MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus anginosus C238

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022239	ACTAAT	2	12	21867	21878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022239	TAAAGA	2	12	104018	104029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022239	TTTTAT	2	12	104130	104141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022239	GGGAAA	2	12	105314	105325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022239	GAGTTT	2	12	105449	105460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022239	TTTGAA	2	12	106160	106171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022239	ACTTAT	2	12	106604	106615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022239	GAATTT	2	12	106835	106846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022239	GAGTTT	2	12	107174	107185	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022239	AACCGT	2	12	107356	107367	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022239	GGTCAA	2	12	107378	107389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022239	TGAATT	2	12	107851	107862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022239	AACAAA	2	12	120291	120302	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022239	ACTAAT	2	12	125498	125509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022239	TTCGGG	2	12	126443	126454	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022239	TCCTTT	2	12	128257	128268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022239	TCCTGC	2	12	130110	130121	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022239	TTTCTG	2	12	136338	136349	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022239	TGACCT	2	12	138923	138934	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022239	TATATT	2	12	143199	143210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022239	TATCTA	2	12	152294	152305	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022239	CTTAAA	2	12	281819	281830	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022239	ACTAAT	2	12	286990	287001	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022239	TGAAAA	2	12	305843	305854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022239	AAGAAA	2	12	318811	318822	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022239	AATACG	2	12	329399	329410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022239	CACAAA	2	12	330277	330288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022239	CTTTTT	2	12	349133	349144	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022239	TGAAAA	2	12	351668	351679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022239	CTTGAA	2	12	352207	352218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022239	TTTGTT	2	12	366579	366590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022239	ATTTTT	2	12	381242	381253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022239	CTTTTA	2	12	401369	401380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022239	TCAATA	2	12	401546	401557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022239	GTTTTG	2	12	421344	421355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022239	TCTTTC	2	12	432770	432781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022239	TGAAAA	2	12	432872	432883	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022239	ATTTTT	2	12	454258	454269	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022239	TCTTAT	2	12	460283	460294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022239	TAGAAA	2	12	472155	472166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022239	TATAAG	2	12	479482	479493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022239	AGTCTT	2	12	493444	493455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022239	AAAGGG	2	12	502658	502669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022239	ACAGAT	2	12	505699	505710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022239	TAAAAA	2	12	524229	524240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022239	CTTTTC	2	12	531456	531467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022239	ATTTTT	2	12	547118	547129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022239	TATTCT	2	12	560648	560659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022239	TAAAAC	2	12	570584	570595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022239	TTATCC	2	12	575997	576008	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022239	AGCCTT	2	12	577768	577779	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022239	TTTTAA	2	12	701903	701914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022239	AACCAA	2	12	705373	705384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022239	TAAAAT	2	12	726965	726976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022239	ATTTTG	2	12	855714	855725	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022239	AAAAAG	2	12	855752	855763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022239	TGTTTT	2	12	903773	903784	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022239	CTAGCT	2	12	985772	985783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022239	TAAAAA	2	12	991285	991296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022239	AAATTA	2	12	1020422	1020433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022239	TCCATT	2	12	1026019	1026030	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022239	TGACAA	2	12	1037736	1037747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022239	CTTAAT	2	12	1075698	1075709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022239	TAAAAA	2	12	1086055	1086066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022239	CCCGAA	2	12	1087756	1087767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022239	ATCAAA	2	12	1097750	1097761	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022239	ATTAAA	2	12	1107457	1107468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022239	TCTCAA	2	12	1138884	1138895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022239	TAAAAT	2	12	1155180	1155191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022239	TAAAAG	2	12	1173400	1173411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022239	TACATT	2	12	1196970	1196981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022239	TCATTA	2	12	1218530	1218541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022239	CATTAG	2	12	1298851	1298862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022239	TGCATT	2	12	1313470	1313481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022239	ACTTTC	2	12	1316530	1316541	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022239	TTTCTT	2	12	1349337	1349348	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022239	TACTTA	2	12	1365559	1365570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022239	GTATCC	2	12	1375590	1375601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022239	CTTTCT	2	12	1390907	1390918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022239	CAAAAA	2	12	1400689	1400700	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022239	TCCATT	2	12	1418419	1418430	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022239	ATATTT	2	12	1429348	1429359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022239	CATACC	2	12	1436557	1436568	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022239	TGCTTC	2	12	1467214	1467225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022239	AGTTGT	2	12	1467520	1467531	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022239	TCCAAT	2	12	1483216	1483227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022239	CTCTTT	2	12	1495981	1495992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022239	TTTCTA	2	12	1505120	1505131	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022239	AAAATG	2	12	1543720	1543731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022239	TCTTTT	2	12	1558311	1558322	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022239	TCAAAA	2	12	1559485	1559496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022239	TCTTTT	2	12	1564844	1564855	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022239	CTTTAT	2	12	1584035	1584046	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022239	ATTTTT	2	12	1593509	1593520	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022239	CTTTTT	2	12	1602026	1602037	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022239	CAACGA	2	12	1634726	1634737	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022239	AGCCAT	2	12	1660821	1660832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022239	TTCCAT	2	12	1696939	1696950	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022239	AAATAG	2	12	1697038	1697049	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022239	TAAAAA	2	12	1698314	1698325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022239	TATCTA	2	12	1701345	1701356	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022239	TATTAG	2	12	1704279	1704290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022239	ACTATA	2	12	1713783	1713794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022239	GTAAAT	2	12	1718735	1718746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022239	ATATCA	2	12	1719899	1719910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022239	CTTTTT	2	12	1751052	1751063	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022239	ATTCAG	2	12	1792475	1792486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022239	AGCAGT	2	12	1814793	1814804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022239	ATTCTA	2	12	1815428	1815439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022239	TCAAAA	2	12	1833136	1833147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022239	CAACCT	2	12	1835237	1835248	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022239	ATTTCT	2	12	1852716	1852727	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022239	AATTTT	2	12	1868080	1868091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022239	AAAATG	2	12	1884476	1884487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022239	TCCTTC	2	12	1884994	1885005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022239	TTTTTG	2	12	1894708	1894719	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022239	GACCAC	2	12	1900862	1900873	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022239	GGGCAG	2	12	1902036	1902047	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022239	GCTGAG	2	12	1904617	1904628	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022239	TTCAAA	2	12	1928480	1928491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022239	TATTTG	2	12	1943308	1943319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022239	TATCAT	2	12	1952181	1952192	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022239	CATTAG	2	12	1987547	1987558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_022239	TGAAAG	2	12	2004596	2004607	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022239	AGGTTT	2	12	2037155	2037166	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022239	ACAATT	2	12	2048093	2048104	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022239	TTTTAA	2	12	2066462	2066473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022239	CCAAGT	2	12	2075544	2075555	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022239	TAATTT	2	12	2075611	2075622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022239	TAGCTA	2	12	2081867	2081878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_022239	CATAGC	2	12	2089249	2089260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022239	TTGCTC	2	12	2099502	2099513	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022239	TTTATA	2	12	2099610	2099621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022239	TCAATC	2	12	2102991	2103002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022239	TATCAT	2	12	2104203	2104214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_022239	CCACAT	2	12	2142559	2142570	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022239	TAAAGT	2	12	2168041	2168052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022239	CTTTTT	2	12	2187557	2187568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_022239	AAATAT	2	12	2189973	2189984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.