MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 13443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022241	AAC	2	6	194113	194118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022241	CTG	2	6	194128	194133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_022241	CGT	2	6	194186	194191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_022241	ATG	2	6	194211	194216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022241	TCA	2	6	194254	194259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_022241	CGG	2	6	194321	194326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_022241	CAG	2	6	194339	194344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_022241	G	6	6	194425	194430	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022241	GAC	2	6	194444	194449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022241	ATT	2	6	194484	194489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022241	GCGCA	2	10	194496	194505	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
512	NC_022241	CAG	2	6	194522	194527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_022241	GC	3	6	194536	194541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_022241	ATG	2	6	194578	194583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022241	GCC	2	6	194603	194608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_022241	GC	3	6	194633	194638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_022241	GTG	2	6	194691	194696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022241	A	7	7	196404	196410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022241	CAT	2	6	196419	196424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_022241	ATT	2	6	196453	196458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022241	GGA	2	6	196475	196480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022241	CGA	2	6	196881	196886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022241	TAT	2	6	196891	196896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022241	TATTG	2	10	196924	196933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022241	GCC	2	6	198674	198679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_022241	T	6	6	201135	201140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022241	TG	3	6	201168	201173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022241	TCA	2	6	201178	201183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_022241	GAAT	2	8	201212	201219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022241	GCG	2	6	201256	201261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022241	TTA	2	6	201262	201267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022241	ATT	2	6	202629	202634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022241	AT	3	6	202641	202646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022241	AAGT	2	8	202663	202670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022241	GCTTC	2	10	204397	204406	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
536	NC_022241	G	6	6	204454	204459	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022241	TGA	2	6	208831	208836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022241	CCA	2	6	208869	208874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_022241	GAT	2	6	209522	209527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022241	GAA	2	6	209539	209544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022241	AT	4	8	209578	209585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022241	ATT	2	6	209593	209598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022241	GTTT	2	8	209608	209615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022241	CAT	2	6	209751	209756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022241	GGA	2	6	209775	209780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022241	GAC	2	6	210239	210244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_022241	T	6	6	210266	210271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022241	CTT	2	6	211908	211913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_022241	GCA	2	6	212824	212829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022241	CAA	2	6	212854	212859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_022241	TGA	2	6	212876	212881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022241	GCGCT	2	10	212894	212903	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
553	NC_022241	CGCGT	2	10	212946	212955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
554	NC_022241	G	6	6	213826	213831	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022241	CTC	2	6	215715	215720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_022241	TAA	2	6	215791	215796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022241	AG	3	6	215841	215846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022241	CAT	2	6	215868	215873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_022241	CGC	2	6	215877	215882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_022241	AACG	2	8	216881	216888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_022241	ACGC	2	8	217482	217489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_022241	TAA	2	6	217502	217507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022241	GA	3	6	221341	221346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022241	TCT	3	9	221349	221357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_022241	GTC	2	6	221358	221363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_022241	GAA	2	6	221369	221374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022241	TGA	2	6	230495	230500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022241	AAT	2	6	230523	230528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022241	TAA	3	9	230617	230625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022241	ATA	2	6	230646	230651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022241	ATT	2	6	230656	230661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022241	T	7	7	230660	230666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022241	TAA	2	6	230674	230679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022241	A	6	6	230678	230683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022241	AAAT	2	8	230695	230702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022241	A	7	7	230721	230727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022241	T	6	6	230740	230745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022241	T	8	8	230747	230754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022241	AAAT	2	8	230772	230779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022241	TA	3	6	230795	230800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022241	T	7	7	230822	230828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022241	T	7	7	230851	230857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022241	CTTG	2	8	230869	230876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
584	NC_022241	TTTG	2	8	230878	230885	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022241	T	6	6	230886	230891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022241	TAT	2	6	230908	230913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022241	TAAA	2	8	230932	230939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022241	A	6	6	230937	230942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022241	TTAT	2	8	230994	231001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022241	GTT	2	6	231008	231013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022241	CTT	2	6	231016	231021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_022241	ATATA	2	10	231055	231064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022241	CTA	2	6	231068	231073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_022241	TG	3	6	231103	231108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022241	TAA	2	6	231136	231141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022241	ATC	2	6	231719	231724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_022241	A	7	7	231759	231765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022241	TA	3	6	231771	231776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022241	A	8	8	237644	237651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022241	GGC	2	6	237659	237664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_022241	GTT	2	6	237684	237689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022241	AG	3	6	239039	239044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022241	TCT	2	6	239148	239153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_022241	G	17	17	246442	246458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022241	C	6	6	246477	246482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
606	NC_022241	TGCTC	2	10	246555	246564	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
607	NC_022241	AGG	2	6	246567	246572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022241	CGG	2	6	247739	247744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_022241	CGCTT	2	10	247745	247754	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
610	NC_022241	AT	3	6	247770	247775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022241	AC	3	6	247815	247820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_022241	TCA	2	6	248222	248227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_022241	AAT	2	6	248242	248247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022241	CCA	2	6	248269	248274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_022241	A	7	7	248283	248289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022241	AGA	2	6	248304	248309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022241	GCG	2	6	248337	248342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_022241	G	7	7	249765	249771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022241	ATAA	2	8	250637	250644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022241	GC	3	6	252069	252074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_022241	GGC	2	6	252107	252112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_022241	CGT	2	6	252135	252140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_022241	CAT	2	6	252174	252179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022241	GTC	2	6	252225	252230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_022241	AGC	2	6	252331	252336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_022241	AGT	2	6	252374	252379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022241	TCA	2	6	252383	252388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_022241	CGC	2	6	252413	252418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_022241	CAG	2	6	252459	252464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022241	ACC	2	6	252484	252489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_022241	CG	3	6	252543	252548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_022241	CCA	2	6	252575	252580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_022241	CGAG	2	8	252587	252594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_022241	GCC	2	6	252648	252653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_022241	GCT	2	6	252657	252662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_022241	TGG	2	6	252706	252711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022241	GGC	2	6	252735	252740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_022241	CAG	2	6	252819	252824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_022241	TTG	2	6	252842	252847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022241	CAGA	2	8	252860	252867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
641	NC_022241	CAG	2	6	252873	252878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_022241	CGTA	2	8	252891	252898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
643	NC_022241	ATA	2	6	252929	252934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_022241	CAG	2	6	252939	252944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_022241	TCA	2	6	252967	252972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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648	NC_022241	CCAG	2	8	253181	253188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
649	NC_022241	GC	3	6	253237	253242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
650	NC_022241	AGGG	2	8	253272	253279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
651	NC_022241	CT	3	6	253465	253470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
652	NC_022241	GCC	2	6	253472	253477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
653	NC_022241	GAT	2	6	254375	254380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_022241	AAC	2	6	254701	254706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_022241	AC	4	8	254705	254712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
664	NC_022241	GGC	2	6	255572	255577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_022241	GTCTG	2	10	257617	257626	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
673	NC_022241	GTG	2	6	258265	258270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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766	NC_022241	T	6	6	303914	303919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
767	NC_022241	TTATA	2	10	304011	304020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_022241	TTA	2	6	304374	304379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_022241	AAT	2	6	304398	304403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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779	NC_022241	GGA	2	6	304760	304765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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