MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022226	TGAAC	2	10	6981	6990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022226	GTAGG	2	10	14414	14423	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022226	TCGAT	2	10	23826	23835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022226	ATATT	2	10	24363	24372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022226	TTTCA	2	10	34320	34329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022226	TAAAA	2	10	35773	35782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022226	AGATA	2	10	35931	35940	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022226	AAATG	2	10	46400	46409	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022226	TTTGT	2	10	49371	49380	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022226	TATAT	2	10	57788	57797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022226	ATTAT	2	10	57900	57909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022226	TTATA	2	10	58070	58079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022226	GTAAA	2	10	66001	66010	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022226	CAATT	2	10	67183	67192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022226	GTAAT	2	10	86676	86685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022226	CAAAA	2	10	154820	154829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022226	TAAAG	2	10	155169	155178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022226	TATCA	2	10	165139	165148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022226	ATCAT	2	10	173271	173280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022226	CAACT	2	10	185401	185410	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022226	GCTTT	2	10	189900	189909	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022226	TGATT	2	10	190246	190255	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022226	TAACA	2	10	196472	196481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022226	AATAT	2	10	215652	215661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022226	TATTT	2	10	221643	221652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022226	AACAT	2	10	229986	229995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022226	GATAA	2	10	233939	233948	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022226	ATAAC	2	10	238586	238595	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022226	TGAAT	2	10	238697	238706	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022226	ATTAA	2	10	238838	238847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022226	AAAGT	2	10	242582	242591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022226	TAAAA	2	10	244295	244304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022226	AAATT	2	10	245611	245620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022226	TAAAA	2	10	260380	260389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022226	TTTTA	2	10	267309	267318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022226	GAAAA	2	10	268170	268179	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022226	ATAAA	2	10	268287	268296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022226	TCATA	2	10	276643	276652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022226	ATTTA	2	10	293141	293150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022226	TTATT	2	10	309125	309134	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022226	GAAAT	2	10	313218	313227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022226	TAAAT	2	10	330179	330188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022226	AAATT	2	10	333872	333881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022226	ATTTT	2	10	335737	335746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022226	ATAGA	2	10	341977	341986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022226	TGACA	2	10	342169	342178	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022226	GATAA	2	10	354473	354482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022226	TATCA	2	10	369175	369184	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022226	ATTCT	2	10	386969	386978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022226	AGAAT	2	10	390541	390550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022226	TAAGG	2	10	390605	390614	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022226	TAAAT	2	10	399412	399421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022226	AGATA	2	10	399515	399524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022226	ACAGT	2	10	401986	401995	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022226	TTTAT	2	10	409601	409610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022226	TTGAT	2	10	409703	409712	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022226	TAAAA	2	10	414075	414084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022226	CAATT	2	10	417304	417313	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022226	CATAA	2	10	419060	419069	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022226	TAAAA	2	10	419284	419293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022226	AATAT	2	10	421431	421440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022226	TTTAT	2	10	432172	432181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022226	AAATT	2	10	435418	435427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022226	TAAAG	2	10	444784	444793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022226	CTCAC	2	10	446675	446684	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_022226	CAAAG	2	10	446700	446709	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022226	TTGTA	2	10	454652	454661	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022226	CTTAA	2	10	464413	464422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022226	TGGTG	2	10	482232	482241	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022226	CAACT	2	10	482803	482812	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_022226	GGTAA	2	10	483276	483285	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022226	TCGTG	2	10	484095	484104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022226	GATTT	2	10	488569	488578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022226	ATATA	2	10	490987	490996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022226	TTGAT	2	10	500697	500706	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022226	AGACA	2	10	514657	514666	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022226	AAGTA	2	10	517092	517101	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022226	TTAAA	2	10	519215	519224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022226	GATAA	2	10	519254	519263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022226	GGTAA	2	10	524783	524792	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022226	TCGTG	2	10	525602	525611	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022226	GATTG	2	10	527935	527944	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022226	ATATA	2	10	534546	534555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022226	AAAAT	2	10	539320	539329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022226	TTTAT	2	10	539429	539438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022226	TTATG	2	10	542435	542444	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022226	ATTTA	2	10	542580	542589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022226	ACAAT	2	10	544385	544394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_022226	TGAAT	2	10	548852	548861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022226	GTATA	2	10	548909	548918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022226	TATAA	2	10	552626	552635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022226	GTTTA	2	10	568796	568805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022226	TAAAG	2	10	572990	572999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022226	TTAAC	2	10	582045	582054	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022226	AATTT	2	10	582130	582139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022226	ATAAA	2	10	590368	590377	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022226	TTATA	2	10	604747	604756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022226	CACAT	2	10	605142	605151	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_022226	ATGAT	2	10	614165	614174	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022226	TAATT	2	10	619174	619183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022226	AAATT	2	10	630579	630588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022226	TAAAA	2	10	637714	637723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022226	TTATT	2	10	639951	639960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022226	CAATA	2	10	640017	640026	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022226	TTAAT	2	10	642642	642651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022226	ATTTT	2	10	644928	644937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022226	ATATA	2	10	644984	644993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022226	ATAAA	2	10	651620	651629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022226	TTTTA	2	10	653886	653895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022226	AAAGG	2	10	654207	654216	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022226	ATATA	2	10	657311	657320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022226	AAACT	2	10	660836	660845	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022226	TTCAC	2	10	666049	666058	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_022226	GGTTG	2	10	677030	677039	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022226	AAGTT	2	10	687188	687197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022226	AATTG	2	10	687220	687229	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022226	AAACT	2	10	689095	689104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022226	ATTTA	2	10	689485	689494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022226	AAAGT	2	10	691733	691742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022226	AATTT	2	10	694342	694351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022226	CATGA	2	10	696502	696511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022226	ATCAT	2	10	701093	701102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022226	AATTA	2	10	712793	712802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022226	ATTTA	2	10	716974	716983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022226	AAAGT	2	10	717067	717076	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022226	TAAAG	2	10	718902	718911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022226	ATTTT	2	10	729454	729463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022226	TAAGT	2	10	732476	732485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022226	TAAAA	2	10	735291	735300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022226	GAATA	2	10	735450	735459	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022226	AAAGT	2	10	738230	738239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022226	TAATA	2	10	751754	751763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022226	CATCC	2	10	754485	754494	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_022226	TTCGT	2	10	760618	760627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022226	ATATT	2	10	763731	763740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022226	ATTTA	2	10	767009	767018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022226	TTTTA	2	10	768563	768572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022226	AGTTA	2	10	768589	768598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022226	TCATG	2	10	768768	768777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022226	ATGAT	2	10	774089	774098	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022226	ATAAA	2	10	775360	775369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022226	ATGAC	2	10	776203	776212	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022226	GTTAA	2	10	780048	780057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022226	TATAA	2	10	780109	780118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022226	TTTTA	2	10	782908	782917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022226	TTGAA	2	10	783132	783141	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022226	CAAGA	2	10	785531	785540	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022226	GATTT	2	10	786673	786682	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_022226	TGATA	2	10	792238	792247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022226	TTAAA	2	10	797100	797109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_022226	GTATT	2	10	831923	831932	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_022226	ATTTA	2	10	921010	921019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022226	TATAA	2	10	921751	921760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_022226	ATTTA	2	10	958769	958778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_022226	ATAGA	2	10	1279580	1279589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_022226	GTTAG	2	10	1279972	1279981	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_022226	TTGTA	2	10	1330207	1330216	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_022226	ATTTT	2	10	2259031	2259040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_022226	TTTGA	2	10	2291967	2291976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

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