MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022226	TAAATA	2	12	3299	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022226	TTTAAA	2	12	3475	3486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022226	TAAATC	2	12	17177	17188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022226	AACAAA	2	12	70797	70808	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022226	AATATA	3	18	79248	79265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022226	CTGTAA	2	12	118180	118191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022226	TCCCAC	2	12	156555	156566	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_022226	ATTAAT	2	12	178431	178442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022226	CTTCAA	2	12	230360	230371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022226	GGAATA	2	12	240183	240194	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022226	ATATAG	2	12	262033	262044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022226	ATTTTC	2	12	267350	267361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022226	ATAATT	2	12	268298	268309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022226	AACGAT	2	12	275562	275573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022226	TAACTT	2	12	284483	284494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022226	TTCATT	2	12	346502	346513	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022226	TAATAT	2	12	360219	360230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022226	AATGTA	2	12	389754	389765	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022226	AATTTG	2	12	389861	389872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022226	ATTAAT	2	12	408281	408292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022226	ATATAA	2	12	413722	413733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022226	CTATAA	2	12	415226	415237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022226	TTTTTA	2	12	416507	416518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022226	TTGAAA	2	12	421194	421205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022226	TGTATA	2	12	435431	435442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022226	TTTTTA	2	12	447638	447649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022226	ACGTTG	2	12	473522	473533	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022226	AAAATA	2	12	474248	474259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022226	TATGGT	2	12	482386	482397	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022226	TTATAA	2	12	490797	490808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022226	AAATTT	2	12	497557	497568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022226	TTATAA	2	12	552708	552719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022226	GTTATA	2	12	553379	553390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022226	CTTAAA	2	12	561811	561822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022226	ACATGT	2	12	571785	571796	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022226	AATGAT	2	12	604936	604947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022226	TAGATG	2	12	605009	605020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022226	TAAAAT	2	12	621850	621861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022226	TTATTT	2	12	627968	627979	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022226	CATTAT	2	12	644284	644295	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022226	CATCAA	2	12	654682	654693	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022226	TAATTT	2	12	658922	658933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022226	ATAAAA	2	12	659829	659840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022226	TGAATA	2	12	675398	675409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022226	GGATTC	2	12	686750	686761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022226	AAATAT	2	12	689541	689552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022226	TTAAAA	2	12	701613	701624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022226	TAGTTA	2	12	706054	706065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022226	TTTTTA	2	12	724329	724340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022226	TGAAAA	2	12	732571	732582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022226	TTTTTA	2	12	775497	775508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022226	ACAAAA	2	12	801191	801202	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022226	TAAAAA	2	12	819198	819209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022226	TATCAA	2	12	825759	825770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022226	TTTTGA	2	12	829582	829593	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022226	TCATTT	2	12	835575	835586	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022226	AAATTA	2	12	845589	845600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022226	TAACTA	2	12	852040	852051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022226	AAGCAC	2	12	854325	854336	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022226	TTTTAA	2	12	867457	867468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022226	TTTAAT	2	12	937991	938002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022226	ACAATA	2	12	955389	955400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022226	TCAGTA	2	12	958315	958326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022226	AACGGA	2	12	972418	972429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022226	CTAAAT	2	12	991415	991426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022226	CATTTA	2	12	1000574	1000585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022226	ATCATA	2	12	1002469	1002480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022226	TCAAAA	2	12	1008977	1008988	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022226	ATTGCA	2	12	1010114	1010125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022226	AAATAA	2	12	1011148	1011159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022226	TTTTCT	2	12	1022703	1022714	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022226	TTTATA	2	12	1058551	1058562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022226	GAATTA	2	12	1065124	1065135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022226	ATTTTA	2	12	1065447	1065458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022226	ATTTTT	2	12	1082499	1082510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022226	ATAATT	2	12	1083296	1083307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022226	TCATTA	2	12	1088512	1088523	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022226	TAATGA	2	12	1096598	1096609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022226	ATATTT	2	12	1103926	1103937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022226	ATTTAT	2	12	1115382	1115393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022226	TTTTAC	2	12	1119450	1119461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022226	AAATTT	2	12	1122079	1122090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022226	AAGTAA	2	12	1143783	1143794	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022226	TCGTTT	2	12	1146910	1146921	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022226	TTAATT	2	12	1157626	1157637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022226	AATTAA	2	12	1160362	1160373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022226	GAAATT	2	12	1205335	1205346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022226	AATGAT	2	12	1218109	1218120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022226	TTTCAT	2	12	1248393	1248404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022226	TATATT	2	12	1253052	1253063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022226	CATATT	2	12	1278135	1278146	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022226	ATGTAT	2	12	1278755	1278766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022226	AAAGAA	2	12	1278989	1279000	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022226	TTAAAG	2	12	1282569	1282580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022226	TTAAAG	2	12	1284500	1284511	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022226	AGATAA	2	12	1285260	1285271	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022226	ATTAAA	2	12	1312552	1312563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022226	ATATAA	2	12	1320591	1320602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022226	AAAATA	2	12	1334659	1334670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022226	GTTTTA	2	12	1350406	1350417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022226	AAATAA	2	12	1379401	1379412	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022226	TTGATT	2	12	1388801	1388812	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022226	ATTCTA	2	12	1396142	1396153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022226	AATAAA	2	12	1398994	1399005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022226	TTTTTG	2	12	1423759	1423770	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022226	TTAGCA	2	12	1432691	1432702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022226	ACTGTT	2	12	1432943	1432954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022226	CCTGCT	2	12	1437620	1437631	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022226	TATTCT	2	12	1444485	1444496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022226	TACTTG	2	12	1454732	1454743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022226	AAAAAT	2	12	1454748	1454759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022226	TTAATC	2	12	1468255	1468266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022226	TATGAT	2	12	1507791	1507802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022226	AATAAA	2	12	1512906	1512917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022226	TAAAAA	2	12	1535173	1535184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022226	AATTTA	2	12	1552340	1552351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022226	AGCCAA	2	12	1580244	1580255	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022226	TTGACT	2	12	1580263	1580274	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022226	TTTAAC	2	12	1585146	1585157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022226	TTATAA	2	12	1587689	1587700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022226	ACCTTT	2	12	1597646	1597657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022226	TTTTAT	2	12	1600115	1600126	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022226	AGTTTT	2	12	1624351	1624362	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022226	AATTAA	2	12	1625596	1625607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022226	TAAAAC	2	12	1628736	1628747	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022226	TTAAAT	2	12	1636052	1636063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022226	AATTTA	2	12	1638542	1638553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022226	ATTTTC	2	12	1644577	1644588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022226	TTTCAT	2	12	1698245	1698256	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022226	TAATTA	2	12	1731573	1731584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022226	TATCAA	2	12	1735478	1735489	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022226	TAAAAA	2	12	1737678	1737689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022226	CTTTGT	2	12	1744649	1744660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_022226	TCAAAA	2	12	1756896	1756907	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022226	CATACA	2	12	1765019	1765030	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_022226	TACCAA	2	12	1829683	1829694	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_022226	AATTTA	2	12	1975276	1975287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022226	TTTAAA	2	12	1975647	1975658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022226	AATTTT	2	12	1977591	1977602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_022226	CCTATT	2	12	2036995	2037006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_022226	TAAAAA	2	12	2118604	2118615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022226	GAATGT	2	12	2155292	2155303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.