MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus intermedius B196

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022246	ATTGA	2	10	3695	3704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022246	ATACT	2	10	14995	15004	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022246	TCTAT	2	10	15672	15681	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022246	AACAG	2	10	15771	15780	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022246	TCGTG	2	10	20771	20780	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022246	GGGAG	2	10	22034	22043	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022246	AGGGA	2	10	24243	24252	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022246	TTTAA	2	10	46818	46827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022246	TGAAA	2	10	50325	50334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022246	AGGAA	2	10	56346	56355	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022246	CTTTT	2	10	57791	57800	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022246	CTTTT	2	10	69580	69589	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022246	AAAAT	2	10	78150	78159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022246	TTATA	2	10	89092	89101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022246	CTTTT	2	10	106482	106491	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022246	TATAA	2	10	107364	107373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022246	ATTGT	2	10	114046	114055	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022246	AAAGC	2	10	127484	127493	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022246	AGGAA	2	10	127734	127743	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022246	TGATA	2	10	129794	129803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022246	GGGGC	2	10	130721	130730	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022246	TAAAA	2	10	140670	140679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022246	TTTTA	2	10	140708	140717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022246	TAAAA	2	10	146778	146787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022246	AGATA	2	10	148337	148346	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022246	GGAAA	2	10	153255	153264	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022246	TTGAA	2	10	163859	163868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022246	GAATA	2	10	164872	164881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022246	CCAGT	2	10	184162	184171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_022246	TAAAA	2	10	187190	187199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022246	AAGGA	2	10	191863	191872	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022246	AATAA	2	10	196717	196726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022246	AGAGA	2	10	202553	202562	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022246	GTTTT	2	10	204803	204812	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022246	GGATA	2	10	207127	207136	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022246	TGATA	2	10	212267	212276	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022246	ATAGT	2	10	215974	215983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022246	TCTTT	2	10	223145	223154	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022246	TATTC	2	10	232678	232687	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022246	CTTTT	2	10	234012	234021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022246	AAAGA	2	10	242322	242331	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022246	AAAAC	2	10	245458	245467	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022246	ATCCT	2	10	251139	251148	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_022246	CCCTG	2	10	257753	257762	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_022246	AATGA	2	10	271489	271498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022246	TATAA	2	10	274993	275002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022246	AAAAT	2	10	291525	291534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022246	GATAA	2	10	291866	291875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022246	TCTAT	2	10	294547	294556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022246	TTTTG	2	10	297692	297701	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022246	GTTTA	2	10	301459	301468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022246	ATAAA	2	10	309090	309099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022246	TCGTG	2	10	312427	312436	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022246	GGGAG	2	10	313690	313699	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022246	TATGA	2	10	314677	314686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022246	AGGGA	2	10	315899	315908	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022246	ATTTG	2	10	317403	317412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022246	ATGAA	2	10	317415	317424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022246	TCTTT	2	10	317584	317593	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022246	TGATA	2	10	318130	318139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022246	TTATG	2	10	318169	318178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022246	ATTGT	2	10	329319	329328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022246	AGTAA	2	10	330727	330736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022246	ATAAA	2	10	331406	331415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022246	AAACA	2	10	342894	342903	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022246	TAACA	2	10	342904	342913	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022246	ATAAA	2	10	343078	343087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022246	TTGAT	2	10	351051	351060	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022246	TATCC	2	10	365959	365968	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_022246	CAGGG	2	10	366845	366854	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022246	TATTT	2	10	368782	368791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022246	TTTGT	2	10	404140	404149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022246	TAAGA	2	10	409628	409637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022246	AAGTG	2	10	419164	419173	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022246	TTTTA	2	10	420281	420290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022246	AATAA	2	10	424870	424879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022246	TAGAG	2	10	425954	425963	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022246	TTTTA	2	10	432900	432909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022246	AGGAA	2	10	433793	433802	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022246	TTGTT	2	10	453885	453894	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022246	CCTAT	2	10	454571	454580	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_022246	CTATA	2	10	455176	455185	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022246	TTTTG	2	10	457543	457552	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022246	ACTAA	2	10	475698	475707	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022246	ATAAA	2	10	480162	480171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022246	GTTTG	2	10	489566	489575	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022246	CTTGG	2	10	489588	489597	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022246	ATTTT	2	10	489722	489731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022246	TGGTA	2	10	498583	498592	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022246	ATTTT	2	10	498744	498753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022246	ATTAT	2	10	503075	503084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022246	AGTAT	2	10	520257	520266	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022246	ATAGA	2	10	522326	522335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022246	AAAGA	2	10	537870	537879	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022246	AGGAG	2	10	538004	538013	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022246	TGAGA	2	10	557304	557313	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022246	AGTAT	2	10	558250	558259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022246	TAAAA	2	10	562400	562409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022246	CTTTT	2	10	567728	567737	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022246	TTTAT	2	10	567773	