MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 13443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022241	TACAGA	2	12	1271368	1271379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3502	NC_022241	TCA	2	6	1271397	1271402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_022241	T	8	8	1271552	1271559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_022241	AAT	2	6	1271600	1271605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_022241	TCA	2	6	1271849	1271854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_022241	GC	3	6	1271912	1271917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_022241	CAA	2	6	1271939	1271944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_022241	AATA	2	8	1272008	1272015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_022241	T	6	6	1272946	1272951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_022241	ATAG	2	8	1272959	1272966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_022241	TAA	2	6	1273000	1273005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_022241	TGA	2	6	1273100	1273105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_022241	TAA	2	6	1273184	1273189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_022241	ACA	2	6	1273190	1273195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_022241	TTG	2	6	1273242	1273247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_022241	CAA	3	9	1273317	1273325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_022241	AGG	2	6	1273410	1273415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_022241	TA	3	6	1273706	1273711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_022241	GCC	2	6	1273729	1273734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_022241	GTAAA	2	10	1273760	1273769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_022241	TGT	2	6	1273802	1273807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_022241	CT	3	6	1273829	1273834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_022241	ATT	2	6	1274376	1274381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_022241	AAAT	2	8	1274389	1274396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_022241	GC	3	6	1274500	1274505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_022241	AGCC	2	8	1274506	1274513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_022241	TA	3	6	1274531	1274536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_022241	TTC	2	6	1274592	1274597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_022241	G	6	6	1274617	1274622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_022241	AT	3	6	1274629	1274634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_022241	AAAT	2	8	1274664	1274671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_022241	TGA	2	6	1274935	1274940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_022241	ACAA	2	8	1274995	1275002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_022241	AAT	2	6	1275047	1275052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_022241	TGA	2	6	1275065	1275070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_022241	AGT	2	6	1275096	1275101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_022241	CAT	2	6	1275109	1275114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_022241	ATAA	2	8	1275120	1275127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_022241	CCT	2	6	1275398	1275403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_022241	TA	4	8	1275406	1275413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_022241	T	6	6	1275459	1275464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_022241	TAA	3	9	1275489	1275497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_022241	T	6	6	1275520	1275525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_022241	GTTA	2	8	1275546	1275553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_022241	T	7	7	1275557	1275563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_022241	TC	3	6	1275575	1275580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_022241	ATTCT	2	10	1275619	1275628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3548	NC_022241	TATAA	2	10	1275629	1275638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_022241	TGT	2	6	1275646	1275651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_022241	GATA	2	8	1275656	1275663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_022241	CAT	2	6	1275705	1275710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_022241	T	6	6	1275875	1275880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_022241	TTG	2	6	1275895	1275900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_022241	TTG	2	6	1275911	1275916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_022241	AT	4	8	1275953	1275960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_022241	GTA	2	6	1276045	1276050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_022241	ATT	2	6	1276096	1276101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_022241	AC	3	6	1276167	1276172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_022241	ATA	2	6	1276178	1276183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_022241	AGT	2	6	1276184	1276189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_022241	GTT	2	6	1276198	1276203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_022241	CTT	2	6	1276818	1276823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_022241	CCTG	2	8	1276839	1276846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_022241	TC	3	6	1276852	1276857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_022241	CT	3	6	1276867	1276872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_022241	CT	3	6	1276881	1276886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_022241	AGGT	2	8	1276966	1276973	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_022241	AGGA	2	8	1276981	1276988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_022241	TCA	2	6	1277060	1277065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3571	NC_022241	GTAT	2	8	1277128	1277135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_022241	T	6	6	1277154	1277159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_022241	GCC	2	6	1277180	1277185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3575	NC_022241	TTA	2	6	1277277	1277282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3578	NC_022241	TTA	2	6	1277379	1277384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_022241	A	6	6	1277406	1277411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_022241	TTA	2	6	1277434	1277439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_022241	T	6	6	1277570	1277575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_022241	TAA	2	6	1277813	1277818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_022241	CAA	2	6	1277838	1277843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_022241	ACGTT	2	10	1277950	1277959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3586	NC_022241	TGA	2	6	1277985	1277990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_022241	GTA	2	6	1278434	1278439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_022241	TAT	2	6	1278476	1278481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_022241	TGA	2	6	1278505	1278510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_022241	GAA	2	6	1278608	1278613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3593	NC_022241	TAT	2	6	1278686	1278691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_022241	TAA	2	6	1278817	1278822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_022241	AGC	2	6	1278910	1278915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_022241	TCATT	2	10	1278943	1278952	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3598	NC_022241	ACA	2	6	1278965	1278970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_022241	TCC	2	6	1279168	1279173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_022241	GCC	2	6	1279180	1279185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_022241	GGC	2	6	1279190	1279195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_022241	A	7	7	1279372	1279378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_022241	AGG	2	6	1279472	1279477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_022241	TAT	2	6	1280058	1280063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_022241	TCG	2	6	1280079	1280084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3609	NC_022241	AAT	3	9	1281364	1281372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_022241	CT	3	6	1281388	1281393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_022241	AAC	2	6	1281964	1281969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_022241	ACAG	2	8	1282031	1282038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_022241	CGG	2	6	1282070	1282075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_022241	AT	3	6	1282561	1282566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_022241	A	7	7	1282625	1282631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3622	NC_022241	ATG	2	6	1282992	1282997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_022241	TTCTG	2	10	1283019	1283028	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3624	NC_022241	T	6	6	1283035	1283040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_022241	AGG	2	6	1283072	1283077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_022241	TACA	2	8	1283475	1283482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_022241	GCG	2	6	1283488	1283493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_022241	GCG	2	6	1283498	1283503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_022241	CTC	2	6	1289258	1289263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_022241	TAA	2	6	1289265	1289270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_022241	A	6	6	1289707	1289712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_022241	AAAT	2	8	1289747	1289754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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