MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 1163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022248	CAT	2	6	40273	40278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022248	ATC	2	6	40280	40285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_022248	GCG	3	9	40388	40396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_022248	ACT	2	6	40402	40407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_022248	GC	3	6	40425	40430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_022248	TGG	2	6	40443	40448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022248	CTG	2	6	40543	40548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_022248	GCA	2	6	40607	40612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_022248	TGC	2	6	41262	41267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022248	AGG	2	6	47395	47400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022248	ATG	2	6	47404	47409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022248	ATC	2	6	47521	47526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_022248	AAC	2	6	47566	47571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_022248	AAC	2	6	47600	47605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_022248	GAA	2	6	50260	50265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022248	TAA	2	6	50304	50309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022248	AGG	2	6	50427	50432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022248	GACC	2	8	50440	50447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
519	NC_022248	T	9	9	50465	50473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022248	TTC	2	6	50502	50507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_022248	CCT	2	6	51146	51151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_022248	TA	3	6	51220	51225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022248	TTA	2	6	52002	52007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022248	TAA	2	6	52038	52043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022248	ACA	2	6	52065	52070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_022248	ATT	2	6	52095	52100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022248	TCC	2	6	52155	52160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_022248	TAA	2	6	52190	52195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022248	CCA	2	6	52199	52204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_022248	CAG	2	6	52205	52210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022248	GAT	2	6	52237	52242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022248	CCA	2	6	52271	52276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_022248	AAT	2	6	52293	52298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022248	TTC	2	6	52311	52316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_022248	AGC	2	6	52338	52343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_022248	AT	3	6	52394	52399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022248	T	7	7	52408	52414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022248	T	6	6	52433	52438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022248	TTC	2	6	52445	52450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_022248	AGC	2	6	52481	52486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_022248	TATT	2	8	52500	52507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022248	CTG	2	6	52556	52561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_022248	TCTTT	2	10	52570	52579	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
544	NC_022248	CTG	2	6	52602	52607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022248	CAT	2	6	52654	52659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_022248	GTT	2	6	52684	52689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022248	CCA	2	6	52690	52695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_022248	GAT	2	6	52711	52716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022248	CAC	3	9	52738	52746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_022248	CAC	2	6	52777	52782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_022248	CTG	2	6	52940	52945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_022248	GTG	2	6	53028	53033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022248	GGC	2	6	53066	53071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_022248	ATT	2	6	53099	53104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022248	CTG	2	6	53172	53177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_022248	GCT	2	6	53210	53215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_022248	ACT	2	6	53225	53230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_022248	CAT	3	9	53242	53250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_022248	CCCT	2	8	53269	53276	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
560	NC_022248	TCC	2	6	53285	53290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_022248	CAC	3	9	53293	53301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_022248	CTG	2	6	53359	53364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022248	CTGCG	2	10	53443	53452	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
564	NC_022248	CAT	2	6	53465	53470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_022248	CAC	2	6	53500	53505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_022248	GCT	2	6	53519	53524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_022248	ACTG	2	8	53542	53549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_022248	CTG	3	9	53574	53582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_022248	CTGC	2	8	53602	53609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_022248	CTG	2	6	53633	53638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_022248	GCC	2	6	53640	53645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_022248	AAT	2	6	53842	53847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022248	CCA	2	6	53854	53859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_022248	CGG	2	6	53863	53868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022248	CAT	2	6	53948	53953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_022248	AG	3	6	53978	53983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022248	GA	3	6	54028	54033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022248	CAC	2	6	54044	54049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_022248	ATAC	2	8	54139	54146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_022248	TTA	2	6	54171	54176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022248	CCAGCA	2	12	54187	54198	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
582	NC_022248	CAG	2	6	54224	54229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_022248	GTT	2	6	54292	54297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022248	TGG	2	6	54313	54318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022248	CTT	2	6	54373	54378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_022248	CTGG	2	8	54413	54420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_022248	CTGG	2	8	54425	54432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
588	NC_022248	TAACTG	2	12	54444	54455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
589	NC_022248	CTG	2	6	54509	54514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_022248	ATA	2	6	54518	54523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022248	CCT	2	6	54537	54542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_022248	ATT	2	6	54608	54613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022248	C	6	6	54625	54630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
594	NC_022248	A	6	6	54649	54654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022248	TTC	2	6	54686	54691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_022248	CA	3	6	54728	54733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_022248	ATC	2	6	54867	54872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_022248	CCA	2	6	54883	54888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_022248	GTC	2	6	54906	54911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_022248	CCCAG	2	10	55042	55051	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
601	NC_022248	TTA	2	6	55176	55181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022248	CCG	2	6	55194	55199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_022248	GTT	2	6	55246	55251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022248	GCT	2	6	55281	55286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_022248	CAG	2	6	55318	55323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_022248	CTG	2	6	55330	55335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_022248	TCAT	2	8	55379	55386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_022248	CCA	2	6	55434	55439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_022248	CTG	2	6	55450	55455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_022248	GCA	2	6	55476	55481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_022248	TGG	2	6	55575	55580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022248	TTA	2	6	55604	55609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022248	CAG	2	6	55651	55656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_022248	CCA	2	6	55713	55718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_022248	ATA	2	6	55787	55792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022248	CGGT	2	8	55796	55803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_022248	GGCA	2	8	55810	55817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_022248	TCA	2	6	55866	55871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_022248	TTG	2	6	55889	55894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022248	ATG	2	6	55931	55936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022248	GCCC	2	8	56001	56008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
622	NC_022248	CGC	2	6	56029	56034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_022248	CTG	2	6	56083	56088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022248	C	6	6	56113	56118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
625	NC_022248	GCC	2	6	56132	56137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_022248	CGT	2	6	56218	56223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_022248	A	6	6	56239	56244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022248	GCG	2	6	56252	56257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_022248	GCT	2	6	56289	56294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022248	T	6	6	56387	56392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022248	GCC	2	6	56416	56421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_022248	GCC	2	6	56435	56440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_022248	TG	3	6	56462	56467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022248	GAA	2	6	56494	56499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022248	CGG	2	6	56532	56537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_022248	TCA	2	6	56547	56552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_022248	ATA	2	6	56562	56567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022248	ATCC	2	8	56630	56637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_022248	CGG	2	6	56650	56655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_022248	GT	3	6	56692	56697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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