83398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_022248	ATA	2	6	83400	83405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_022248	TTG	2	6	83475	83480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022248	CAG	2	6	83584	83589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_022248	GCAA	2	8	83623	83630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_022248	TGA	2	6	83633	83638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022248	A	6	6	83641	83646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022248	T	6	6	83702	83707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022248	TGA	2	6	83749	83754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022248	ACG	2	6	83782	83787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_022248	TTG	2	6	83908	83913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022248	AT	3	6	83978	83983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022248	GCC	2	6	84054	84059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_022248	A	6	6	84087	84092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022248	GCTG	2	8	84157	84164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_022248	GGCA	2	8	84188	84195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_022248	CAG	2	6	84203	84208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_022248	GAT	2	6	84243	84248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022248	GCC	2	6	84273	84278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_022248	TCA	2	6	84302	84307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_022248	TA	3	6	84396	84401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022248	GCAG	2	8	84404	84411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_022248	AAC	2	6	84541	84546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_022248	CTGA	2	8	84657	84664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_022248	GAC	2	6	84666	84671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_022248	TGG	2	6	84735	84740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022248	GCCA	3	12	84762	84773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_022248	GA	3	6	84882	84887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_022248	CCGG	2	8	84926	84933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_022248	CAG	2	6	84950	84955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_022248	GCCA	2	8	85170	85177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_022248	GA	3	6	85209	85214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022248	CCA	2	6	85218	85223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_022248	CCTG	2	8	85225	85232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_022248	CCA	2	6	85246	85251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_022248	CAC	2	6	85257	85262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_022248	ATG	2	6	85318	85323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_022248	TCA	2	6	85328	85333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_022248	CCAG	2	8	85722	85729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_022248	AG	3	6	85728	85733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_022248	TCA	2	6	85761	85766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_022248	ACC	2	6	85812	85817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_022248	CGG	2	6	85843	85848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_022248	CTGA	2	8	85880	85887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_022248	GCT	2	6	85931	85936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_022248	GC	3	6	86022	86027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_022248	TCTG	2	8	86168	86175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_022248	CAGC	2	8	86205	86212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_022248	CCG	2	6	86231	86236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_022248	GGCT	2	8	86275	86282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_022248	GCC	2	6	86304	86309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_022248	TCC	2	6	86327	86332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_022248	TCA	2	6	86345	86350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_022248	TTATA	2	10	87515	87524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022248	CAAA	2	8	87527	87534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_022248	ACTA	2	8	87546	87553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_022248	ACAA	2	8	87554	87561	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_022248	CCG	2	6	87608	87613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_022248	CGGG	2	8	87645	87652	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_022248	CAC	2	6	87656	87661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_022248	AGAC	2	8	87737	87744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_022248	GTC	2	6	87763	87768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_022248	CCA	2	6	87795	87800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_022248	CAC	2	6	87875	87880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_022248	CTT	3	9	87939	87947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_022248	TGA	2	6	87957	87962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022248	CAGG	2	8	88020	88027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_022248	ATT	2	6	88039	88044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022248	ATT	2	6	88102	88107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022248	GCA	2	6	88131	88136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_022248	GAA	2	6	88164	88169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022248	ACAG	2	8	88208	88215	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_022248	AAAT	2	8	88290	88297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022248	CCAGA	2	10	88421	88430	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1122	NC_022248	AC	3	6	88540	88545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_022248	C	6	6	88580	88585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1124	NC_022248	GCA	2	6	88850	88855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_022248	AGTCCG	2	12	89636	89647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022248	CATTA	2	10	89664	89673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1127	NC_022248	T	6	6	89709	89714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022248	GTT	2	6	89767	89772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022248	TCA	2	6	89798	89803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_022248	GCT	2	6	89907	89912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_022248	ATT	2	6	89922	89927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022248	CCGGA	2	10	89954	89963	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1133	NC_022248	GCT	3	9	89978	89986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_022248	GCA	2	6	90043	90048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_022248	AACAG	2	10	90107	90116	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1136	NC_022248	GGAA	2	8	90252	90259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022248	CTG	2	6	90274	90279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_022248	CGCC	2	8	90326	90333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1139	NC_022248	AGC	2	6	90382	90387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_022248	GCC	2	6	90447	90452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1141	NC_022248	ACG	2	6	90514	90519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_022248	TGC	2	6	90630	90635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_022248	AAAT	2	8	90654	90661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_022248	GCC	2	6	90665	90670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1145	NC_022248	GCT	2	6	90696	90701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1146	NC_022248	GATT	2	8	90731	90738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_022248	CGG	2	6	90830	90835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1148	NC_022248	GT	4	8	91005	91012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_022248	CTGCG	2	10	91031	91040	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1150	NC_022248	GCC	2	6	91094	91099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1151	NC_022248	GGCA	2	8	91197	91204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1152	NC_022248	GAC	2	6	91218	91223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_022248	AGG	2	6	91268	91273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_022248	GGA	2	6	91395	91400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1155	NC_022248	CTGG	2	8	91401	91408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1156	NC_022248	GGTG	2	8	91491	91498	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_022248	CTG	2	6	91570	91575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1158	NC_022248	ATGT	2	8	91597	91604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_022248	TTA	2	6	91632	91637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1160	NC_022248	TGA	2	6	91785	91790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_022248	CAG	2	6	91795	91800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1162	NC_022248	CGA	2	6	91890	91895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1163	NC_022248	CTGA	2	8	91954	91961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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