MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus anginosus C238

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022239	TCGTG	2	10	18004	18013	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022239	GAAGT	2	10	18763	18772	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022239	GGGAG	2	10	19516	19525	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022239	AGGGA	2	10	21726	21735	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022239	CTTTT	2	10	65882	65891	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022239	AAAAT	2	10	68925	68934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022239	TTATA	2	10	79869	79878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022239	AAGAG	2	10	84504	84513	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022239	CTAAA	2	10	100672	100681	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022239	GAAAA	2	10	104169	104178	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022239	GTCAA	2	10	104630	104639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022239	AGTTC	2	10	105181	105190	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022239	AGTTT	2	10	105816	105825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022239	GAAAA	2	10	108348	108357	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022239	AAACG	2	10	116277	116286	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022239	AAAGC	2	10	118828	118837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022239	AGGAA	2	10	119084	119093	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022239	TCGTG	2	10	121633	121642	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022239	GAAGT	2	10	122393	122402	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022239	GGGAG	2	10	123147	123156	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022239	AGGGA	2	10	125357	125366	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022239	TTCCT	2	10	129568	129577	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_022239	TGATG	2	10	129750	129759	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022239	TGCTT	3	15	129816	129830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022239	GTAAA	2	10	130440	130449	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022239	ATTCA	2	10	136471	136480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022239	CTATT	2	10	141027	141036	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022239	TCACT	2	10	142804	142813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_022239	TAATA	2	10	145055	145064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022239	ACTGT	2	10	150844	150853	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022239	TGGAA	2	10	150921	150930	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022239	TGATA	2	10	152275	152284	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022239	ATAGT	2	10	155982	155991	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022239	TATTC	2	10	173873	173882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022239	CTTTT	2	10	175208	175217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022239	TTGAT	2	10	179067	179076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022239	TTGAT	2	10	179499	179508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022239	CTTGC	2	10	180359	180368	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_022239	TGTTT	2	10	180636	180645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022239	TTGAT	2	10	192967	192976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022239	CATTT	2	10	198765	198774	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022239	TTTGG	2	10	199142	199151	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022239	GGTTT	2	10	199372	199381	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022239	ATAAA	2	10	202134	202143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022239	TAAAG	2	10	222697	222706	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022239	AGAAA	2	10	222713	222722	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022239	AAATA	2	10	226347	226356	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022239	ATATA	2	10	248977	248986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022239	AGCTC	2	10	253328	253337	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_022239	AAGGT	2	10	261913	261922	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022239	ATTTC	2	10	262168	262177	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022239	AATAA	2	10	262242	262251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022239	GAAAA	2	10	262284	262293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022239	TATAA	2	10	267433	267442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022239	AGGAG	2	10	267527	267536	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022239	TAAAA	2	10	279028	279037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022239	TCGTG	2	10	283127	283136	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022239	GAAGT	2	10	283886	283895	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022239	GGGAG	2	10	284639	284648	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022239	AGGGA	2	10	286849	286858	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022239	TAATT	2	10	289393	289402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022239	AATTT	2	10	290238	290247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022239	TTGAA	2	10	292217	292226	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022239	CTTTT	2	10	310411	310420	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022239	TATAA	2	10	313326	313335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022239	AAATA	2	10	318216	318225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022239	ATTTT	2	10	318245	318254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022239	ATTTT	2	10	323913	323922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022239	GTTTG	2	10	327328	327337	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022239	TTGGA	2	10	328527	328536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022239	ATTTG	2	10	330790	330799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022239	CTTTG	2	10	331996	332005	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022239	ATTTT	2	10	332161	332170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022239	ATTGA	2	10	347467	347476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022239	CTTTC	2	10	352144	352153	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_022239	AAAGG	2	10	352869	352878	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022239	ATTTT	2	10	356139	356148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022239	AATCG	2	10	356558	356567	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022239	GAAAT	2	10	357856	357865	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022239	TTTGT	2	10	358002	358011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022239	ACAAA	2	10	367608	367617	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022239	TACAA	2	10	368051	368060	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022239	TGTTT	2	10	368142	368151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022239	TAATA	2	10	387440	387449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022239	GGCTT	2	10	391711	391720	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022239	ATTTT	2	10	395545	395554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022239	CTATG	2	10	403273	403282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022239	TTTTA	2	10	424798	424807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022239	GAAAA	2	10	424836	424845	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022239	ATTAT	2	10	424923	424932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022239	TAAAT	2	10	431035	431044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022239	TTTAT	2	10	432104	432113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022239	ATATT	2	10	441304	441313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022239	TAAAT	2	10	444244	444253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022239	ATTAT	2	10	444653	444662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022239	AAAAT	2	10	446710	446719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022239	CTTTT	2	10	446819	446828	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_022239	TATCA	2	10	448331	448340	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022239	TTTGC	2	10	450339	450348	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022239	TTTAC	2	10	468944	468953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_022239	TATCT	2	10	470752	470761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022239	TATCT	2	10	471320	471329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022239	TAAAA	2	10	477250	477259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022239	GGAAA	2	10	481916	481925	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022239	CTTAT	2	10	483802	483811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022239	AAAAG	2	10	493422	493431	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022239	TGACT	2	10	493622	493631	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022239	CTATA	2	10	493686	493695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022239	AAAGG	2	10	505561	505570	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022239	GTTAT	2	10	515986	515995	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022239	GTTTG	2	10	516205	516214	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022239	TATAA	2	10	541964	541973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022239	ATAGC	2	10	547083	547092	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022239	AGAAA	2	10	549754	549763	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022239	GCTTT	2	10	553749	553758	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022239	TTAGA	2	10	561822	561831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022239	AGTCC	2	10	570635	570644	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_022239	GCTTG	2	10	575291	575300	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022239	AGTTT	2	10	575538	575547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022239	AAATC	2	10	577306	577315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022239	ATATA	2	10	579563	579572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022239	ATCTT	2	10	585756	585765	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022239	ATTAA	2	10	593912	593921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022239	TAAAA	2	10	604700	604709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022239	TTTAG	2	10	605149	605158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022239	CCTAC	2	10	612148	612157	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_022239	GCTCT	2	10	612988	612997	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_022239	TGCAA	2	10	614549	614558	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_022239	TGAAT	2	10	630589	630598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022239	TTCAT	2	10	635986	635995	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022239	GAATG	2	10	651415	651424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022239	ACTAA	2	10	659920	659929	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022239	GCTTG	2	10	674606	674615	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022239	ATTTT	2	10	675164	675173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022239	CTGTG	2	10	676057	676066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022239	ATATG	2	10	705001	705010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022239	GAATA	2	10	705147	705156	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022239	GTAAA	2	10	710849	710858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022239	TTCAT	2	10	714161	714170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022239	GGTAT	2	10	728702	728711	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022239	TAAAA	2	10	736474	736483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022239	AAAAT	2	10	751990	751999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022239	GGAAT	2	10	755543	755552	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022239	TAAAA	2	10	765359	765368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022239	TTTCA	2	10	778124	778133	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022239	ATTTC	2	10	788776	788785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022239	AAAAT	2	10	791397	791406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_022239	TCCTT	2	10	2188787	2188796	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
429	NC_022239	ATTTT	2	10	2194851	2194860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_022239	ATATT	2	10	2210394	2210403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_022239	TCTAT	2	10	2228424	2228433	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
432	NC_022239	TTCTA	2	10	2231433	2231442	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.