567782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022246	TTTTA	2	10	571202	571211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022246	ATTAA	2	10	572474	572483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022246	TCATT	2	10	572934	572943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_022246	TTCTT	2	10	573602	573611	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022246	CTTTT	2	10	579811	579820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022246	CAAGA	2	10	586198	586207	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022246	ATATA	2	10	586812	586821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022246	ATTGA	2	10	595237	595246	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022246	TAAAA	2	10	609447	609456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022246	AAAAT	2	10	624703	624712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022246	AGTTG	2	10	633383	633392	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022246	GTTCT	2	10	639902	639911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022246	TATGT	2	10	647732	647741	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022246	AAAAG	2	10	647982	647991	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022246	TCACA	2	10	651791	651800	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_022246	ATCAC	2	10	655493	655502	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_022246	ATAAA	2	10	655550	655559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022246	AATTA	2	10	664508	664517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022246	GTGCT	2	10	686064	686073	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022246	AGGCG	2	10	686140	686149	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022246	TACAA	2	10	687166	687175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022246	AATTA	2	10	694612	694621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022246	TGAAA	2	10	705906	705915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022246	ATAAC	2	10	708025	708034	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022246	AAAAC	2	10	714062	714071	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022246	AGCAC	2	10	714108	714117	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022246	AATTT	2	10	719898	719907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022246	AAGAA	2	10	720651	720660	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022246	TGATA	2	10	730258	730267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022246	GGAGC	2	10	731089	731098	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022246	TGATA	2	10	753858	753867	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022246	AGTAT	2	10	755623	755632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022246	TGTTT	2	10	757999	758008	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022246	CAAAA	2	10	769772	769781	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022246	TAAAG	2	10	772786	772795	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022246	GGATT	2	10	773605	773614	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022246	GAATG	2	10	784236	784245	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022246	GCCAA	2	10	784270	784279	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_022246	TAGCA	2	10	790554	790563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022246	ATAAA	2	10	797744	797753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022246	ACTAT	2	10	799410	799419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022246	AATAC	2	10	804939	804948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022246	GGAAA	2	10	809255	809264	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022246	GTATT	2	10	823776	823785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022246	TTTTA	2	10	830950	830959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022246	AAATA	2	10	832269	832278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022246	ATAAA	2	10	836660	836669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022246	GACTG	2	10	843896	843905	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_022246	TTATT	2	10	847746	847755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022246	ATTAA	2	10	871039	871048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022246	ATGAA	2	10	871063	871072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022246	ATAAG	2	10	875148	875157	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022246	ATCAA	2	10	875832	875841	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_022246	TTTAT	2	10	892161	892170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022246	ATTTT	2	10	918558	918567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022246	TAAAA	2	10	919669	919678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022246	GAAAT	2	10	921179	921188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022246	TTTCT	2	10	925621	925630	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_022246	CTTCT	2	10	929226	929235	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_022246	ATTAT	2	10	932305	932314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022246	CTTTA	2	10	950245	950254	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_022246	AGTTA	2	10	955758	955767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_022246	TCTTG	2	10	958873	958882	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_022246	TTTTA	2	10	962549	962558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022246	TATCA	2	10	976658	976667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_022246	TATAC	2	10	980862	980871	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_022246	TTATT	2	10	984331	984340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022246	CTATG	2	10	984388	984397	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_022246	ATTTT	2	10	994021	994030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022246	CTTTC	2	10	1026417	1026426	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
173	NC_022246	TCTGC	2	10	1034620	1034629	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
174	NC_022246	CTTTT	2	10	1050717	1050726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_022246	TCGTT	2	10	1125142	1125151	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_022246	TAAAA	2	10	1132837	1132846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022246	TTGAT	2	10	1187576	1187585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_022246	ACAAG	2	10	1236713	1236722	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_022246	CATAA	2	10	1251130	1251139	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_022246	AGAAT	2	10	1256765	1256774	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_022246	TTTTA	2	10	1851144	1851153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_022246	ATTTT	2	10	1875490	1875499	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_022246	TTTTA	2	10	1886687	1886696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_022246	ACAAA	2	10	1886768	1886777	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_022246	GCTAT	2	10	1894754	1894763	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
294	NC_022246	TAAAA	2	10	1903573	1903582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_022246	TTGAT	2	10	1908358	1908367	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_022246	AATTA	2	10	1908580	1908589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_022246	ACTTT	2	10	1920804	1920813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_022246	AGCAA	2	10	1929566	1929575	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
299	NC_022246	ATAGT	2	10	1934862	1934871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
300	NC_022246	ACACC	2	10	1934904	1934913	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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302	NC_022246	ACTAT	2	10	1946224	1946233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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304	NC_022246	CAGTA	2	10	1951728	1951737	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
305	NC_022246	CATTA	2	10	1960378	1960387	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
306	NC_022246	GTGCT	2	10	1967947	1967956	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
307	NC_022246	GATAG	2	10	1970671	1970680	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
308	NC_022246	TAATT	2	10	1978885	1978894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_022246	TTTTA	2	10	1994000	1994009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.