MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus constellatus subsp. pharyngis C818

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022245	ACTAAT	2	12	21387	21398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022245	GGTAAA	2	12	39242	39253	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022245	TCACTG	2	12	93688	93699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022245	TAGTGT	2	12	101081	101092	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022245	TTAAAA	2	12	122963	122974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022245	TTGAGA	2	12	146140	146151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022245	TATGAA	2	12	146937	146948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022245	TATCTA	2	12	197604	197615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022245	AGTAAG	2	12	207745	207756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022245	GAATGG	2	12	222604	222615	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022245	TATAAA	2	12	237064	237075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022245	GCAGGG	2	12	241905	241916	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022245	GTTTCA	2	12	271239	271250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022245	ACTAAT	2	12	285057	285068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022245	TGAAAA	2	12	303846	303857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022245	TTTATC	2	12	323625	323636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022245	AATTTG	2	12	324643	324654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022245	ACCTAT	2	12	343277	343288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022245	AAAAGC	2	12	344236	344247	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022245	ATGAGA	2	12	345287	345298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022245	CGAAAT	2	12	351527	351538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022245	TTTGTT	2	12	365682	365693	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022245	TTTTTA	2	12	379872	379883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022245	TCAATA	2	12	399838	399849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022245	GTTTAG	2	12	406911	406922	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022245	ATTGCT	2	12	412599	412610	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022245	ATGAGG	2	12	420737	420748	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022245	CTTGAA	2	12	428469	428480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022245	TCTTTC	2	12	431961	431972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022245	TGAAAA	2	12	432063	432074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022245	ATTTTT	2	12	459295	459306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022245	TCTTAT	2	12	465293	465304	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022245	ATGGTT	2	12	483603	483614	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022245	GTATAT	2	12	489820	489831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022245	AGTCTT	2	12	495797	495808	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022245	AAAGGG	2	12	504998	505009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022245	TTTCTT	2	12	513451	513462	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022245	GGGCAT	2	12	513472	513483	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022245	AGAAAA	2	12	514539	514550	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022245	CTTTTC	2	12	529764	529775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022245	TGAAAA	2	12	541646	541657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022245	TATTCT	2	12	559555	559566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022245	TAAAAC	2	12	568094	568105	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022245	AAGATA	2	12	606235	606246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022245	TTTATA	2	12	621670	621681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022245	TTGGCT	2	12	667805	667816	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022245	AATGCC	2	12	671057	671068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022245	TTAAGT	2	12	682002	682013	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022245	TTTTGA	2	12	708683	708694	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022245	AAAAAG	2	12	708720	708731	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022245	AGCTAT	2	12	730879	730890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022245	GTCGTG	2	12	745395	745406	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022245	CCTTCT	2	12	759527	759538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022245	TGCTAT	2	12	774984	774995	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022245	GAGAAG	2	12	791974	791985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022245	TAAAAA	2	12	803568	803579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022245	TAAAAA	2	12	825214	825225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022245	TTTAAT	2	12	841576	841587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022245	AAATTA	2	12	851169	851180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022245	TTTATC	2	12	897343	897354	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022245	CTTAAT	2	12	900590	900601	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022245	TAAAAA	2	12	911080	911091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022245	CCCGAA	2	12	912781	912792	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022245	TAAAAA	2	12	923228	923239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022245	ACTAAG	2	12	923456	923467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022245	TCTCAA	2	12	943874	943885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022245	TTCAAA	2	12	967262	967273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022245	ATTTTC	2	12	971272	971283	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022245	TAGACA	2	12	997213	997224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022245	AGTTCC	2	12	1003891	1003902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022245	TAGCAA	2	12	1024149	1024160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022245	ACTCGC	2	12	1064206	1064217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022245	CTGCAT	2	12	1064794	1064805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022245	AAAAAG	2	12	1088142	1088153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022245	CAAGAA	2	12	1117454	1117465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022245	AAAAGA	2	12	1146043	1146054	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022245	TATAAC	2	12	1157885	1157896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022245	CAATCA	2	12	1175010	1175021	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022245	TCTTAT	2	12	1199123	1199134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022245	TCTTTT	2	12	1210173	1210184	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022245	TTCAAC	2	12	1215002	1215013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022245	TATCAT	2	12	1233312	1233323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022245	ACCTTT	2	12	1234023	1234034	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022245	TAAAAA	2	12	1239045	1239056	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022245	ATATCT	2	12	1251177	1251188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022245	AAAGAA	2	12	1251240	1251251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022245	TCGGAT	2	12	1251549	1251560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022245	ACTTTC	2	12	1252073	1252084	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022245	TTTTAT	2	12	1274875	1274886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022245	CATTAT	2	12	1295936	1295947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022245	CAAATT	2	12	1342824	1342835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022245	ACTTTT	2	12	1364739	1364750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022245	TTTTTA	2	12	1420602	1420613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022245	TTAACC	2	12	1441689	1441700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022245	TATTAG	2	12	1523058	1523069	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022245	TCTAAA	2	12	1539043	1539054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022245	ATTTCA	2	12	1565624	1565635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022245	AAGCCA	2	12	1566838	1566849	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022245	CAAAAC	2	12	1567246	1567257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022245	CTTTTT	2	12	1570684	1570695	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022245	AAATTT	2	12	1578492	1578503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022245	CAAAAA	2	12	1597531	1597542	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022245	ATTCAG	2	12	1613274	1613285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022245	CATCTA	2	12	1651506	1651517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022245	AGAAAA	2	12	1651603	1651614	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022245	AAAAAT	2	12	1707369	1707380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022245	TAAGAA	2	12	1721526	1721537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022245	ATTTAT	2	12	1725838	1725849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022245	TAAAAA	2	12	1725998	1726009	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022245	TACTTT	2	12	1757758	1757769	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022245	CCCGAA	2	12	1769528	1769539	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022245	TATTAG	2	12	1770702	1770713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022245	CTTCAA	2	12	1779068	1779079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022245	CCAAGT	2	12	1782118	1782129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022245	TAATTT	2	12	1782185	1782196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022245	CATAGC	2	12	1797138	1797149	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022245	TTGCTC	2	12	1807390	1807401	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022245	TCAATC	2	12	1810879	1810890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022245	CTTTTT	2	12	1811871	1811882	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022245	TATCAT	2	12	1812091	1812102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022245	ACCTTT	2	12	1812802	1812813	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022245	CTCTTC	2	12	1891499	1891510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022245	CTGCTT	2	12	1891591	1891602	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022245	AAATAT	2	12	1893764	1893775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022245	AATTTT	2	12	1898230	1898241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.