MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 1679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022226	CACT	2	8	149	156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022226	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022226	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022226	ATTA	2	8	3323	3330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022226	AAAT	2	8	3380	3387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022226	AATT	2	8	3579	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022226	CTAC	2	8	12583	12590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022226	ACGT	2	8	12746	12753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022226	TAAA	2	8	14551	14558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022226	ATCT	2	8	24145	24152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022226	GCCT	2	8	24273	24280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022226	ATTT	2	8	24605	24612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022226	ATCA	2	8	30947	30954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022226	TTCT	2	8	34399	34406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022226	ATAA	2	8	34437	34444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022226	TAAA	2	8	35814	35821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022226	TAAT	2	8	40675	40682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022226	TCCC	2	8	50245	50252	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_022226	ACAA	2	8	50849	50856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022226	TTAT	3	12	50915	50926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022226	TGAT	2	8	54297	54304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022226	TAAA	2	8	56702	56709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022226	CATT	2	8	57981	57988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022226	AAGA	2	8	60287	60294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022226	CTAT	2	8	67826	67833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022226	AGCT	2	8	69447	69454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022226	TAAT	2	8	69521	69528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022226	AGAA	2	8	69612	69619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022226	TTGT	2	8	70731	70738	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022226	ATAA	2	8	76520	76527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022226	TTAT	2	8	79311	79318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022226	ATAA	2	8	80216	80223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022226	CAAT	2	8	82088	82095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022226	ATAA	2	8	87265	87272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022226	TATT	2	8	87303	87310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022226	AGTA	2	8	89245	89252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022226	TTGT	2	8	89388	89395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022226	AAAT	2	8	91037	91044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022226	ATTG	2	8	92283	92290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022226	GTTA	2	8	92405	92412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022226	TAAA	2	8	107050	107057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022226	TAAA	2	8	107088	107095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022226	TAAA	2	8	107545	107552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022226	ATAA	2	8	109195	109202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022226	AAAT	2	8	115354	115361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022226	ATTA	2	8	115388	115395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022226	ATTA	2	8	116227	116234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022226	TAAA	2	8	116251	116258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022226	GAGC	2	8	117165	117172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022226	TGAA	2	8	117228	117235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022226	ATAG	2	8	118139	118146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022226	TAAA	2	8	120416	120423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022226	CTTT	2	8	124849	124856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022226	CTTT	2	8	126125	126132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022226	ATTT	2	8	126212	126219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022226	AAGA	2	8	127798	127805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022226	ACTT	2	8	129383	129390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022226	AAAT	2	8	131291	131298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022226	AAAT	2	8	131449	131456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022226	CCAA	2	8	131551	131558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022226	GTAA	2	8	131630	131637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022226	GAAA	2	8	131724	131731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022226	AAGG	2	8	132139	132146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022226	ATTT	2	8	132383	132390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022226	TATT	2	8	135227	135234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022226	TAAT	2	8	135389	135396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022226	TAAA	2	8	149514	149521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022226	AATA	2	8	154738	154745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022226	ATTA	2	8	154970	154977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022226	GTTT	2	8	155018	155025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022226	TAAC	2	8	155118	155125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022226	AAAT	2	8	156526	156533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022226	GTTT	2	8	156567	156574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022226	TTTA	2	8	156806	156813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022226	TCAT	2	8	163305	163312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022226	TTTG	2	8	163389	163396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022226	ATTT	2	8	164755	164762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022226	ATTT	2	8	164767	164774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022226	ATGT	2	8	164998	165005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022226	TTAA	2	8	165119	165126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022226	AGTA	2	8	165161	165168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022226	AAGT	2	8	173166	173173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022226	ATCA	2	8	173305	173312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_022226	TAAA	2	8	174030	174037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022226	ATGT	2	8	178565	178572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022226	TTAA	2	8	180045	180052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022226	AATA	2	8	180095	180102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022226	GAAT	2	8	180124	180131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022226	TGTA	2	8	184883	184890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022226	CTTA	2	8	184972	184979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022226	TAAT	2	8	184998	185005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022226	TTTG	2	8	185088	185095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022226	AAAG	2	8	185269	185276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022226	AGTT	2	8	189755	189762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022226	GTTA	2	8	193264	193271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022226	ATGT	2	8	193387	193394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022226	ATAA	2	8	196312	196319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022226	TAGT	2	8	196450	196457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022226	ATTT	2	8	196498	196505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022226	TAGT	2	8	204754	204761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022226	ATGA	2	8	204797	204804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022226	TTGT	2	8	215477	215484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022226	TATT	2	8	216309	216316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022226	TTTG	2	8	221597	221604	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022226	ACAT	2	8	221923	221930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022226	AAAG	2	8	225094	225101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022226	TTCA	2	8	230393	230400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022226	ATTA	2	8	233987	233994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022226	AATT	2	8	242013	242020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022226	AAAT	2	8	242041	242048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022226	AAAT	2	8	242523	242530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022226	AATT	2	8	244015	244022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022226	ATAA	2	8	244036	244043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022226	ATTT	2	8	244143	244150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022226	AAAT	2	8	244309	244316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022226	AAAT	2	8	244367	244374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022226	AGGT	2	8	247523	247530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022226	ATAA	2	8	247641	247648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022226	TTAA	2	8	248637	248644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022226	ATGT	2	8	248740	248747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022226	AGGG	2	8	252029	252036	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022226	TCAA	2	8	260339	260346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022226	AATC	2	8	260391	260398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022226	ATTA	2	8	261817	261824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022226	GTAA	2	8	272984	272991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022226	ACTA	2	8	275487	275494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022226	ATGC	2	8	278982	278989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022226	TAAT	2	8	280166	280173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022226	TTAA	2	8	280481	280488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022226	TCAC	2	8	283035	283042	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022226	GAAT	2	8	283086	283093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022226	AATT	2	8	283097	283104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022226	GATG	2	8	284222	284229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022226	ATTT	2	8	290083	290090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022226	TTAA	2	8	293188	293195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022226	TTTA	2	8	309216	309223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022226	TTAT	2	8	312864	312871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022226	TTTA	2	8	312931	312938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022226	TAAA	2	8	312996	313003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022226	ATTT	2	8	316496	316503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022226	GTAA	2	8	316556	316563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022226	AACC	2	8	317768	317775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022226	TAAT	2	8	317885	317892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022226	TAAA	2	8	318067	318074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022226	TAAT	2	8	318221	318228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022226	CTTT	2	8	318747	318754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_022226	TAAA	2	8	319326	319333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022226	AATT	2	8	320401	320408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022226	ATTT	2	8	320456	320463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022226	TAAT	2	8	320469	320476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022226	AGAC	2	8	320477	320484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_022226	AAGT	2	8	322063	322070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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